BIC 2011 correlazioni giugno ver 4

Esame svizzero di maturità
Sessione giugno 2011
ESAME DI MATURITÀ
Opzione specifica biologia e chimica
giugno 2011
U
CORRELAZIONI
Cognome: . . . . . . . . . .
Nome:
..........
Gruppo:
Numero:
..........
..........
Tempo a disposizione:
60 minuti
Punteggio correlazioni: 60 punti.
Sussidi ammessi:
tavola periodica non annotata,
raccolta formule (Tables numériques o Formeln und Tafeln)
calcolatrice tascabile ad alimentazione autonoma, con visore che
mostra una sola riga di caratteri alfanumerici
Le risposte vanno scritte sui fogli dell’esame nei riquadri appositi; se doveste aver bisogno di altro
spazio, usate i fogli ufficiali.
Ogni blocco o foglio singolo deve portare cognome, nome, gruppo e numero del
candidato.
Risposte a matita e/o su fogli senza il timbro non verranno considerate.
Le risposte alle domande dovranno essere concise, chiare e il linguaggio il più rigoroso possibile.
Risposte evasive, poco chiare verranno penalizzate!
Risultati numerici, senza una traccia dei calcoli svolti, non verranno ritenuti validi.
È richiesto ovunque il corretto uso delle unità di misura e della simbologia chimica.
Al termine dell’esame, il candidato raccoglie ed ordina i fogli che inserisce nella cartelletta.
BUON LAVORO!
1
Esame svizzero di maturità
Sessione giugno 2011
Le proteine sono macromolecole e sono i costituenti fondamentali di tutte le cellule animali e vegetali.
Per comprendere il ruolo che svolgono è indispensabile conoscere le loro strutture. La principale è la
struttura primaria, ovvero la sequenza degli amminoacidi.
Se si vuole determinare la struttura primaria di una proteina, solitamente prima si fa un’idrolisi completa a
110°C per 24 h con una soluzione di acido cloridric o concentrato (ca. 6 M). La soluzione ottenuta viene
analizzata per mezzo di un cromatografo.
Quale informazione si ottiene con questo passaggio?
[2]
Se nella sequenza vi dovesse essere la presenza di ponti di idrogeno, questi vengono rotti completamenti
durante l’idrolisi? Motivare.
[3]
E se vi è un ponte disolfuro? L’aggiunta di HCl basterebbe a romperlo? Motivare.
[2]
Dopo questo primo passaggio però non si conosce ancora nulla della sequenza.
Per scoprire qual è l’amminoacido iniziale, solitamente alla proteina viene aggiunto il 2,4dinitrofluorobenzene, detto anche reattivo di Sanger. Il reattivo di Sanger reagisce con il gruppo
(eventualmente gruppi) amminico terminale. Se ora si ripete l’idrolisi completa della proteina fatta reagire
otteniamo un amminoacido, quello iniziale, marcato, che viene facilmente riconosciuto.
2
Esame svizzero di maturità
Sessione giugno 2011
Disegni la struttura in forma semplificata del reattivo di Sanger.
[4]
Ora una possibilità è quella della logica sequenziale, ovvero far digerire da enzimi (o molecole) specifici la
nostra proteina (v. tabella sotto) ed analizzare poi la soluzione ottenuta.
Enzima
Tripsina
Chimotripsina
bromuro di cianogeno
Carbossipeptidasi
Proteasi V8
Sito della scissione
gruppo carbonilico di Lys e Arg
gruppo carbonilico di Phe, Tyr e Trp
gruppo carbonilico di Met
L’amminoacido C-terminale (ultimo amminoacido)
gruppo carbonilico di Asp e Glu
Cosa otterremo dopo che un enzima avrà reagito con la nostra proteina?
[2]
Facciamo ora un esempio per cercare di capire come funzioni la determinazione della struttura primaria di
oligopeptide.
Se trattassimo un oligopeptide con l’enzima chimotripsina otteniamo i tre frammenti:
Ala-Gly-Tyr e Trp e Ser-Lys-Gly-Leu-Met-Gly
Lo stesso oligopeptide trattato con tripsina dà i seguenti frammenti:
Ala-Gly-Tyr-Trp-Ser-Lys e Gly-Leu-Met-Gly
Trattando infine l’oligopeptide con bromuro di cianogeno otteniamo un nonapeptide e della Gly.
Ora utilizzando le informazioni ottenute e sovrapponendo i frammenti otteniamo che la sequenza del
peptide è:
Ala-Gly-Tyr-Trp-Ser-Lys-Gly-Leu-Met-Gly
Il metodo appena descritto sembra complicato a prima vista, ma risulta più veloce rispetto a trattare
direttamente una proteina con la degradazione di Edman. Questo metodo permette di tagliare dalla
proteina un solo amminoacido (N-terminale) alla volta ed i poterlo analizzare con semplici tecniche
analitiche.
3
Esame svizzero di maturità
Sessione giugno 2011
Ora provi lei a risolvere il seguente problema d’analisi logica sequenziale.
La bradichinina è un nonapeptide prodotto dalle globuline del plasma sanguigno in risposta ad una
puntura di vespa. È costituita da due frammenti di Arg, una Gly, due Phe, tre Pro e una Ser. L’impiego
del 2,4-dinitrofluorobenzene (reattivo di Sanger) e della carbossipeptidasi ha permesso di dimostrare che
ad entrambe le estremità della catena è presente arginina.
L’idrolisi acida parziale fornisce i seguenti di- e tripeptidi:
Phe-Ser + Pro-Gly-Phe + Pro-Pro + Ser-Pro-Phe + Phe-Arg + Arg-Pro
Quali saranno i primi due amminoacidi della bradichinina? E quali amminoacidi saranno gli ultimi due?
Motivi i suoi ragionamenti!
[5]
Qual è la sequenza degli amminoacidi nella bradichinina?
[5]
Motivi brevemente i suoi ragionamenti!
[5]
4
Esame svizzero di maturità
Sessione giugno 2011
In questo esercizio deve ricostruire un’ipotetica sequenza di DNA partendo dal nonapeptide analizzato
nella parte precedente. Ha due possibilità per risolvere questa parte dell’esercizio:
i.
partendo dalle informazioni che ha sviluppato precedentemente (pagina 4)
oppure
partendo dalla seguente lista di 7 amminoacidi :
ii.
Gly Phe Phe Pro Pro Pro Ser (in ordine alfabetico)
Li inserisca nello schema, rispettando la relazione con l’mRNA già impostata sotto.
SEQUENZA DI PARTENZA
Arg
Arg
a) Partendo dalla sequenza da Lei proposta aggiunga ora nello schema sottostante le sigle per i
nucleotidi mancanti :
per la ricostruzione della molecola di mRNA
[3]
5’ AU ▬/CG▬/▬ ▬A /▬ ▬ A/▬ ▬ C/▬ ▬ C/▬ ▬ ▬/ ▬ ▬ A/▬ ▬U/CGG/3’
G
U
A
G
3’
G
33
C
32
26
25
24
23
22
21
20
19
18
17
16
15
14
13
12
11
10
9
8
7
b) Spieghi in base a quale principio ha completato lo schema
U
31
A
30
C
29
C
28
A
27
A
6
G
5
2
C
4
U
3
A
1
5’
5’
[4]
3’
per la ricostruzione di una piccola parte di DNA
[2]
c) Individui una sequenza di nucleotidi 5’ → 3’ sul filamento stampo di DNA per un mRNA che codifichi la
sequenza PHE-PRO-LYS. (NB: Scelga una variante e motivi chiaramente).
[4]
i.
ii.
iii.
iv.
v.
5’ UUUGGGAAA 3’
5’ AAA CCC UUU 3’
5’ CTT CGG GAA 3’
5’ GAACCCCTT 3’
5’ AAAACCTTT 3’
Ho scelto la variante _____ perché…
5
Esame svizzero di maturità
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d) Riassuma le funzioni svolte dall’RNA compilando la seguente tabella
Tipo di RNA
RNA messaggero
[4]
Funzioni
Svolge funzioni catalitiche e strutturali durante la
traduzione dell’informazione genetica.
Trascritto primario
t RNA
e) Come si differenzia lo svolgimento della sintesi proteica di una cellula procariotica rispetto a una
cellula eucariotica ?
[3]
f)
Quale dei componenti elencati NON è direttamente coinvolto nella traduzione. (NB: Scelga una
variante e motivi chiaramente).
[4]
i) mRNA  ii) DNA  iii) tRNA  iv) ribosomi  v) GTP
Ho scelto la variante _____ perché…
g) Che processi subisce la bradichinina dal momento che si stacca dal ribosoma a quando è secreta
dalla cellula dopo la puntura di un insetto?
[4]
6
Esame svizzero di maturità
Sessione giugno 2011
h) Avrebbero le stesse conseguenze due mutazioni che sostituissero :
i.
il nucleotide in 3° posizione con una adenina (s ostituzione G→A) ?
ii.
oppure il nucleotide in 30° posizione con una a denina (sostituzione G→A) ?
ALLEGATO:Codice genetico
7
[4]