Lez 17

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
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Trascrizione e traduzione sono contemporanee
La sintesi dell’RNA avviene nella bolla di trascrizione
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La trascrizione altera la topologia
L’RNA polimerasi di E. coli
Le RNA polimerasi batteriche hanno cinque tipi di subunità
w
1
nucleo enzimatico stabilita’
a2bb’ws
Struttura dell’RNA polimerasi batterica e
della polimerasi II eucariotica
Le RNA polimerasi
sono simili
L’RNA polimerasi del fago T7
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Inibitori della trascrizione
Inibitore
Rifamicina
Streptolidigina
Actinomicina D
a -Amanitina
Enzima bersaglio
oloenzima proc.
nucleo enz. proc.
pol I eucariotica
pol II eucariotica
Azione dell'inibitore
lega b e inibisce inizio
lega b e inibisce allungamento
lega il DNA e inibisce allungamento
lega la RNA polimerasi II
La trascrizione può essere divisa in tre stadi:
1. Inizio
2. Allungamento
3. Terminazione
Fasi della trascrizione
Inizio della trascrizione
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Allungamento e terminazione
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I promotori procariotici
Identificazione della “Pribnow box” presente nella
maggiorparte dei promotori di E.coli
fd
..TGCTTCTGACTATAATAGACAGGGTAAAGACCTGATTTTTGA
T7 A3
AAGTAAACACGGTACGATGTACCACATGAAACGACAGTGAGT
T7 A2
AGTAACATGCAGTAAGATACAAATCGCTAGGTAACACTAGCAG
Lac-UV-5
l PR
l PL
GCTTCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAA
Tyr tRNA
..CGTCATTTGATATGATGCGCCCCGCTTCCCGATAAGGGAGCA
Lac w.t.
GCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAA
Consenso
ACCTCTGGCGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTG...
ACCACTGGCGGTGATACTGAGCACATCAGCAGGACGCACTGA
T80A95T45A60A50T96
5-9 bp
A/G
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Un tipico promotore di E.coli è costituito da tre componenti:
le sequenze consenso -35 e -10, e il sito d’inizio
+1
-35
TTGACA
Sequenza -35
16-19 basi
-10
TATAAT
Pribnow box
5-9 basi
Sito di inizio
della trascrizione
Promotori procariotici