IZSTO
Istituto Zooprofilattico
Sperimentale del Piemonte,
Liguria e Valle d’Aosta
VI WORKSHOP DEL LABORATORIO NAZIONALE DI RIFERIMENTO (NRL) PER GLI STAFILOCOCCHI
COAGULASI POSITIVI COMPRESO S.AUREUS
12 / 13 Dicembre 2013
Determinazione geni codificanti SE:
risultati del ring trial
Daniela Manila Bianchi
IZSTO
VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013
IZSTO
IZS-VE
IZS-VE
Distribuzione
DistribuzionePOS
POS
3/10/2011
3/10/2011
IZS-LER
IZS-LER
IZS-PLVA
IZS-PLVA
POS-10CA065
POS-10CA065
multiplex
multiplexpcr
pcrper
perlala
rilevazione
di
geni
rilevazione di geni
codificanti
codificantiper
per
enterotossine
enterotossine
stafilococciche
stafilococciche
(da
(dasea
seaaasee
seeeeser)
ser)
IZS-UM
IZS-UM
IZS-AM
IZS-AM
IZS-LT
IZS-LT
IZS-ME
IZS-ME
IZS-PB
IZS-PB
POS-10CA068
POS-10CA068
multiplex
multiplexpcr
pcrper
perlala
rilevazione
rilevazionedidigeni
geni
codificanti
per
codificanti per
enterotossine
enterotossine
stafilococciche
stafilococciche
(da
(daseg
segaasej
sejeesep)
sep)
IZS-SAR
IZS-SAR
IZS-SIC
IZS-SIC
VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013
IZSTO
IZS-VE
IZS-VE
Accreditate
Accreditate
IZS-LER
IZS-LER
IZS-PLVA
IZS-PLVA
IZS-UM
IZS-UM
IZS-AM
IZS-AM
IZS-LT
IZS-LT
IZS-ME
IZS-ME
IZS-PB
IZS-PB
IZS-SAR
IZS-SAR
IZS-SIC
IZS-SIC
VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013
IZSTO
IZS-VE
IZS-VE
Training
Training
Session
Session
IZS-LER
IZS-LER
IZS-PLVA
IZS-PLVA
determinazione
determinazionedei
deigeni
geni
codificanti
enterotossine
codificanti enterotossine
stafilococciche
stafilococcichemediante
mediante
mPCR
mPCR
IZS-UM
IZS-UM
IZS-AM
IZS-AM
IZS-LT
IZS-LT
IZS-ME
IZS-ME
24
24luglio
luglio2012
2012
IZS-PB
IZS-PB
IZSPLVA-IZSSAR
IZSPLVA-IZSSAR
18
18settembre
settembre2012
2012
IZS-SAR
IZS-SAR
IZSLER-IZSLT
IZSLER-IZSLT
33ottobre
ottobre2012
2012
IZSLER-IZSAM
IZSLER-IZSAM
IZS-SIC
IZS-SIC
VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013
IZSTO
Week
Week50
50--2012
2012
SEs
SEs--PT
PTtrial
trialSet-up
Set-up
RIAL
T
T
P
G
SEs
S
ENE
Invio
settimana 7 – 2013 (12 Febbraio)
Deadline risultati
settimana 10 – 2013 (Marzo 2013)
VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013
IZSTO
VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013
IZSTO
“Detection of genes encoding staphylococcal enterotoxins
Multiplex PCR for sea to see and ser” - Method of the CRL for
Coagulase Positive Staphylococci, including Staphylococcus
aureus Version 1, October 2009
–
PROVE DA
EFFETTUARE
Multiplex PCR per la rilevazione di geni codificanti per enterotossine
stafilococciche (da sea a see e ser), distribuita da NRL.
“Detection of genes encoding staphylococcal enterotoxins
Multiplex PCR for seg to sej and sep” - Method of the CRL for
Coagulase Positive Staphylococci, including Staphylococcus
aureus Version 1, October 2009
–
Multiplex PCR per la rilevazione di geni codificanti per enterotossine
stafilococciche (da seg a sej e sep), distribuita da NRL.
NUMERO
CAMPIONI
CONSEGNATI
FORMATO DEL
CAMPIONE
MODALITA’ DI
CONSERVAZIONE
DEAD-LINE INVIO
ESITI A NRL
R
T
1
R
T
2
R
T
3
R
T
4
R
T
5
R
T
6
R
T
7
7+4
C
+
1
C
+
2
C
+
3
C
+
4
Provette tipo Cryobank contenenti coltura batterica
Temperatura inferiore a -20°C
08/03/2013
VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013
IZSTO
ID
CAMPIONE
Profilo geni
tossine
RT1
sei seg
RT2
seb
RT3
sea sed ser sej
RT4
negativo
Sequenza 1
Sequenza 2
Sequenza 3
Sequenza 4
RT5
sep sei seg
sei seg
sec sei seg
see
sep sei seg
RT6
see
seb
sei seg
sec sei seg
see
RT7
sec sei seg
sea sed ser sej
seb
sei seg
sec sei seg
negativo
sea sed ser sej
seb
sei seg
sep sei seg
negativo
sea sed ser sej
seb
see
sep sei seg
negativo
sea sed ser sej
sec sei seg
see
sep sei seg
Negativo
Lab
12-23-18
Lab
2
Lab
15-20
Lab
17-19
Composizione
Composizionesequenze
sequenze
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IZSTO
Risultati1/3
Risultati1/3
L12
L14
L15
L17
L18
L19
L20
L23
seg sei
RT1
C
C
C
C
C
NC
C
C
seb
RT2
C
C
C
C
C
C
C
C
sea sed sej ser
RT3
C
C
C
C
C
NC
C
C
Negativo
RT4
C
C
C
C
C
C
NC
C
seg sei sep
RT5
NC
C
C
C
C
NC
NC
C
see
RT6
C
C
C
C
C
C
NC
C
sec seg sei
RT7
NC
C
C
C
C
C
C
C
VI Workshop NRL – CPS including S.aureus - Torino, 12-13 dicembre 2013
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Risultati
Risultati2/3
2/3
Ceppo
RT1
lab
seg
sei
Cep
po
Ceppo
RT3
RT2
seb
sea
sed
sej
Ceppo
RT4
ser
Neg
Ceppo
RT5
seg
sei
Ceppo
RT6
sep
see
Ceppo
RT7
sec
seg
sei
12
14
15
17
18
19
20
sed
sed
sed
23
Risultato corretto
Gene presente non rilevato
Gene assente ma rilevato
IZSTO
Risultati
Risultati3/3
3/3
lab
sea seb sec sed see
seg
sei
sej
sep
ser
N
12
+
+
+
+
+
--
+++
+
+
+
+
14
+
+
+
+
+
++
+++
+
+
+
+
15
+
+
+
+
+
++
+++
+
+
+
+
17
+
+
+
+
+
++
+++
+
+
+
+
18
+
+
+
+
+
++
+++
+
+
+
+
19
+
+
+
+
+
++
+++
+
-
-
+
20
+
+
+
+
+
++
+++
+
+
+
-
23
+
+
+
+
+
++
+++
+
+
+
+
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FOLLOW UP
3 laboratori partecipanti
Sequenze differenti a seconda dell’errore riscontrato
Laboratorio 12
ID
Risultato
atteso
Risultato
ottenuto
Esito
1
sep/sei/seg
sep/sei/seg
CONFORME
2
sec/sei/seg
sec/sei/seg
CONFORME
ID
Risultato
atteso
Risultato
ottenuto
Esito
3
negativo
negativo
CONFORME
1
sep/sei/seg
sep/sei/seg
CONFORME
4
negativo
negativo
CONFORME
2
sei/seg
seg
NON CONFORME
5
negativo
negativo
CONFORME
3
sea/sed/ser/sej
sea/sed/ser/sej
CONFORME
4
negativo
negativo
CONFORME
5
negativo
negativo
CONFORME
Laboratorio 19
Laboratorio 20
ID
Risultato
atteso
Risultato
ottenuto
Esito
1
sep/sei/seg
see
NON CONFORME
2
sec/sei/seg
sed/seg/sep/sei
NON CONFORME
3
negativo
sed
NON CONFORME
4
negativo
sed
NON CONFORME
5
negativo
sed
NON CONFORME
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IZSTO
Grazie
Grazieper
perl’attenzione
l’attenzione
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