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A
SCHEMA LEZIONI BIO MOL BIOINF (Modulo BioMol)
LT BIOTEC (AA 2014/2015)
argomenti
data
settimana
cenni storici, nucleotidi
6/10
struttura raggi X, appaiamento,
1-struttura
DNA, RNA
strutture DNA, topologia,
16/10
codice genetico
genomi, valore C
esoni-introni
DNA ripetuto
famiglie geniche
tecniche
tecniche
TEST 1
9
10
11
12
organelli
cromosomi
cromatina
nucleosomi
13
14
15
16
replicone
replicazione
DNA polimerasi
riparazione
TEST 2
17
18
19
20
trascrizione procariori
regolaz. procarioti
trascrizione eucarioti
regolaz eucarioti
21
22
23
24
terminaz, antiterminaz
maturaz rRNA, mRNA eucar
modificazioni RNA
splicing
TEST 3
25
26
27
28
tRNA, mRNA
ribosoma
traduzione
regolazione traduz
29
30
31
32
ù
regolaz. traduzionale
localizzazione mRNA
localizzazione proteine
trasporto nucleo-citoplasma
tecniche
tecniche
TEST 4
B
TEST R
TEST 5 (FINALE)
20/10
2- genomi
21/10
23/10
27/10
3010
3-cromatina
3/11
6/11
10/11
4- replicazione
DNA
13/11
17/11
5-trascrizione
20/11
24/11
6-reg. trascr
27/11
28/11
1/12
7-traduzione
4/12
11/12
8-reg traduz
15/12
18/10
19/12
8/1
?
Ruolo degli introni nell’evoluzione
(teoria del “mescolamento degli esoni”)
B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S.p.A. Copyright © 2007
Rimescolamento degli esoni
Rimescolamento di esoni codificanti moduli proteici
Capacità codificante dei geni eucariotici
Splicing alternativo
Splicing alternativo
Il gene per la a-amilasi
Il gene per la b-tropomiosina
Isoforme di mRNA
•differenze nella parte codificante
•differenze nella parte non tradotta
Isoforme di mRNA
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
DNA RIPETITIVO NEL GENOMA
•In tandem: DNA satellite
•Disperso: retrovirus, retrotrasposoni,trasposoni
DNA satellite
DNA satellite di Drosophila
Evoluzione DNA satellite di topo
G80A64A84A80A48A68T32G44T60
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
DNA mediamente ripetitivo
• Microsatelliti (STR): 1-10 bp ripetute 10-30 volte
• Minisatelliti: 10-100 bp ripetute fino a 200 volte
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Patologie associate ad espansione di triplette
DNA ripetitivo disperso nel genoma
• Classe I: retroelementi (retrovirus, retrotrasposoni)
• Classe II: trasposoni a DNA
Elementi ripetuti nei genomi
Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright
Meccanismo di trasposizione
Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright
Meccanismo di trasposizione
Trasposoni a DNA
• Pochi nei mammiferi (3% del genoma nell’uomo)
• Elementi Ac/Ds di mais
• Trasferimento orizzontale di geni
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
RETROELEMENTI
• Retrovirus
• Retrovirus endogeni (ERV)
• Retrotrasposoni (Ty1, Ty3, gypsy, copia, LINE, SINE)
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Struttura dei retroelementi
LINE (long interspersed nuclear element)
• Contengono trascrittasi inversa
• Derivano da trascritti pol II
• Es. LINE-1 (L1) 6,1 Kb
• 3500 copie intere e centinaia di migliaia tronche
SINE (short interspersed nuclear element)
• Non contengono trascrittasi inversa
• Derivano da trascritti di pol III
• Es. Alu
• Un milione di copie
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006