Lez_9_DNA_rip

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
DNA RIPETITIVO NEL GENOMA
• In tandem: DNA satellite
• Disperso: retrovirus, retrotrasposoni,trasposoni
Analisi del DNA di Drosophila melanogaster mediante
ultracentrifugazione in gradiente di CsCl
Assorbanza
Densità (g/cm3)
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EVOLUZIONE DI UN DNA SATELLITE MEDIANTE
DUPLICAZIONE E DIVERGENZA DI UNA SEQUENZA SEMPLICE
n.nt.
9
27
58
116
234
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RETROELEMENTI
• Retrovirus
• Retrovirus endogeni (ERV)
• Retrotrasposoni (Ty1, Ty3, gypsy, copia, LINE, SINE)
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LINE (long interspersed nuclear element)
• Contengono trascrittasi inversa
• Derivano da trascritti pol II
• Es. LINE-1 (L1) 6,1 Kb
• 3500 copie intere e centinaia di migliaia tronche
SINE (short interspersed nuclear element)
• Non contengono trascrittasi inversa
• Derivano da trascritti di pol III
• Es. Alu
• Un milione di copie
Trasposoni a DNA
• Pochi negli eucarioti (100 copie nell’uomo)
• Elementi Ac/Ds di mais
• Trasferimento orizzontale di geni
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