Esame di Profitto in Chimica Biologica

Esame di Profitto in Biochimica
Sessione estiva
Corsi D.L. in Farmacia (FA033) Chimica e Tecnologia Farmaceutiche (FA040)
Giovedì 10 luglio 2008
Nome: ____________ ___________
1) Segnate il quadro o i quadri corrispondenti alla risposta corretta. NON motivate la scelta
A – Ordinate i seguenti amminoacidi secondo la loro grandezza (1 più piccolo – 4 più grande)




His
Val
Gly
Trp
B - Assegnate la caratteristica più corretta alle seguenti proteine ( 1 = globulare; 2 = filamentosa; 3
= multi-dominio; 4 = transmembrana:


Esochinasi
Collagene


Glucosio-6-P-difosfatasi
RNAsi
C – Quale tecnica è più idonea ad identificare una proteina in una miscela complessa?
 - Southern blot
 - Northern blot
 - Western blot
 - Cromatografia a fase inversa
D - Quale delle seguenti mutazioni è meno probabile impedisca il corretto ripiegamento di una
proteina?




Sostituzione di un residuo di glicina con glutammina
Sostituzione di un residuo di leucina con isoleucina
Sostituzione di un residuo di leucina con arginina
Sostituzione di un residuo do alanina con triptofano
E - La proteine G, nella trasduzione del segnale, serve per attivare:




un canale per il calcio, quando lega GTP
una tirosina chinasi associata alla membrana, quando lega GTP
proteina chinasi A citosolica, quando lega GDP
fosfolipasi C associate alla membrana, quando lega GTP
F - Quali dei metodi è il più utile per determinare il residuo N-terminale di una proteina ?




trattamento con tripsina
trattamento con carbossipeptidasi
trattamento con fenilisotiocianato (PITC) seguit da idrolisi acida
idrolisi acida in HCl 6N a 100C
G - Il coenzima A partecipa in reazioni di:




racemizzazione
carbossilazione
decarbossilazione
trasferimento di gruppi acile
H


Quale delle seguenti affermazioni riguarda le -immunoglubuline G
delle quattro catene solo quelle pesanti presentano un dominio C-terminale costante.
delle quattro catene solo quelle leggere presentano un dominio C-terminale costante.
delle quattro catene solo quelle pesanti presentano domini N-terminali variabile che servono
per riconoscere l’antigene.
delle quattro catene sia quelle leggere che pesanti presentano domini N-terminali variabile
che servono per riconoscere l’antigene.

I -
Il dicroismo circolare è particolarmente utile nel studiare:




la composizione di proteine
la struttura secondaria di proteine in soluzione.
la struttura tridimensionale di proteine.
i processi di ripiegamento delle proteine
L-
Le peptidilprolil isomerasi:


catalizzano l’idrossilazione di prolina nel collagene
aiutano il ripiegamento delle proteine impedendo interazioni indesiderabili con altre catene
proteiche
aiutano il ripiegamento delle proteine catalizzando l'interconversione delle configurazioni cis
e trans nel legame peptidico a livello di una prolina
permettono il corretto ripiegamento delle proteine anche quando residui di prolina sono
presenti in segmenti ad -elica


2) Fornite le strutture chimiche di A) ribosio-5-fosfato; B) metionina; C) cAMP
Identificate i seguenti composti:
D)
E)
R’, R” = catene idrocarburiche
Indicate a quali classi di composti fanno parte tutte queste molecole
3) L’acetil coenzima A rappresenta un intermedio metabolico molto importante utilizzato in varie
vie metaboliche - commentate.
4) Descrivete il meccanismo d’azione della ribonucleasi A
5) Un enzima segue la cinetica Michaelis-Menten.
in assenza di inibitore, ha una KM di 0.4 µM ed una velocità massima (Vmax) di 25 µM/s, e catalizza
una reazione con velocità iniziale (vo) di 8,4 µM/s in presenza di 0.2 µM substrato [S].
In presenza di un inibitore, la KM diventa 1.2 µM, mentre la Vmax è invariata e la velocità iniziale
(vo’) in presenza di 0.2 µM substrato [S] si riduce a 3,5 µM/s.
a) Con questi dati, tracciate il grafico di Lineweaver-Burk e quindi stimate la velocità iniziale con e
senza inibitore, in presenza di 1 M substrato.
b) di che tipo di inibitore si tratta?
c) a 0,2 M di substrato, l’inibitore è presente ad una concentrazione superiore o inferiore alla IC50?