Corso di Dottorato in BIOSCIENZE Coordinatore Prof.ssa Carla Voltattorni Dipartimento Proponente Scienze Morfologiche – Biomediche Altri dipartimenti aderenti Obiettivi formativi Materno-Infantile e di Biologia-Genetica Medicina e Sanità Pubblica BIOCHIMICA: L’obiettivo è la preparazione allo studio e alla ricerca nel campo delle bioscienze. Il programma didattico prevede la partecipazione ad una serie di seminari e/o lezioni teorico-pratiche svolti da qualificati ricercatori italiani e stranieri su argomenti di biochimica e biologia molecolare, la partecipazione alla riunione annuale dei dottorandi in discipline biochimiche. Le metodologie che i dottorandi potranno apprendere sono: tecniche di purificazione delle proteine, caratterizzazione di proteine mediante spettroscopia di assorbimento, fluorescenza e dicroismo circolare, modificazione chimica delle proteine, proteolisi limitata, separazione di peptici, clonaggio ed espressione di proteine, mutagenesi sitospecifica, saggi di attività enzimatica, cinetiche di reazione e di in attivazione, tecniche di estrazione di DNA e RNA, colture cellulari, Nortern blot, ELISA, trasfezione in cellule eucaristiche, EMSA, Western bolt, DNase hypersensitivity, RT-PCR, analisi dello stato acetilazione degli sitoni, analisi delle interazioni DNA-proteine mediante immunoprecipitazione della cromatina. Esperienze esterne al Dottorato: si prevede l’apprendimento di metodologie per lo studio della struttura primaria di proteine, l’acquisizione di rudimenti di metodi cristallografici, di eventuali specifiche e sofisticate tecniche di studio di proteine (cinetiche rapide mediante “stopped-flow” o “rapid cannino” spettroscopia, effetti di scambio isotopico, ecc) e di acidi nucleici, la conoscenza di teoria e metodi d’indagine nel campo dell’evoluzione e della modellistica molecolare. GENOMICA: Gli obiettivi formativi del dottorato prevedono l’esplorazione delle possibilità offerte dall’approccio genomico allo sviluppo di tecniche cellulari, molecolari e statistiche volte al miglioramento della salute umana. Articolato in modo multidisciplinare per il conseguimento dei seguenti obiettivi: acquisizione di modelli sperimentali per l’analisi gnomica dell’interazione virus/cellula; sviluppo di un vaccino contro l’AIDS: obiettivo centrato sullo studio dell’espressione genica negli eucarioti e sull’ottenimento di anticorpi specifici contro proteine virali di interesse terapeutico e di marcatori diagnostici; basi molecolari di malattie genetiche: messa a punti di test genetici: obiettivo principale è l’identificazione delle varianti geniche, della frequenza nella popolazione e di marcatori polimorfici per una medicina predittiva; modelli di epidemiologia gnomica: obiettivo di questa tematica è l’acquisizione delle tecniche statistiche per l’analisi di dei dati sperimentali nel campo dell’epidemiologia gnomica. PhD Course in BIOSCIENCE Directed by Prof.ssa Carla Voltattorni Department of Reference Morphological – Biomedical Sciences Partner Departments Maternal-Infant and of Biology and Genetics Medicine and Public Health Educational Objectives BIOCHEMISTRY: The aim is to prepare the students for studying and researching into the field of bioscience. The teaching program provides their participation in a number of seminars and/or theoretic-practical lessons held by expert Italian and foreign researchers into biochemistry and molecular biology; attendance at the yearly meeting of undergraduates in biochemical topics. The methods the undergraduates can learn are: protein purification techniques, protein characterisation using spectroscopes of absorption, fluorescence and circular dichroism, chemical modification of proteins, limited proteolysis, peptic separation, protein cloning and expression, specific site mutagenisis, enzyme activity tests, reaction and activation kynetics, DNA and RNA extraction techniques, cellular cultures, Northern blot, ELISA, transfection in eucariotic cells, EMSA, Western bolt, DNase hypersensitivity, RT-PCR, site acetylation status analysis, analysis of DNA-protein interaction through chromatin immuno-precipitation. Experience outside the master: learning methods for studying protein primary structures, acquiring the basic notions of crystallography methods, possible specifications and sophisticated protein study techniques (rapid kinetics through "stopped-flow" or "rapid scanning" spectroscopy, effects of isotope exchange, etc.) and of nucleic acids, learning theories and investigation methods into the evolution and model forming of molecules. GENOMICS: the training objectives provide exploring possibilities offered by a genomic approach to developing cellular, molecular and statistics techniques addressed to improving human health. Divided in several disciplines to pursue the following aims: acquiring experimental models for genomic analysis of virus/cell interaction and developing an anti-AIDS vaccine: the objective focuses on studying gene expression in eukaryotes and obtaining specific therapeutic antibodies against viral proteins and diagnostic markers; molecular basis of genetic diseases: setting genetic tests; the main objective is to identify gene variations and their frequencies in the population and polymorphic markers for predictive medicine; genomic epidemiology models: the objective of this topic is to acquire the statistical techniques for analysing experimental data in the field of genomic epidemiology.