amminoacidi e proteine
ione dipolare
zwitterione
proteine………polipeptidi
Struttura
collagene, cheratina in pelle, ossa, capelli etc
Catalisi
enzimi
Movimento
miosina e actina nelle fibre muscolari
Trasporto
emoglobina
Ormoni
insulina, ormone della crescita
Regolazione di funzioni biologiche sintesi di proteine
Materiali
tela del ragno, seta
pKa della catena laterale, pK a_2
pKa_2
pKa_2
3.86
12.48
4.07
13
10.07
6.00
10.53
Strutturia primaria di polipeptidi e proteine:
sequenza degli amminoacidi nella catena polipeptidica
oligopeptide
titolazione di un amminoacido
Titolazione acido base: HCl (?) + NaOH (titolo noto)
Elettroforesi
Tecnica di separazione degli amminoacidi
a pH = 6.02
legame peptidico
Linus Pauling, 1930
tripeptide
Strutturia primaria di polipeptidi e proteine:
sequenza degli amminoacidi nella catena polipeptidica
oligopeptide
Tecniche di degradazione delle proteine
Tecniche di degradazione delle proteine
degradazione di Edman
cromatografia a scambio ionico
struttura secondaria:
arrangiamento degli amminoacidi vicini
uno rispetto all’altro (conformazioni)
legame idrogeno
-C=O………....H-N-
a-elica
3.6 amminoacidi per giro
legame H ogni quattro AA
struttura secondaria:
conformazione b a foglietto
catene In direzioni opposte – antiparallele
legami H intercatena
legame peptidico trans – come in a-elica
gruppi R sopra e sotto il piano
struttura terziaria:
sistemazione tridimensionale di tutti gli
atomi della catena
legami disolfuro, legami idrogeno, interazioni idrofobiche
e ponti salini
Natura dei legami e interazioni intracatena che promuovono la
struttura terziaria:
legami disolfuro, legami idrogeno, interazioni idrofobiche e ponti salini
Mioglobina: otto sezioni ad a-elica,
la più lunga 24 aa, la più corta 7 aa
gruppo eme
modello a nastro della mioglobina
struttura quaternaria:
formazione di aggregati tra catene polipeptidiche
alcune proteine sono formate
da più catene polipeptidiche
unite da legami non covalenti
modello a nastro della emoglobina:
catene a in porpora: 2 di 141 aa
catene b in giallo: 2 di 146 aa
titolazione di un amminoacido
