Determinazione geni codificanti SE: risultati del ring trial
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IZSTO Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d’Aosta VI WORKSHOP DEL LABORATORIO NAZIONALE DI RIFERIMENTO (NRL) PER GLI STAFILOCOCCHI COAGULASI POSITIVI COMPRESO S.AUREUS 12 / 13 Dicembre 2013 Determinazione geni codificanti SE: risultati del ring trial Daniela Manila Bianchi IZSTO VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO IZS-VE IZS-VE Distribuzione DistribuzionePOS POS 3/10/2011 3/10/2011 IZS-LER IZS-LER IZS-PLVA IZS-PLVA POS-10CA065 POS-10CA065 multiplex multiplexpcr pcrper perlala rilevazione di geni rilevazione di geni codificanti codificantiper per enterotossine enterotossine stafilococciche stafilococciche (da (dasea seaaasee seeeeser) ser) IZS-UM IZS-UM IZS-AM IZS-AM IZS-LT IZS-LT IZS-ME IZS-ME IZS-PB IZS-PB POS-10CA068 POS-10CA068 multiplex multiplexpcr pcrper perlala rilevazione rilevazionedidigeni geni codificanti per codificanti per enterotossine enterotossine stafilococciche stafilococciche (da (daseg segaasej sejeesep) sep) IZS-SAR IZS-SAR IZS-SIC IZS-SIC VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO IZS-VE IZS-VE Accreditate Accreditate IZS-LER IZS-LER IZS-PLVA IZS-PLVA IZS-UM IZS-UM IZS-AM IZS-AM IZS-LT IZS-LT IZS-ME IZS-ME IZS-PB IZS-PB IZS-SAR IZS-SAR IZS-SIC IZS-SIC VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO IZS-VE IZS-VE Training Training Session Session IZS-LER IZS-LER IZS-PLVA IZS-PLVA determinazione determinazionedei deigeni geni codificanti enterotossine codificanti enterotossine stafilococciche stafilococcichemediante mediante mPCR mPCR IZS-UM IZS-UM IZS-AM IZS-AM IZS-LT IZS-LT IZS-ME IZS-ME 24 24luglio luglio2012 2012 IZS-PB IZS-PB IZSPLVA-IZSSAR IZSPLVA-IZSSAR 18 18settembre settembre2012 2012 IZS-SAR IZS-SAR IZSLER-IZSLT IZSLER-IZSLT 33ottobre ottobre2012 2012 IZSLER-IZSAM IZSLER-IZSAM IZS-SIC IZS-SIC VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO Week Week50 50--2012 2012 SEs SEs--PT PTtrial trialSet-up Set-up RIAL T T P G SEs S ENE Invio settimana 7 – 2013 (12 Febbraio) Deadline risultati settimana 10 – 2013 (Marzo 2013) VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO “Detection of genes encoding staphylococcal enterotoxins Multiplex PCR for sea to see and ser” - Method of the CRL for Coagulase Positive Staphylococci, including Staphylococcus aureus Version 1, October 2009 – PROVE DA EFFETTUARE Multiplex PCR per la rilevazione di geni codificanti per enterotossine stafilococciche (da sea a see e ser), distribuita da NRL. “Detection of genes encoding staphylococcal enterotoxins Multiplex PCR for seg to sej and sep” - Method of the CRL for Coagulase Positive Staphylococci, including Staphylococcus aureus Version 1, October 2009 – Multiplex PCR per la rilevazione di geni codificanti per enterotossine stafilococciche (da seg a sej e sep), distribuita da NRL. NUMERO CAMPIONI CONSEGNATI FORMATO DEL CAMPIONE MODALITA’ DI CONSERVAZIONE DEAD-LINE INVIO ESITI A NRL R T 1 R T 2 R T 3 R T 4 R T 5 R T 6 R T 7 7+4 C + 1 C + 2 C + 3 C + 4 Provette tipo Cryobank contenenti coltura batterica Temperatura inferiore a -20°C 08/03/2013 VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO ID CAMPIONE Profilo geni tossine RT1 sei seg RT2 seb RT3 sea sed ser sej RT4 negativo Sequenza 1 Sequenza 2 Sequenza 3 Sequenza 4 RT5 sep sei seg sei seg sec sei seg see sep sei seg RT6 see seb sei seg sec sei seg see RT7 sec sei seg sea sed ser sej seb sei seg sec sei seg negativo sea sed ser sej seb sei seg sep sei seg negativo sea sed ser sej seb see sep sei seg negativo sea sed ser sej sec sei seg see sep sei seg Negativo Lab 12-23-18 Lab 2 Lab 15-20 Lab 17-19 Composizione Composizionesequenze sequenze VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO Risultati1/3 Risultati1/3 L12 L14 L15 L17 L18 L19 L20 L23 seg sei RT1 C C C C C NC C C seb RT2 C C C C C C C C sea sed sej ser RT3 C C C C C NC C C Negativo RT4 C C C C C C NC C seg sei sep RT5 NC C C C C NC NC C see RT6 C C C C C C NC C sec seg sei RT7 NC C C C C C C C VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO Risultati Risultati2/3 2/3 Ceppo RT1 lab seg sei Cep po Ceppo RT3 RT2 seb sea sed sej Ceppo RT4 ser Neg Ceppo RT5 seg sei Ceppo RT6 sep see Ceppo RT7 sec seg sei 12 14 15 17 18 19 20 sed sed sed 23 Risultato corretto Gene presente non rilevato Gene assente ma rilevato IZSTO Risultati Risultati3/3 3/3 lab sea seb sec sed see seg sei sej sep ser N 12 + + + + + -- +++ + + + + 14 + + + + + ++ +++ + + + + 15 + + + + + ++ +++ + + + + 17 + + + + + ++ +++ + + + + 18 + + + + + ++ +++ + + + + 19 + + + + + ++ +++ + - - + 20 + + + + + ++ +++ + + + - 23 + + + + + ++ +++ + + + + VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO FOLLOW UP 3 laboratori partecipanti Sequenze differenti a seconda dell’errore riscontrato Laboratorio 12 ID Risultato atteso Risultato ottenuto Esito 1 sep/sei/seg sep/sei/seg CONFORME 2 sec/sei/seg sec/sei/seg CONFORME ID Risultato atteso Risultato ottenuto Esito 3 negativo negativo CONFORME 1 sep/sei/seg sep/sei/seg CONFORME 4 negativo negativo CONFORME 2 sei/seg seg NON CONFORME 5 negativo negativo CONFORME 3 sea/sed/ser/sej sea/sed/ser/sej CONFORME 4 negativo negativo CONFORME 5 negativo negativo CONFORME Laboratorio 19 Laboratorio 20 ID Risultato atteso Risultato ottenuto Esito 1 sep/sei/seg see NON CONFORME 2 sec/sei/seg sed/seg/sep/sei NON CONFORME 3 negativo sed NON CONFORME 4 negativo sed NON CONFORME 5 negativo sed NON CONFORME VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013 IZSTO Grazie Grazieper perl’attenzione l’attenzione VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013
