Diagnosi Prenatale II By NA 1 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) • Cromosomi di cui non è riconoscibile con le metodiche classiche la provenienza • Frequenza alla nascita 0.14-0.72/1000 • Difficile correlazione genotipo-fenotipo in diagnosi prenatale • Importante il rilievo della caratterizzazione molecolare By NA 2 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) In più del 50% dei casi è oggi possibile fare previsioni fenotipiche corrette: • Invdup15 (50% ESAC) • Cromosomi sessuali By NA 3 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) Amniocentesi paziente di 41 aa Presenza di un ESAC in tutti i cloni de novo piccole dimensioni By NA 4 By NA 5 By NA 6 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) CBG positivo DA/DAPI positivo FISH centromero 15 positiva Invdup(15) Definizione del tipo By NA 7 By NA 8 By NA 9 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) FISH sonde pericentromeriche (D15S11; GABR3) NEGATIVA Invdup(15) tipo I Assenza di anomalie del fenotipo By NA 10 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) Rischio di Disomia Uniparentale 15q11-q13 da origine postzigotica del marcatore Materna Paterna s. Prader/Willi By NA s. Angelman 11 By NA 12 By NA 13 P F M D15S130 P F M D15S165 Polimorfismi Cromosoma 15 - Tecnica PAGE By NA 14 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) ESCLUSIONE DISOMIA UNIPARENTALE CON MARCATORI POLIMORFICI DEL CROMOSOMA 15 By NA 15 By NA 16 By NA 17 By NA 18 By NA 19 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) Amniocentesi paziente di 35 aa Presenza di un ESAC de novo piccole dimensioni By NA 20 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) CBG positivo DA/DAPI negativo FISH 13,14,15,21,22,X,Y negativa Rischio alterazioni fenotipiche 5% Ecografia/Ecocardiografia Riduzione rischio di 1/3 By NA 21 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) Paziente in gravidanza di 31 aa Riscontro ecografico NT aumentata By NA 22 Toshiba Instruments By NA 23 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) NT aumentata rischio aneuploidie Prelievo villi coriali a 11 settimane Presenza di ESAC de novo piccole dimensioni, bisatellitato By NA 24 CROMOSOMI MARCATORI (Extra Structurally Abnormal Chromosome) FISH 13,14,15,21,22 Positiva per centromero 22 invdup(22) Cat/Eye syndrome By NA 25 Cat Eye syndrome Malf. orecchio Malf.anorettali Malf. urogenitali Coloboma occhio 86% 81% 71% 61% Altre Malformazioni By NA 26 Cat Eye syndrome Malformazioni cardiache 62% di cui 1/3 Anomalie del Ritorno Venoso Polmonare By NA 27 Cat Eye syndrome RITARDO MENTALE ?? Severo Moderato/lieve By NA 7% 47% 28 Cat Eye syndrome Assenza di correlazioni tra estensione/regioni geniche presenti nel cromosoma invdup(22) ed anomalie del fenotipo By NA 29 Cat Eye syndrome CES Tipo I vs CES Tipo II non ha utilità dal punto di vista clinico By NA 30 By NA 31 Cellule normali DNA genomico CGH estrazione del DNA Ibridazione marcatura DNA di riferimento rosso Metafase maschile normale Cellule del paziente DNA genomico marcatura DNA test verde microscopio a fluorescenza acquisizione dell’immagine elaborazione dell’immagine analisi del rapporto di fluorescenza lungo l’asse cromosomico By NA 32 Intensità di fluorescenza area del cromosoma Verde/Rosso area del cromosoma amplificazione Ideogramma p By NA q delezione 33 By NA 34 By NA 35 Sindrome plurimalformativa tetraparesi spastica di grado medio ritardo mentale turbe comportamentali stereotipia microcefalia dismorfismi cranio facciali By NA 36 Mosaicismo • Amniocentesi cellule dall’epiblasto della massa cellulare interna. • Villocentesi – Coltura a breve termine cellule del trofoblasto. • Villocentesi – Coltura a lungo termine cellule dello stroma (mesoderma extraembrionario). By NA 37 By NA 38 MOSAICISMO • I Livello: singola cellula • II Livello: due o più cellule in una flask con la stessa anomalia o singolo clone • III Livello: due o più cellule in più flask con la stessa anomalia o almeno 2 cloni By NA 39 Liquido Amniotico Mosaicismi • Livello I 2.5-7 % • Livello II 0.7-1.1 % • Livello III < 0.2 % By NA 40 MOSAICISMO • PSEUDOMOSAICISMO • MOSAICISMO CONFINATO ALLA PLACENTA (chorion, amnion) • MOSAICISMO VERO La grande maggioranza dei mosaicismi in diagnosi prenatale non si correla ad anomalie fenotipiche fetali By NA 41 Mosaicismo trisomia 11 Paziente di 29 anni Indicazione: familiarità s. Down Cariotipo fetale 46,XX (10 cloni)/47,XX,+11 (1 clone) Mosaicismo II livello By NA 42 Linee Guida work-up Moderato: altre 10 cellule dalla flask con anomalia oppure altri 12 cloni. • • • • • By NA Flask Cr. Sessuale sovra-numerario (SC,MC) Trisomia 1,2,3,4,5,6,7, 10,11,16,17,19 (SC, MC) 45,X - Monosomie (MC) Alt. bilanciate (MC) Marcatore (SC) • • • • • In situ Cr. Sessuale sovra-numerario (SCo,MCo) Trisomia 1,2,3,4,5,6,7, 10,11,16,17,19 (SCo, MCo) 45,X - Monosomie (SCo, MCo) Alt. bilanciate (MCo) Marcatore (SCo) 43 Mosaicismo trisomia 11 Estensione analisi a 41 cloni Cariotipo 46,XY (39 cloni)/47,XY,+11 (2 cloni) Mosaicismo III livello By NA 44 Liquido Amniotico Mosaicismi - Livello III • Conferma sino al 40 % alla cordocentesi ed al 50%(autosomi), 80% (ESAC) e 90% (cr. sessuali) al follow-up • Tipo di Cromosoma (es. ESAC) • Utilizzo e limiti della Cordocentesi By NA 45 Mosaicismo trisomia 11 • Solo 2 casi in letteratura, con bassa frequenza (2.7 e 5.5%), apparentemente non associati ad alterazioni fenotipiche • Rischio s. Beckwith-Wiedemann da disomia uniparentale 11 By NA 46 Meccanismi UDP • • • • By NA Complementazione gametica Recupero dello zigote trisomico Duplicazione mitotica Errore post-zigotico 47 By NA 48 DISOMIA UNIPARENTALE CROMOSOMA 11 Regione 11p15.5 eterodisomia paterna Alterata espressione di geni da imprinting genomico 2 casi di s. Beckwith-Wiedemann By NA 49 DISOMIA UNIPARENTALE CROMOSOMA 11 P F M P F M P F M Polimorfismi Cromosoma 11 - Tecnica PAGE By NA 50 Mosaicismo trisomia 11 • Esame citogenetico: Cariotipo 46,XY (150 metafasi) • Screening molecolare con microsatelliti cromosoma 11: Esclusione UDP Attesa Fenotipo nella norma (follow-up a 24 mesi) By NA 51 Mosaicismo trisomia 4 Paziente di 40 anni Indicazione: età Cariotipo fetale 46,XX (31 cloni)/47,XX,+4 (9 cloni) Mosaicismo III livello By NA 52 Mosaicismo trisomia 4 Solo 3 casi in letteratura: - 2 con bassa frequenza ( 10%), apparentemente non associati ad alterazioni fenotipiche - 1 con an. faciali e malf. multiple: ad 1 anno buon follow-up - Problema UPD By NA 53 Mosaicismo trisomia 4 Counselling • Ecografia/Ecocardiografia fetale • Prelievo sangue funicolare per esame cariotipo ed esclusione UPD In caso di interruzione: Esame citogenetico su tessuti diversi By NA 54 Mosaicismo trisomia 4 • Ipoplasia cerebellare • Ventricolomegalia borderline Fetal MRI By NA 55 Mosaicismo trisomia 4 CAV completo By NA 56 Mosaicismo trisomia 4 • Micrognazia • Ipotelorismo • Deformità rachide (emivertebre) • s. atresia esofagea By NA 57 Mosaicismo trisomia 4 DISOMIA UNIPARENTALE P CF M D4S243 P CF M D4S175 Polimorfismi Cromosoma 4 - Tecnica PAGE By NA 58 Diagnosi Malattie DNA • Numero elevato malattie • Numero elevato di mutazioni (es. Fibrosi cistica) • Coinvolgimento geni diversi (es. Retinite pigmentosa) By NA 59 Diagnosi Malattie DNA - Prerequisiti Conoscenza gene/i • Identificazione della specifica mutazione By NA 60 Conoscenza geni Mendeliane • • • • By NA Talassemia Fibrosi cistica Chorea di Huntington Distrofia di Duchenne Complesse (loci suscettibilità) • • • • ApoE Alzheimer 19p13;Xq24 Cefalea 12q;2q Diabete NID 3q21 Psoriasi 61 Conoscenza geni 8000 malattie geni noti 30% (60-70% pazienti) By NA 62 Diagnosi Malattie DNA - Prerequisiti • Conoscenza gene/i implicati Identificazione della specifica mutazione By NA 63 Distrofia Muscolare di Duchenne (DMD) •Una delle più comuni malattie genetiche dell’infanzia •Ubiquitariamente diffusa nel mondo •Colpiti pressochè esclusivamente maschi •Ereditata come malattia recessiva X-linked Si manifesta con debolezza muscolare progressiva. I muscoli mostrano una pseudo-ipertrofia, molto evidente nel polpacci: in realtà le fibre muscolari sono rimpiazzate da tessuto grasso/adiposo. By NA 64 DIAGNOSI DMD • Progressiva perdita muscolare e debolezza. • Ridotta contrazione muscolare. • Incurvamento della colonna vertebrale. • Posizionamento doloroso delle articolazioni. • Difficoltà nei movimenti quotidiani. By NA livelli CK Biopsia muscolare 65 DIAGNOSI DMD • ANALISI DI DELEZIONE (60% circa dei casi): – PCR multipla per 26 esoni dei 79 presenti nel gene. – Evidenziazione degli amplificati su gel-elettroforesi – Si diagnostica la delezione quando un prodotto di amplificazione è assente in due separate reazioni di amplificazione. • ANALISI COMPLETA DEL GENE: – Se non è presente una delezione ampia, allora si ricorre ad uno studio dettagliato del gene mediante tecniche analitiche, sino al sequenziamento diretto. – Una volta trovata la mutazione nel probando, è possibile testare rapidamente qualsiasi soggetto della famiglia a rischio. By NA 66 MULTIPLEX P.C.R. By NA 67 DIAGNOSI DMD Paziente di 27 anni in gravidanza con fratello affetto da DMD Analisi Fratello Delezione degli esoni 45-52 Studio familiare di linkage (Analisi Aplotipo con marcatori intragenici) Paziente Portatrice della Mutazione By NA 68 DIAGNOSI DMD Paziente 27 anni portatrice in gravidanza Prelievo dei Villi coriali a 10 settimane 90% dei villi ESTRAZIONE DNA Analisi molecolare con PCR multipla By NA 10% dei villi (se possibile) Analisi cariotipo 69 DIAGNOSI DMD Paziente di 23 anni in gravidanza con due nipoti deceduti per DMD Studio familiare di linkage (Analisi Aplotipo con marcatori intragenici) By NA 70 DIAGNOSI DMD By NA 71 DIAGNOSI DMD Paziente non Portatrice dell’Aplotipo associato alla DMD DIAGNOSI PRENATALE NON NECESSARIA !!! By NA 72 DIAGNOSI DMD Paziente di 26 anni in gravidanza (13 settimane) con due figli affetti da DMD Analisi Figli No Delezione degli esoni Studio di linkage By NA 73 DIAGNOSI DMD Aplotipo fetale ricombinante Rischio DMD per il feto: 14% (62/79 esoni derivano dal materno normale) By NA 74 Fibrosi cistica 1000 variazioni di sequenza - 83% (>800) mutazioni - 17% polimorfismi Caucasici 70% F508 By NA 75 By NA 31 Mutazioni più frequenti D.R. = 80% 76 Caratterizzazione clinica complessa Ragazza 17 anni Alla età di 12 anni: Iridi stellate Ritardo mentale Personalità cocktail party By NA s. Williams 77 • Dismorfismo faciale (“elfin facies”) • Ritardo di crescita pre e postnatale • Deficit cognitivi (alt. integrazione spazio-visiva); lieve RM • Stenosi aortica sopravalvolare, s. polmonare, difetti di setto, prolasso mitrale • Ipercalcemia infantile DELEZIONE 7q11.23 gene ELN By NA SINDROME DI WILLIAMS 78