6. Targeting

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INIZIO DELLA TRADUZIONE
Proteine citoplasmatiche
(ed anche nucleari,mitocondriali ecc.)
Proteine
integrali
di membrana
Proteine di secrezione
LA TRADUZIONE
INIZIA SEMPRE NEL CITOPLASMA
MEMBRANA
MEMBRANA
RER
proteine di secrezione
e di membrana
MITOCONDRI / CLOROPLASTI
PROTEINE DI SECREZIONE IN BATTERI
Proteine
citoplasmatiche
Proteine
di secrezione
o di membrana
PEPTIDE SEGNALE
eucariotico
AA
BASICI
AA
IDROFOBICI
Small Ribonuclear Particle
Un piccolo RNA (7SL) e 6 proteine
1
INIZIO DELLA
TRADUZIONE
2
4
SRP
RICONOSCE IL
PEPTIDE SEGNALE
(pausa nella traduzione)
3
RIPRESA
DELLA TRADUZIONE
ADESIONE DEL RIBOSOMA
ALLA MEMBRANA DI RER
6
LA PROTEINA
ENTRA NEL RER
VIA VIA CHE VIENE SINTETIZZATA
5
TAGLIO CON
ENDOPEPTIDASI
(Pept.segn.peptidasi)
Sequenza (o peptide) segnale
Sequenza di inizio della traslocazione al RER
•
Peptide segnale
•
che verrà
prontamente
digerito dalla
peptide-segnalepeptidasi
PROTEINA
DI
SECREZIONE
SECREZIONE
REGOLATA
COSTITUTIVA
LISOSOMI
PROTEINE
DI MEMBRANA
Citoplasma
Esterno
della cellula
MEMBRANA
CITOPLASM.
Alfa-elica di 20-22 AA
prevalentemente idrofobici
Sequenza di arresto
Rilascio dal poro
Taglio della
sequenza segnale
Aminoacidi
Idrofobici
dell’
alfa-elica
Alfa-eliche transmembrana
7 domini
un dominio
Varie modalita’ di inserimento
• N-glicosilazione
Sequenza
Asn – X -- Ser/Thr
DOLICOLO
poli - isoprenoide
NEL RETICOLO ENDOPLASMATICO:
N – GLICOSILAZIONI
Formazione PONTI CISTINICI (disolfuro isomerasi)
Ripiegamento: proteina chaperone BiP
Gli enzimi “residenti” sono in buona parte SOLUBILI:
segnale di trattenimento nell’ ER: Lys-Asp-Glu-Leu-COOH
NEL GOLGI:
Processamento delle N-glicosilazioni operate nel RE
Aggiunta di O-Glicosilazioni
Enzimi spesso associati alla MEMBRANA
GLICOSILAZIONE
Reticolo endoplasmatico
Golgi
or Serine
LA TRADUZIONE
INIZIA SEMPRE NEL CITOPLASMA
MEMBRANA
MEMBRANA
RER
proteine di secrezione
e di membrana
MITOCONDRI / CLOROPLASTI
PROTEINE DI SECREZIONE IN BATTERI
PROTEINE DI SECREZIONE
IN BATTERI
Prima la
SINTESI
e poi la
SECREZIONE
Taglio del
peptide segnale
Trasporto ai mitocondri
Proteina già sintetizzata nel citoplasma,
con peptide segnale specifico all’ N-terminale.
Passaggio diretto nella matrice
Mitocondri e cloroplasti
•
•
•
•
•
16500 bp
Contengono un genoma limitato ma funzionante,
e un completo apparato di sintesi proteica (somiglianza con i batteri).
Importano proteine codificate
da geni nucleari
Non esportano proteine
Genomi
(eccezione:’apoptosi)
mitocondriali
Si generano per fissione
Molto vari come dimensione e numero
Poche le proteine
comuni
a specie diverse
Genoma
mitocondriale
umano
Codifica per
13 proteine
22 tRNA
2 rRNA
Genoma in
“rapida” evoluzione
MITOCONDRI
•
Uso “rilassato” dell’accoppiamento codone/anticodone
(22 tRNA sono sufficienti).
•
Codice genetico leggermente diverso
Genoma di
cloroplasto
di pianta superiore
Forti similarità con
i cianobatteri
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