ESERCITAZIONE 2- GENETICA MAPPE CROMOSOMICHE E FREQUENZA DI RICOMBINAZIONE PROF.MASSIMO ZOLLO MAPPA CROMOSOMICA: disposizione dei geni sui cromosomi (l'ordine dei geni e la loro distanza su ciascun cromosoma) LOCUS GENETICO: posizioni di un gene su un cromosoma • MAPPE BASATE SULLA RICOMBINAZIONE Mappe genetiche: • Costruire genotipi complessi • Individuare struttura dei geni Geni associati: i loci di questi geni si trovano sullo stesso cromosoma • non assortiscono in maniera indipendente • tendono ad essere trasmessi come un complesso unico ATTRAVERSO*IL*CROSSING*OVER*AVVIENE*LA*RICOMBINAZIONE* ATTRAVERSO*IL*CROSSING*OVER*AVVIENE*LA*RICOMBINAZIONE*TRA*GENI*ASSOCIATI* Crossing Over • Lo scambio di segmenti cromosomici tra 2 cromatidi non fratelli Avviene durante la Profase 1 della MEIOSI (nelle cellule sessuali) OSSING*OVER*AVVIENE*LA*RICOMBINAZIONE*TRA*GENI*ASSOCIATI* ATTRAVERSO*IL*CROSSING*OVER*AVVIENE*LA*RICOMBINAZIONE*TRA*GENI*ASSOCIATI* LA FREQUENZA DI RICOMBINANTI PRODOTTI DAL CROSSING OVER E’LA CHIAVE PER LA MAPPATURA DEI CROMOSOMI. distanza tra geni > probabilità di crossing over Frequenza di ricombinanti: misura della distanza tra i geni > n°di ricombinanti RISULTATI*DEL*CROSSING*OVER* RISULTATI*DEL*CROSSING*OVER* UTILIZZO*DELLA*FREQUENZA*DI*RICOMBINAZIONE*PER*IDENTIFICARE*I*GENI*ASSOCIATI I!ricombinan. !di!una!meiosi!si!individuano!incrociando!un!eterozigote!con!un!tester!recessivo (test*cross)! PREVALGONO I FENOTIPI PARENTALI che sommati tra loro sono > del 50% 8%. I geni sono associati. A/a!V!B/b! Feno. po! Game. ! X a/a!V!b/b! AB! ab! Meiosi! Meiosi! Geno. po! ab! A/a!V!B/b! AB!!!!Parentale! Ab! ab! A/a!V!b/b! Ab!!!!Ricombinante! aB! ab! aB!!!!!Ricombinante! ab! ab! a/a!V!B/b! a/a!V!b/b! AB! 40!AB!!!!!Parentali! 8!!!Ab!!!!!Ricombinan. ! 9!!!aB!!!!!Ricombinan. ! 43!ab!!!!!Parentali! 100!!!!!!!TOTALE! FREQUENZA*DI*RICOMBINAZIONE*=** FREQUENZA*DI*RICOMBINAZIONE*(F.R.)*=*17%* Distanza*tra*I*loci*A*e*B*=*17*u.m.* Feno. po! ab!!!!!Parentale! 8!+!9! X!100! =!17%! 100! 17 u.m A B ESERCIZIO*4* Di*seguito*è*riportata*una*ipote=ca*mappa*gene=ca. Se*consideriamo*un*individuo*di*geno=po*XZ/xz* qual*è*la*probabilità*che*esso*produca*game=*di*geno=po*Xz? XZ*/*xz* MEIOSI GAMETI** SENZA*RICOMBINAZIONE* CON*RICOMBINAZIONE* ab Ritornando&al&nostro&esercizio…..& 92#AB#####Parentali# 4###Ab#####Ricombinan, # 6###aB#####Ricombinan, # 98#ab#####Parentali# 200#######TOTALE# FREQUENZA&DI&RICOMBINAZIONE&=&& 4#+#6# 200# X#100# =#5%# FREQUENZA&DI&RICOMBINAZIONE&(F.R.)&=&5%& Distanza&tra&I&loci&A&e&B&=&5&u.m.& I&LOCI&A&e&B&SONO&ASSOCIATI& 5&# u.m# A# B# Fenotipo AB Fenotipo ab ASSORTIMENTO INDIPENDENTE? l test del chi quadrato i risultati ottenuti non sempre concordano con quelli teorici ! Confrontare una serie di dati osservati sperimentalmente con i dati attesi e misurare la discrepanza tra questi. Sommatoria del rapporto tra il quadrato della differenza tra il dato osservato (oi) e quello atteso (ei) ed il dato atteso. Misura la differenza complessiva tra i dati osservati e dati attesi e la probabilità con cui si verifica questa differenza La discrepanza tra i valori attesi e quelli osservati è dovuta al caso oppure la mia ipotesi di partenza è sbagliata? Ci permette di accettare o rifiutare una data ipotesi. 2 0,25: probabilità compresa tra 90-97%. IPOTESI ACCETTATA Χ0,25 P >5% : valori osservati accettabili, IPOTESI ACCETTATA! (la discrepanza tra i valori osservati e quelli attesi è dovuta al caso!) IPOTESI ACCETTATA IPOTESI RIFIUTATA IPOTESI RIFIUTATA P >5% : valori osservati accettabili, IPOTESI ACCETTATA! (la discrepanza tra i valori osservati e quelli attesi è dovuta al caso!) Geni associati Geni associati Permette di valutare con un solo incrocio l’associazione tra 3 REINCROCIO&A&3&PUNTI&REINCROCIO& A&3&PUNTI& geni e di determinarne l’ordine zigote# un#triplo# omozigote# recessivo# e#un#triplo#omozigote#recessivo# È#un#e# incrocio# tra# un#triplo#eterozigote# A#B#C# # ### ×# A # #B#C # # a#b##c# # a# ##b##c# # # A#B#C# # ### ×# #A#B#C # # a#b##c# # ## ## # #a b c # # r r+ SR in regione I (p-j) + DR × 100 Totale progenie (52 + 46) + (4 + 2) × 100 500 SR in regione II (j - r) + DR × Totale progenie (22 + 22) + (4 + 2) 500 × 100 = 20,8% 100 = 10,0% ESERCIZIO Supponiamo di avere effettuato un incrocio tra due linee pure AABBCC ed aabbcc. Sottoponiamo quindi la F1 (eterozigoti) ad un test-cross allo scopo di stabilire l’ordine dei geni sul cromosoma e di stimare le distanze tra i geni.