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short-Riport 41
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Agosto 2015
www.risch.ch
Identificazione dei patogeni responsabili di diarrea acuta
batterica in ambito ambulatoriale
Introduzione
Tra i pazienti ambulatoriali la diarrea acuta infettiva rappresenta un problema frequente. Di norma si tratta di una patologia
autolimitante, che porta alla consultazione medica solo in via
eccezionale e nei casi più severi. Per chiarire l'eziologia della
diarrea acuta da infezione batterica nei pazienti ambulatoriali,
si procede solitamente alla messa in coltura di campioni fecali
per l'indagine batteriologica. Come previsto dal tariffario analitico federale vigente, la coprocoltura ricerca in modo selettivo
la presenza di Campylobacter spp., Salmonella spp. e Shigella­
spp. Si tratta di un procedimento ben consolidato, spesso
considerato «gold standard». Nei casi positivi esso consente di
identificare l'agente patogeno e di eseguire ulteriori indagini di
rilevanza epidemiologica (per es. la sierotipizzazione) nonché i
saggi di resistenza. La realizzazione sistematica di coprocolture
richiede però molto tempo. Solitamente, i primi risultati sono disponibili solo a 24 - 48 ore di distanza dall'arrivo del campione in
laboratorio. Questo lasso di tempo è tutt'altro che trascurabile
in caso di necessità di ricovero del paziente con l'assunzione
dei costi secondo il sistema di rimborso forfettario DRG.
Attualmente i sistemi analitici integrati di biologia molecolare
consentono di analizzare rapidamente i campioni fecali per individuare l'eventuale presenza di Campylobacter jejuni / coli,
Salmonelle, Shigelle / Escherichia coli enteroinvasiva (EIEC) ed
Escherichia coli enteroemorragica (EHEC). Dai dati di cui disponiamo, si evince che queste tecniche sono di gran lunga
più sensibili della coltura (v. Figura 1), in particolare dopo terapia
Cosa c'è di nuovo?
La novità è che dal 1° giugno 2015, con la richiesta clinica
URGENTE di «Esame batteriologico delle feci», tutti i campioni
fecali verranno sottoposti innanzitutto alla ricerca di Campylobacter, Salmonelle, Shigelle / EIEC e EHEC con tecniche di biologia molecolare. I risultati dell'esame saranno disponibili
la mattina del giorno successivo! Se l'esito dell'esame è negativo, sarà sostanzialmente possibile escludere che i quattro
gruppi di patogeni menzionati siano coinvolti nell'eziologia della
diarrea acuta 1.
Se invece il risultato è positivo, sul medesimo campione si procederà ad una coprocoltura mirata: il patogeno isolato sarà tipizzato (Salmonelle, Shigelle) e sottoposto a saggio di resistenza (Campylobacter, Salmonelle, Shigelle).
Abbinando le moderne tecniche di genetica molecolare con i
procedimenti tradizionali fondati sulla coprocoltura, riusciamo a
ridurre notevolmente il tempo di refertazione, senza rinunciare
ai vantaggi offerti dalla coltura (tipizzazione dell'agente patogeno e saggio di resistenza). Includendo l'EHEC, riusciamo inoltre
ad ampliare la gamma dei patogeni ricercati di routine, includendo ceppi finora verosimilmente sottovalutati 2.
+26 %
70
Numero campioni PCR positivi
antibiotica e in caso di scarsa densità del patogeno nel campione clinico 1.
Coltura -
60
Coltura +
50
40
30
20
+8 %
+62 %
Salmonelle
Shigelle / EIEC
10
0
Campylobacter
Figura 1: confronto tra campioni fecali positivi alla PCR totale e i risultati delle coprocolture: con PCR (1), si consegue un notevole miglioramento del tasso di detezione
di Shigella sp. / EIEC (+62%), Campylobacter jejuni / coli (+26%) e Salmonella sp. (+8%).
ISO 17025 / Nr. STS 177
akkreditiert durch SAS *
ISO 9001 / Nr. 13231
zertifiziert durch SQS *
Eventuali risultati discordanti, ad es. campioni positivi alla PCR
e negativi alla coprocoltura, saranno valutati caso per caso, in
funzione dei dati clinico-anamnestici sul paziente. In alcuni casi potrà essere necessario inviare un ulteriore campione fecale
e / o procedere alla ricerca di altri agenti eziologici. Siamo a vostra disposizione per eventuale consulenza.
Bibliografia
1Wohlwend N. et al. Clinical evaluation of a multiplexed real-time PCR assay
for identification of four leading bacterial pathogens of acute gastroenteritis
in stool specimens (Abstract). European Congress of Clinical Microbiology
and Infectious Diseases, April 25-28, 2015, Copenhagen, Denmark.
2
UFSP. Escherichia coli enteroemorragica (EHEC), dati epidemiologici in
Svizzera dal 1996 al 2006. Bollettino dell'UFSP 2008; 14: 240
Materiale analitico
Campione fecale in kit per infezione intestinale (B16), consistente in 3 flaconcini (feci native / SAF / Cary Blair)
Disponibilità
Dal lunedì al sabato mattina
Dal lunedì al venerdì i risultati sono disponibili per il mattino del
giorno successivo, per campionamenti al sabato invece i risultati sono disponibili il lunedì mattina successivo.
Fatturazione
La fatturazione avviene sulla base dell'Elenco federale delle
analisi secondo le seguenti tariffe:
3326.00
Feci, Salmonelle, Shigelle, Campylobacter,
negativo
78 TP
3327.00
Feci, Salmonelle, Shigelle, Campylobacter, 155 TP
positivo
3342.00
Ricerca addizionale di un germe
particolare (EHEC), negativo
22 TP
3343.00
Ricerca addizionale di un germe
particolare (EHEC), positivo
70 TP
Su questa base, per la ricerca di quattro batteri patogeni intestinali vengono fatturati 100 TP (78 + 22 TP) in caso di risultato
negativo, 177 TP (155 + 22 TP) o 148 TP (78 + 70 TP) in caso di
risultato positivo. La nostra tariffa positiva comprende l'identificazione in biologia molecolare del ceppo del patogeno, l'identificazione del patogeno attraverso una coltura mirata, l'eventuale
sierotipizzazione (in caso di Salmonelle e Shigelle) e il saggio di
resistenza (Campylobacter, Salmonelle, Shigelle).
Medico responsabile del contenuto
PD Dr. med. Thomas Bodmer · Specialista FAMH
Microbiologia medica PD Dr. med.
Prof. Dr. med. Lorenz Risch, MPH · Medicina Interna FMH ·
Specialista di laboratorio FAMH