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Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
LINE (long interspersed nuclear element)
• Contengono trascrittasi inversa
• Derivano da trascritti pol II
• Es. LINE-1 (L1) 6,1 Kb
• 3500 copie intere e centinaia di migliaia tronche
SINE (short interspersed nuclear element)
• Non contengono trascrittasi inversa
• Derivano da trascritti di pol III
• Es. Alu
• Un milione di copie
Trasposoni a DNA
• Pochi nei mammiferi (3% del genoma nell’uomo)
• Elementi Ac/Ds di mais (McClintok, 1940)
• Trasferimento orizzontale di geni
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quoziente di compattamento
(rapporto di impacchettamento)
rapporto tra la lunghezza del
DNA e la lunghezza dell’unità
che lo contiene.
per es. il più piccolo cromosoma umano:
cromosoma mitotico
DNA 4,6x 107 bp
quoziente di compattamento
= 2 mm
= 1,4 cm
= 7000
Concentrazione del DNA negli organismi
• Fago T4 = 500 mg/ml
• Batteri = 10 mg/ml
• Nucleo eucarioti = 100 mg/ml
Costruzione di un capside
• Il rivestimento proteico si assembla
intorno all’acido nucleico
• L’acido nucleico viene inserito dopo che
il capside si è formato
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E.coli contiene varie proteine che legano il DNA
Proteina
Composizione
No./cellula
Corrispondente
Locus
eucariotico
HU
subunità  e , ciascuna 9000 Da
40,000 dimeri
Istone H2B
hupA,B
H
2 subunità identiche di 28,000 Da
30,000 dimeri
Istone H2A
?
IHF
subunità  = 10,500; subunità = 9,500 ?
?
himA,D
H1
subunità di 15,000 Da
10,000 copie
?
?
HLP1
monomero di 17,000 Da
20,000 copie
?
firA
P
subunità di 3,000 Da
?
Protamine
?
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Cromatina
• Eucromatina: geni espressi (non tutti)
• Eterocromatina: costitutiva (satellite)
facoltativa (cromosoma X)
Eterocromatina costitutiva
• Condensata permanentemente
• Contiene DNA ripetuto ridotta densita’ di geni
• Probabilmente replica tardi
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Elementi della regione CEN di lievito
• CDE-I: 9 bp conservata
• CDE-II: 80-90 bp lunghezza variabile
• CDE-III: 11 bp altamente conservata
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