AMINOACIDI Struttura Funzione Classificazione Proprietà 1 STRUTTURA Composti caratterizzati dalla presenza di un gruppo aminico (NH2) e di un gruppo acido (COOH) legati al medesimo carbonio (C). In soluzione acquosa il gruppo acido è dissociato (COO-) ed il gruppo aminico è protonato (NH3+). 2 FUNZIONI !!Gli aminoacidi (aa) sono i costituenti delle proteine. Sono 20 gli aa che costituiscono le proteine ma esistono aa liberi che non partecipano alla formazione delle proteine. !!Precursori di ormoni (Tirosina => ormoni tiroidei). !!Precursori di catecolammine (Tirosina => dopamina, adrenalina noradrenalina). !!Neurotrasmettitori (Glutammato) e precursori di neurotrasmettitori (Triptofano => serotonina). 3 Al carbonio tetraedrico C-! sono legati: !!il gruppo amminico !!il gruppo carbossilico !!un H (ad eccezione della prolina). Ogni aminoacido è caratterizzato da una catena laterale (R) anch’essa legata al C-!. Peso molecolare medio: 110 Daltons. Gli aminoacidi che costituiscono le proteine sono classificati, sulla base della catena laterale in: !!ALIFATICI NON POLARI !!AROMATICI !!POLARI NON CARICHI !!CARICHI POSITIVAMENTE !!CARICHI NEGATIVAMENTE 4 5 6 7 ALIFATICI NON POLARI Catene laterali alifatiche non polari. Generalmente localizzati nella parte interna delle proteine. 8 AROMATICI Catene laterali aromatiche, ingombranti Solo la Phe è completamente non polare Generalmente localizzati nella parte interna delle proteine. La Tyr può essere fosforilata sull’ossidrile. 9 POLARI NON CARICHI Catene laterali alifatiche con gruppi polari non-ionizzabili. La Ser e la Thr possono essere fosforilate sull’ossidrile. La Asn e la Gln hanno gruppi ammidici spesso occupati in ponti idrogeno. La Cys (e la Met) contengono zolfo. La Cys può formare ponti disolfuro (legame covalente) con un’altra Cys. Cys e Ser spesso fanno parte dei siti catalitici di molti enzimi. 10 CARICHI POSITIVAMENTE O BASICI Catene laterali con carica positiva. La His spesso fa parte del sito catalitico degli enzimi. Generalmente localizzati nella parte esterna delle proteine. 11 CARICHI NEGATIVAMENTE O ACIDI Catene laterali cariche negativamente. Spesso fanno parte del sito catalitico degli enzimi. Generalmente localizzati nella parte esterna delle proteine 12 13 Alcuni aminoacidi modificati 14 Fosforilazione degli aminoacidi 15 Ossidazione delle cisteine: ponti disolfuro 16 Alcune molecole derivanti da aminoacidi 17 18 19 20 Gli ormoni tiroidei 21 22 Sintesi delle melanine 23 PROPRIETA’ FISICHE Il C-! è detto chirale dal momento che porta quattro diversi sostituenti (esclusa la Glicina). Gli aa ruotano il piano della luce polarizzata verso destra (destrogiri o R) oppure verso sinistra (levogiri o L). Gli aa che compongono le proteine sono tutti L-!-aa. I gruppi aromatici delle catene laterali degli aa assorbono luce a 280 nm. Hanno elevata costante dielettrica. Hanno un elevato punto di fusione (> 200°C). 24 25 PROPRIETA’ CHIMICHE Gli aa sono solubili in acqua e insolubili in solventi apolari. In ambiente acquoso il gruppo COOH si dissocia in COO- + H+ In ambiente acquoso il gruppo NH2 si protona a NH3+: COOH " COO- + H+ NH2 + H+ " NH3+ Il gruppo amminico aumenta l’acidità del gruppo carbossilico (da pKa = 4.7 a pKa = 2.0-2.2). Il gruppo carbossilico aumenta l’acidità del gruppo amminico (da pKa = 10.6 a pKa = 9.2-9.6). Gli aa sono quindi degli zwitterioni, con carica netta = 0 a pH=7.0 26 27 28 PROPRIETA’ ACIDO-BASE Equazione di Henderson-Hasselbalch: pH = pKa + log [accettore di protoni]/[donatore di protoni] La carica di un aa varia la variare del pH della soluzione. Il pH al quale la carica netta è zero è detto Punto isoelettrico (pI) Titolazione di un aa. 29 30 31 Gli aa cairchi negativamente o positivamente possiedo un ulteriore gruppo carbossilico o amminico che contribuisce alla carica netta dell’aminoacido. 32 33 Gli aa che compongono le proteine sono classificati anche in: ESSENZIALI: Triptofano Lisina Metionina Fenilalanina Treonina Valina Leucina Isoleucina. NON ESSENZIALI: Arginina Tirosina Glicina Serina Acido glutammico Acido aspartico Cisteina Istidina, Prolina Alanina. 34 35 Il legame peptidico 36 37