Targeting proteico
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INIZIO DELLA TRADUZIONE Proteine citoplasmatiche (ed anche nucleari,mitocondriali ecc. Proteine integrali di membrana Proteine di secrezione LA TRADUZIONE INIZIA SEMPRE NEL CITOPLASMA MEMBRANA MEMBRANA RER proteine di secrezione e di membrana MITOCONDRI / CLOROPLASTI PROTEINE DI SECREZIONE IN BATTERI Proteine citoplasmatiche Proteine di secrezione o di membrana PEPTIDE SEGNALE eucariotico AA BASICI AA IDROFOBICI Small Ribonuclear Particle Un piccolo RNA (7SL) e 6 proteine 1 INIZIO DELLA TRADUZIONE 2 4 SRP RICONOSCE IL PEPTIDE SEGNALE (pausa nella traduzione) 3 RIPRESA DELLA TRADUZIONE ADESIONE DEL RIBOSOMA ALLA MEMBRANA DI RER 6 LA PROTEINA ENTRA NEL RER VIA VIA CHE VIENE SINTETIZZATA 5 TAGLIO CON ENDOPEPTIDASI (Pept.segn.peptidasi) Sequenza (o peptide) segnale Sequenza di inizio della traslocazione al RER • Peptide segnale • che verrà prontamente digerito dalla peptide-segnalepeptidasi RIBOSOMA E SRP “cerniera” Tasca idrofobica ricca di Met 7SL RNA Sequenze Alu Trasposoni SINE Met PROTEINA DI SECREZIONE SECREZIONE REGOLATA COSTITUTIVA LISOSOMI PROTEINE DI MEMBRANA Citoplasma Esterno della cellula MEMBRANA CITOPLASM. Tre modalità di inserimento 1 Sequenza segnale iniziale Alfa-elica di 20-22 AA prevalentemente idrofobici Sequenza di arresto Rilascio dal poro Taglio della sequenza segnale Aminoacidi Idrofobici dell’ alfa-elica Alfa-eliche transmembrana 7 domini un dominio Tre modalità di inserimento 1 Sequenza segnale iniziale Alfa-elica di 20-22 AA prevalentemente idrofobici Sequenza di arresto Rilascio dal poro Taglio della sequenza segnale 2 N Sequenza segnale INTERNA Presenza di AA carici 3 + Inizio traslocazione al RER e successivo intrappolamento nella membrana. Sequenza segnale: NON VIENE TAGLIATA Seq. di arresto Seq. Segnale INTERNA Inizio traslocazione Alfa-eliche transmembrana 7 domini un dominio Varie modalita’ di inserimento • N-glicosilazione Sequenza Asn – X -- Ser/Thr DOLICOLO poli - isoprenoide NEL RETICOLO ENDOPLASMATICO: N – GLICOSILAZIONI Formazione PONTI CISTINICI (disolfuro isomerasi) Ripiegamento: proteina chaperone BiP Gli enzimi “residenti” sono in buona parte SOLUBILI: segnale di trattenimento nell’ ER: Lys-Asp-Glu-Leu-COOH NEL GOLGI: Processamento delle N-glicosilazioni operate nel RE Aggiunta di O-Glicosilazioni Enzimi spesso associati alla MEMBRANA GLICOSILAZIONE Reticolo endoplasmatico Golgi or Serine LA TRADUZIONE INIZIA SEMPRE NEL CITOPLASMA MEMBRANA MEMBRANA RER proteine di secrezione e di membrana MITOCONDRI / CLOROPLASTI PROTEINE DI SECREZIONE IN BATTERI PROTEINE DI SECREZIONE IN BATTERI Prima la SINTESI e poi la SECREZIONE Taglio del peptide segnale Trasporto ai mitocondri Proteina già sintetizzata nel citoplasma, con peptide segnale specifico all’ N-terminale. Passaggio diretto nella matrice Proteine della membrana mitocondriale esterna (meccanismi simili sono attivi nei batteri) Sintesi seguita da ripiegamento e inserzione Proteine della membrana mitocondriale interna o dello spazio intermembrana Trasporto nel cloroplasto Mitocondri e cloroplasti • • • • • 16500 bp Contengono un genoma limitato ma funzionante, e un completo apparato di sintesi proteica (somiglianza con i batteri). Importano proteine codificate da geni nucleari Non esportano proteine Genomi (eccezione:’apoptosi) ribosomiali Si generano per fissione Molto vari come dimensione e numero Poche le proteine comuni a specie diverse Genoma mitocondriale umano Codifica per 13 proteine 22 tRNA 2 rRNA Genoma in “rapida” evoluzione MITOCONDRI • Uso “rilassato” dell’accoppiamento codone/anticodone (22 tRNA sono sufficienti). • Codice genetico leggermente diverso Genoma di cloroplasto di pianta superiore Forti similarità con i cianobatteri EREDITA’ NON MENDELIANA (CITOPLASMATICA) BIPARENTALE NEI LIEVITI MATERNA IN ANIMALI SUPERIORI Il fenotipo si manifesta casualmente Colonie piccole Colonie normali o am l iso t en Colonie piccole Colonie NORMALI
