• • macronutrienti carboidrati (zuccheri) lipidi (grassi) • proteine • vitamine • micronutrienti • minerali macroelementi Na K Cl Ca Mg P microelementi I Fe Mn Cr Mo Se liquido acqua metanolo etanolo acetone benzene cloroformio T fusione °C 0 -94 -117 -93 5 -63 T ebollizione °C 100 65 78 56 80 62 calore evapor. cal/g 540 263 204 125 94 59 costante dielettrica 80 33 24 21 2 5 orbitale ibrido sp3 Modello spaziale e sezione della mioglobina aa idrofobici aa polari REAZIONE NON CATALIZZATA Substrato (bastoncino) Stato di transizione (bastoncino piegato) Energia libera G ENERGIA Prodotto (bastoncino rotto) REAZIONE CATALIZZATA DA UN ENZIMA E si formano molte interazioni fra l’enzima e il substrato ENERGIA ES E Energia libera G ENERGIA non cat. AUMENTO DELLA VELOCITA’DI UNA REAZIONE CATALIZZATA DA UN ENZIMA Ciclofilina 105 Carbonico anidrasi 107 Trioso fosfato isomerasi 109 Carbossipeptidasi A 1011 Fosfoglucomutasi 1012 Succinil-CoA transferasi 1013 Ureasi 1014 Orotidina monofosfato decarbossilasi 1017 Cinetica delle reazioni enzimatiche Leonor Michaelis, Maud Menten (1913) Una reazione catalizzata da enzimi si divide in due fasi: La demolizione del complesso enzima – substrato con formazione del prodotto finale La formazione del complesso enzima – substrato E + S k1 k-1 ES ES Tappa veloce E + S k1 k-1 ES k2 k-2 k2 k-2 E + P Tappa lenta E + P (condiziona la vel. complessiva della reazione) L’equazione globale della reazione è la seguente: E + S k1 ES k2 E + P k-1 k-2 dove, nella parte iniziale della razione, la concentrazione di P è bassa e quindi k-2 è trascurabile La relazione tra [S] e V espressa in termini quantitativi deve tenere conto di: [S], V0, Vmax e le diverse costanti di dissociazione k1, k-1, k2 che risultano raggruppate nella COSTANTE DI MICHAELIS MENTEN (Km) Km = (k2 + k-1) / k1 L’equazione della curva che ne deriva è data da: V0 = Vmax [S] Km + [S] EQUAZIONE DI MICHAELIS MENTEN ENZIMI REGOLATORI Generalmente la prima delle reazioni di un ciclo è catalizzata da un enzima regolatore, che quindi “regola” la velocità dell’intero ciclo treonina Retroinibizione (Inibizione da feedback) isoleucina NAD+ (ac. nicotinico o niacina, vitamina B ) 3 FAD (riboflavina, vitamina B2) COENZIMA A (vitamina B5) TIAMMINA PIROFOSFATO (tiammina, vitamina B1) - Gly - Pro - X - Gly - X - Hyp - Res. % Gly Pro Hyp/Hyl Ala 35 12 10 10 d 1.5 nm l 300 nm passo 0.3 nm (3 res. aa)