calr mutation - AB Analitica

GENEQUALITY
CALR MUTATION
Cod. 04-40
Kit per la rilevazione delle mutazioni
nell’esone 9 del gene CALR
INTRODUZIONE
Le neoplasie mieloproliferative (MPN) sono causate
dall’insorgenza di mutazioni nelle cellule staminali
ematopoietiche. I
soggetti
con MPN
mostrano
caratteristiche cliniche e molecolari comuni che conducono
a complicazioni tromboemboliche e un alto rischio di
sviluppare leucemie. In pazienti con MPN che non
presentano mutazioni nei geni JAK-2 e MPL sono state
identificate differenti mutazioni somatiche localizzate
nell’esone 9 del gene codificante la calreticulina (CALR).
Le mutazioni a carico del geni CALR, JAK-2 e MPL sono
mutuamente esclusive tra loro.
CALR è una proteina multifunzionale altamente
conservata. Le mutazioni nell’esone 9 sono localizzate
nella regione C-terminale della proteina e conducono ad
alterazioni nel folding delle proteine neo-sintetizzate e in
differenti processi biologici tra cui la proliferazione cellulare,
l’apoptosi e l’eliminazione di cellule immunogeniche.
Le mutazioni nell’esone 9 del gene CALR sono molto
numerose e di vario genere (delezioni, inserzioni e
complessi di inserzioni + delezioni). Tra queste le più
frequenti sono la mutazione di tipo 1 (delezione di 52 bp) e
la mutazione di tipo 2 (inserzione di 5 bp).
La metodica utilizzata nel kit consente la rilevazione delle
mutazioni di tipo 1, di tipo 2 e le mutazioni rare che
producono delezioni o inserzioni ≥4 bp rispetto alla
sequenza WT. Per ulteriori approfondimenti diagnostici,
vengono forniti nel dispositivo i primers per effettuare il
sequenziamento bidirezionale dell’amplificato prodotto.
CARATTERISTICHE TECNICHE
Il dispositivo è in grado di rilevare mutazioni di tipo 1, di tipo
2 e le mutazioni rare che producono delezioni e/o inserzioni
≥4 bp rispetto alla sequenza WT.
Accuratezza: 100%.
Sensibilità Analitica: è stata determinata mediante
l’amplificazione di diverse miscele di DNA mutato (DNA
sintetico per la mutazione di tipo 1 e di tipo2) in differenti
background di DNA wild-type. Da tali prove il sensibilità
analitica è risultata essere pari al 10%.
PROCEDURA
ESTRAZIONE
DNAESTRATTO
AMPLIFICAZIONE
unica mastermix pronta all’uso
VISUALIZZAZIONE IN GEL DI AGAROSIO AL 4%
INFORMAZIONI PER GLI ORDINI
Cod
Prod
Confez.
04-40A
GENEQUALITY CALR MUTATION
GENEQUALITY CALR MUTATION
amplification reagents
50 test
04-40R
PRODOTTI CORRELATI
Cod
RQ-S51-48/96A
RQ-S51S-48/96
Numero di test: 50 test.
RQ-S81-48/96
Stabilità: 12 mesi.
Materiale di partenza: DNA estratto da sangue periferico
o midollare; granulociti.
50 test
04-26A-25/50
04-26R-25/50
Prod
Confez.
REALQUALITY
RS-JAK-2 V617F
REALQUALITY
RS-JAK-2 V617F
variante screening
REALQUALITY
RS-JAK-2 V617F Q
GENEQUALITY JAK-2
GENEQUALITY JAK-2
amplification reagents
48/96 test
48/96 test
48/96 test
25/50 test
25/50 test
Regione amplificata: esone 9 del gene CALR.
Amplificazione: PCR single step.
Controlli positivi: 3 controlli positivi (WT, mutazione di
tipo 1 e di tipo 2).
Rilevazione: gel di agarosio al 4%.
Specificità analitica: assenza di appaiamenti aspecifici
dei primers.
REFERENZE
Nangalia J, N Engl J Med. 2013; 369:2391-405.
Klampfl T, N Engl J Med. 2013; 369:2379-90.
Tefferi A, Leukemia 2014 Jan 20.
Vannucchi AM, Leukemia 2014 Mar 12.
Specificità diagnostica: 100%.
Sensibilità diagnostica: 100%.
GQ-CALR_techleaf_i20140925
AB ANALITICA srl
Via Svizzera 16 – 35127 PADOVA – ITALIA Tel 049 761698 - Fax 049 8709510
e-mail: [email protected]
www. abanalitica.it