INIZIO DELLA TRADUZIONE Proteine citoplasmatiche (ed anche nucleari,mitocondriali ecc.) Proteine integrali di membrana Proteine di secrezione LA TRADUZIONE INIZIA SEMPRE NEL CITOPLASMA MEMBRANA MEMBRANA RER proteine di secrezione e di membrana MITOCONDRI / CLOROPLASTI PROTEINE DI SECREZIONE IN BATTERI Proteine citoplasmatiche Proteine di secrezione o di membrana PEPTIDE SEGNALE eucariotico AA BASICI AA IDROFOBICI Small Ribonuclear Particle Un piccolo RNA (7SL) e 6 proteine 1 INIZIO DELLA TRADUZIONE 2 4 SRP RICONOSCE IL PEPTIDE SEGNALE (pausa nella traduzione) 3 RIPRESA DELLA TRADUZIONE ADESIONE DEL RIBOSOMA ALLA MEMBRANA DI RER 6 LA PROTEINA ENTRA NEL RER VIA VIA CHE VIENE SINTETIZZATA 5 TAGLIO CON ENDOPEPTIDASI (Pept.segn.peptidasi) Sequenza (o peptide) segnale Sequenza di inizio della traslocazione al RER • Peptide segnale • che verrà prontamente digerito dalla peptide-segnalepeptidasi PROTEINA DI SECREZIONE SECREZIONE REGOLATA COSTITUTIVA LISOSOMI PROTEINE DI MEMBRANA Citoplasma Esterno della cellula MEMBRANA CITOPLASM. Alfa-elica di 20-22 AA prevalentemente idrofobici Sequenza di arresto Rilascio dal poro Taglio della sequenza segnale Aminoacidi Idrofobici dell’ alfa-elica Alfa-eliche transmembrana 7 domini un dominio Varie modalita’ di inserimento • N-glicosilazione Sequenza Asn – X -- Ser/Thr DOLICOLO poli - isoprenoide NEL RETICOLO ENDOPLASMATICO: N – GLICOSILAZIONI Formazione PONTI CISTINICI (disolfuro isomerasi) Ripiegamento: proteina chaperone BiP Gli enzimi “residenti” sono in buona parte SOLUBILI: segnale di trattenimento nell’ ER: Lys-Asp-Glu-Leu-COOH NEL GOLGI: Processamento delle N-glicosilazioni operate nel RE Aggiunta di O-Glicosilazioni Enzimi spesso associati alla MEMBRANA GLICOSILAZIONE Reticolo endoplasmatico Golgi or Serine LA TRADUZIONE INIZIA SEMPRE NEL CITOPLASMA MEMBRANA MEMBRANA RER proteine di secrezione e di membrana MITOCONDRI / CLOROPLASTI PROTEINE DI SECREZIONE IN BATTERI PROTEINE DI SECREZIONE IN BATTERI Prima la SINTESI e poi la SECREZIONE Taglio del peptide segnale Trasporto ai mitocondri Proteina già sintetizzata nel citoplasma, con peptide segnale specifico all’ N-terminale. Passaggio diretto nella matrice Mitocondri e cloroplasti • • • • • 16500 bp Contengono un genoma limitato ma funzionante, e un completo apparato di sintesi proteica (somiglianza con i batteri). Importano proteine codificate da geni nucleari Non esportano proteine Genomi (eccezione:’apoptosi) mitocondriali Si generano per fissione Molto vari come dimensione e numero Poche le proteine comuni a specie diverse Genoma mitocondriale umano Codifica per 13 proteine 22 tRNA 2 rRNA Genoma in “rapida” evoluzione MITOCONDRI • Uso “rilassato” dell’accoppiamento codone/anticodone (22 tRNA sono sufficienti). • Codice genetico leggermente diverso Genoma di cloroplasto di pianta superiore Forti similarità con i cianobatteri