Traduzione dell`mRNA

Capitolo 13 – Traduzione dell’mRNA
13.1
Quante triplette codoni si possono ottenere dai quattro nucleotidi A, U, G e C in modo che contengano:
a. nessun uracile,
b. uno o più uracili?
13.2
Il DNA del fago lambda ha 1,2 × 105 nucleotidi. Quante proteine di peso molecolare
40000 potrebbero essere codificate da questo DNA? Si supponga un peso molecolare
di 100 per l’amminoacido medio.
13.3
Un’ammino-acil sintetasi è responsabile
a.
b.
c.
d.
e.
della formazione di un legame peptidico
del legame di un gruppo amminico a un acido organico
della formazione di un’organizzazione secondaria e superiore in un peptide
del movimento di una molecola di tRNA dal sito A al sito P di un ribosoma
della coniugazione di un amminoacido a un tRNA.
13.4
Il fago φX174 a singolo filamento di E. coli contiene 5386 nucleotidi codificanti per
11 proteine con un peso molecolare combinato di 262000 Da.
a. Se in media un amminoacido ha un peso molecolare di 110, da quanti amminoa-
cidi viene superata la capacità codificante del fago?
b. Come φX174 può codificare più proteine di quante triplette codificanti abbia?
c. Numerosi virus degli animali producono più proteine di quanto essi sembrino in
grado di fare sulla base delle triplette codificanti. Si suggeriscano alcuni modi attraverso i quali essi possano ottenere questo risultato utilizzando un singolo modulo di lettura.
R.J.Brooker, Principi di genetica – Copyright © 2010 The McGraw-Hill Companies S.r.l., Publishing Group Italia
Soluzioni
13.1
a. Dal momento che l’uracile rappresenta 1 dei 4 nucleotidi, la probabilità che esso
sia la prima lettera del codone è 1/4 e la probabilità che non sia la prima lettera è
3/4. Lo stesso ragionamento è buono per la seconda e la terza lettera del codone.
La probabilità che nessuna delle tre lettere del codone sia uracile è (3/4)3 = 27/64.
b. Il numero dei codoni contenenti almeno un uracile è 1 – 27/64 = 37/64.
13.2
50 proteine, supponendo che solo un filamento del DNA sia trascritto in mRNA.
13.3
e
13.4
a. (262000 peso molecolare/110 peso molecolare per amminoacido) – (5386 basi/3
basi per codone) = 586,5 amminoacidi
b. Alcuni geni fagici si sovrappongono, ovvero la stessa sequenza può essere tra-
scritta in differenti moduli di lettura. La sola caratteristica strutturale responsabile
della sovrapposizione dei geni è la localizzazione di ogni codone di inizio AUG
c. Attraverso il taglio alternativo dei siti intronici dello stesso trascritto primario si
possono ottenere due proteine che hanno la stessa estremità N ma diverse terminazioni C. Una poliproteina può anche essere tagliata enzimaticamente in più di
un modo per dare prodotti differenti.
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