Presentazione di PowerPoint

ESERCITAZIONE 2- GENETICA
MAPPE CROMOSOMICHE E FREQUENZA DI RICOMBINAZIONE
PROF.MASSIMO ZOLLO
MAPPA CROMOSOMICA: disposizione dei geni sui cromosomi (l'ordine
dei geni e la loro distanza su ciascun cromosoma)
LOCUS GENETICO: posizioni di un gene su un cromosoma
• MAPPE BASATE SULLA RICOMBINAZIONE
Mappe genetiche:
• Costruire genotipi complessi
• Individuare struttura dei geni
Geni associati: i loci di questi geni si trovano sullo stesso cromosoma
• non assortiscono in maniera indipendente
• tendono ad essere trasmessi come un complesso unico
ATTRAVERSO*IL*CROSSING*OVER*AVVIENE*LA*RICOMBINAZIONE*
ATTRAVERSO*IL*CROSSING*OVER*AVVIENE*LA*RICOMBINAZIONE*TRA*GENI*ASSOCIATI*
Crossing Over
•
Lo scambio di segmenti cromosomici tra 2 cromatidi
non fratelli
Avviene durante la Profase 1 della MEIOSI (nelle cellule sessuali)
OSSING*OVER*AVVIENE*LA*RICOMBINAZIONE*TRA*GENI*ASSOCIATI*
ATTRAVERSO*IL*CROSSING*OVER*AVVIENE*LA*RICOMBINAZIONE*TRA*GENI*ASSOCIATI*
LA FREQUENZA DI RICOMBINANTI PRODOTTI DAL CROSSING OVER E’LA CHIAVE
PER LA MAPPATURA DEI CROMOSOMI.
distanza tra geni
> probabilità di crossing over
Frequenza di ricombinanti: misura della distanza tra i geni
> n°di ricombinanti
RISULTATI*DEL*CROSSING*OVER*
RISULTATI*DEL*CROSSING*OVER*
UTILIZZO*DELLA*FREQUENZA*DI*RICOMBINAZIONE*PER*IDENTIFICARE*I*GENI*ASSOCIATI
I!ricombinan. !di!una!meiosi!si!individuano!incrociando!un!eterozigote!con!un!tester!recessivo
(test*cross)!
PREVALGONO I FENOTIPI PARENTALI
che sommati tra loro sono > del 50%
8%. I geni sono associati.
A/a!V!B/b!
Feno. po!
Game. !
X
a/a!V!b/b!
AB!
ab!
Meiosi!
Meiosi!
Geno. po!
ab!
A/a!V!B/b!
AB!!!!Parentale!
Ab!
ab!
A/a!V!b/b!
Ab!!!!Ricombinante!
aB!
ab!
aB!!!!!Ricombinante!
ab!
ab!
a/a!V!B/b!
a/a!V!b/b!
AB!
40!AB!!!!!Parentali!
8!!!Ab!!!!!Ricombinan. !
9!!!aB!!!!!Ricombinan. !
43!ab!!!!!Parentali!
100!!!!!!!TOTALE!
FREQUENZA*DI*RICOMBINAZIONE*=**
FREQUENZA*DI*RICOMBINAZIONE*(F.R.)*=*17%*
Distanza*tra*I*loci*A*e*B*=*17*u.m.*
Feno. po!
ab!!!!!Parentale!
8!+!9!
X!100! =!17%!
100!
17 u.m
A
B
ESERCIZIO*4*
Di*seguito*è*riportata*una*ipote=ca*mappa*gene=ca. Se*consideriamo*un*individuo*di*geno=po*XZ/xz*
qual*è*la*probabilità*che*esso*produca*game=*di*geno=po*Xz?
XZ*/*xz*
MEIOSI
GAMETI**
SENZA*RICOMBINAZIONE*
CON*RICOMBINAZIONE*
ab
Ritornando&al&nostro&esercizio…..&
92#AB#####Parentali#
4###Ab#####Ricombinan, #
6###aB#####Ricombinan, #
98#ab#####Parentali#
200#######TOTALE#
FREQUENZA&DI&RICOMBINAZIONE&=&&
4#+#6#
200#
X#100# =#5%#
FREQUENZA&DI&RICOMBINAZIONE&(F.R.)&=&5%&
Distanza&tra&I&loci&A&e&B&=&5&u.m.&
I&LOCI&A&e&B&SONO&ASSOCIATI&
5&# u.m#
A#
B#
Fenotipo AB
Fenotipo ab
ASSORTIMENTO INDIPENDENTE?
l test del chi quadrato
i risultati ottenuti non sempre concordano con quelli teorici !
Confrontare una serie di dati osservati sperimentalmente con i dati attesi e misurare la
discrepanza tra questi.
Sommatoria del rapporto tra il
quadrato della differenza tra il dato
osservato (oi) e quello atteso (ei)
ed il dato atteso.
Misura la differenza complessiva tra i dati osservati e dati attesi e la
probabilità con cui si verifica questa differenza
La discrepanza tra i valori attesi e quelli osservati è dovuta al caso oppure la mia
ipotesi di partenza è sbagliata?
Ci permette di accettare o rifiutare una data ipotesi.
2 0,25: probabilità compresa tra 90-97%. IPOTESI ACCETTATA
Χ0,25
P >5% : valori osservati accettabili, IPOTESI ACCETTATA!
(la discrepanza tra i valori osservati e quelli attesi è dovuta al caso!)
IPOTESI ACCETTATA
IPOTESI
RIFIUTATA
IPOTESI
RIFIUTATA
P >5% : valori osservati accettabili, IPOTESI ACCETTATA!
(la discrepanza tra i valori osservati e quelli attesi è dovuta al caso!)
Geni associati
Geni associati
Permette di valutare
con un solo incrocio l’associazione tra 3
REINCROCIO&A&3&PUNTI&REINCROCIO&
A&3&PUNTI&
geni e di determinarne l’ordine
zigote#
un#triplo#
omozigote#
recessivo# e#un#triplo#omozigote#recessivo#
È#un#e#
incrocio#
tra#
un#triplo#eterozigote#
A#B#C#
#
### ×#
A
# #B#C
#
#
a#b##c#
#
a# ##b##c#
#
#
A#B#C#
#
### ×#
#A#B#C
#
#
a#b##c#
#
## ## #
#a b c
#
#
r
r+
SR in regione I (p-j) + DR
×
100
Totale progenie
(52 + 46) + (4 + 2)
×
100
500
SR in regione II (j - r) + DR
×
Totale progenie
(22 + 22) + (4 + 2)
500
×
100
= 20,8%
100
= 10,0%
ESERCIZIO
Supponiamo di avere
effettuato un incrocio
tra due linee pure
AABBCC ed aabbcc.
Sottoponiamo quindi la
F1 (eterozigoti) ad un
test-cross allo scopo di
stabilire l’ordine dei
geni sul cromosoma e di
stimare le distanze tra i
geni.