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Struttura e funzioni della cellula Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 1 NB Queste diapositive sono state preparate per il corso di Biofisica tenuto dal Dr. Attilio V. Vargiu presso il Dipartimento di Fisica nell’A.A. 2014/2015 Non sostituiscono il materiale didattico consigliato a piè del programma. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 2 Riferimenti • Books and other sources • Biological Physics (updated 1st ed.), Philip Nelson, Chap. 2 • Physical Biology of the Cell (2nd ed.), Phillips et al., Chap. 2 • Understanding DNA (3rd ed.), Calladine et al., Chap. 2 • Biochemistry (5th ed.), Berg et al., Chap. 5 • http://www.chem.uiuc.edu/CLCtutorials/104/ AminoAcidTitrations/SeeIt.html • Movies • Exercise Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 3 Dimensioni mondo (sub)cellulare Cellula unità fondamentale degli organismi viventi evoluti (~1020 in ognuno di noi) Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 4 Evoluzione cellulare Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 5 Struttura di batterio (procariote) Più piccole e semplici delle cellule eucariote (1-100 micron) • Capsula: rivestimento esterno • Parete cellulare: rivestimento intermedio (più rigido della capsula) • Membrana cellulare: strato interno sottile e fluido • Citoplasma: contiene gli organi interni • Nucleoide: singolo filamento di DNA • Pili: permettono adesione agli oggetti esterni • Flagelli: permettono il movimento (nuoto) • Ribosomi: assemblaggio proteine Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 6 “Stile di vita” procariote • unicellulari: solitari • colonie: formano biofilm • filamentosi: catene di cellule Nutrizione • Fotosintesi • Patogeni: si nutrono di altri organismi viventi • Decompositori: si nutrono di materia morta Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 7 Struttura di una cellula eucariote Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 8 Struttura di una cellula eucariote • Organelli • Cromosomi • Multicellulari Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 9 Struttura di una cellula eucariote Membrana cellulare “pelle” delicata e flessibile contenente fosfolipidi e proteine Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 10 Struttura di una cellula eucariote Nucleo Comparto delimitato da membrana che contiene il materiale genetico (DNA) ed è provvisto di pori Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 11 Struttura di una cellula eucariote Nucleolo • Situato nel nucleo • Sito sintesi RNA ribosomiale (rRNA) • Composto da DNA, rRNA e proteine Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 12 Struttura di una cellula eucariote Mitocondri • Sorgenti di energia cellulari • Numero proporzionale al fabbisogno energetico cellulare Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 13 Struttura di una cellula eucariote Reticolo endoplasmatico • Liscio: sede sintesi lipidi e carboidrati • Ruvido o rugoso: una delle sedi sintesi proteica, contiene ribosomi ancorati alla sua membrana Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 14 Struttura di una cellula eucariote Ribosomi • Assemblano proteine a partire da amminoacidi • Si trovano sia nel reticolo endoplasmatico sia nel citoplasma Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 15 Struttura di una cellula eucariote Apparato del Golgi • Processa i prodotti che arrivano dal reticolo endoplasmatico all’interno di cisterne • lndirizza i prodotti ai vari apparati cellulari Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 16 Struttura di una cellula eucariote Lisozimi • Cisterne contenenti enzimi digestivi • Digerisce nutrienti assorbiti dalla cellula • Digerisce componenti cellulari malfunzionanti o esauste Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 17 Struttura di una cellula eucariote Centrioli • Coppie di tubi annodati fra loro • Organizzano e assistono la divisione cellulare Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 18 Struttura di una cellula eucariote Citoscheletro • Fatti da microtubuli • Fitta rete attraversa il citoplasma • Mantiene la forma cellulare e sostiene gli organelli Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 19 Cellula eucariote vegetale Parete cellulare • Molto resistente (cellulosa) • Incollata alle pareti cellulari delle cellule adiacenti Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 20 Cellula eucariote vegetale Vacuoli • Grandi cisterne contenenti acqua • Contribuisce a mantenere pressione cellulare • Siti stoccaggio amidi Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 21 Cellula eucariote vegetale Cloroplasti • Contengono clorofilla • Convertono energia solare in energia chimica tramite fotosintesi Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 22 Anatomia cellulare Componente Funzione Procarioti Eucarioti Capsula Protezione contro agenti esterni (associata a patogenicità) Si No Parete cellulare Preservare composizione, forma, e struttura interna Si Si nelle cellule vegetali e nei funghi, non in cellule animali Membrana cellulare Controllo flusso sostanze Si Si Organelli Funzioni varie No Si Nucleo (organello) Mitocondri/ Cloroplasti Ribosomi Contiene materiale genetico Produzione e stoccaggio molecole energetiche Assemblaggio proteine No Si Si Si, clorosplasti solo in cellule vegetali Si No Si Si No Cromosomi Stoccaggio DNA (replicazione) Nucllide Stoccaggio DNA (singolo filamento) No Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 23 Anatomia cellulare • Cellule eucariote in generale più grandi e diversificate per geometria e grandezza. • Architettura cellulare qualitativamente conservata nei diversi tipi di cellule. • Insieme di funzioni basilari comuni a tutti i tipi di cellule. • Differenti tipi cellulari negli organismi più complessi (multicellulari): – Funzioni specialistiche in aggiunta alle funzioni basilari – Cellule organizzate per lavorare in maniera cooperativa nei tessuti – Tessuti danno vita a organi Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 24 Alcune cellule nel corpo umano… Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 25 Fisiologia cellulare Fisiologia: insieme di aspetti fisici delle funzioni e strutture cellulari. – Trasduzione di energia chimica o radiazione in energia meccanica o in sintesi (metabolismo). – Creazione e alterazione propria struttura interna e mattoni fondamentali (proteine, lipidi, ecc.). – Replicazione (mitosi, meiosi). – Mantenimento composizione interna e concentrazioni ioniche (diffusione passiva, attiva, ecc.). – Motilità. – Percezione (sensing): controllo, nutrizione, difesa, attacco, riconoscimento molecole di segnale, controllo allosterico, apoptosi, ecc. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 26 Composizione molecolare Strutture descritte composte da mattoni fondamentali • Atomi – solo alcuni (su oltre cento) sono presenti in quantità apprezzabili nel corpo umano: O, N, C, H, P, S. Anche alcuni ioni come H+, Na+, K+, Cl-, Ca2+, ecc. – Altri (Fe, Ni, Cu) presenti in quantità molto limitate. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 27 Composizione molecolare Strutture descritte composte da mattoni fondamentali Molecole – Acqua (70% della nostra massa corporea) – Acido fosforico disciolto in ione fosfato e due protoni (H3PO4 ⇔ HPO42- + 2H+) – Zuccheri semplici (glucosio, ribosio, saccarosio) – Nucleobasi (pirimidine e purine) – Nucleotidi (ATP, dGTP, cAMP, ecc.) – Acidi grassi e fosfolipidi (POPC, DPPC, ecc.) – Amminoacidi Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 28 Carboidrati o glucidi • Molecole contenenti C, H e O, aventi formula generica Cm(H2O)n e rapporto H:O uguale in genere a 2:1. – Eccezioni esistono, come il deossiribosio, componente del DNA e con formula C5H10O4. • Importanti come fonte di energia nel metabolismo. • Livello di complessità strutturale molto maggiore delle altre macromolecole. • In biochimica sinonimo di saccaridi: – Monosaccaridi – Disaccaridi – Oligosaccaridi – Polisaccaridi Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 29 Carboidrati monosaccaridi • (CH2O)n n≥3 (glucosio, fruttosio, ribosio). • Importanti sorgenti di energia (sintesi ATP) e mattoni acidi nucleici. • Strutture ad anello con 5 e 6 atomi (1 ossigeno). • Stereochimica: α o β. α-D-Glucopyranose β-D-Glucopyranose Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 30 Carboidrati monosaccaridi • (CH2O)n n≥3 (glucosio, fruttosio, ribosio). • Importanti sorgenti di energia (sintesi ATP) e mattoni acidi nucleici. • Strutture ad anello con 5 e 6 atomi (1 ossigeno). • Esistono come miscela di strutture cicliche e aperte. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 31 Carboidrati disaccaridi • Legame glicosidico: fra carboidrato e altro gruppo funzionale (es.: alcool). • Disaccaridi sono dimeri di monosaccaridi (lattosio, saccarosio, maltosio) uniti tramite legame glicosidico di tipo α o β. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 32 Carboidrati disaccaridi • Legame glicosidico tra due monosaccaridi (lattosio, saccarosio, maltosio) • Prima riserva di energia Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 33 Carboidrati oligo/polisaccaridi • Oligosaccaridi: [Cm(H2O)n]x, x compreso generalmente fra 3 e 9. – Possono formare legami covalenti con amminoacidi in glicoproteine (presenti sulle membrane e nel citosolo) e con lipidi nei glicolipidi. – Hanno un ruolo nelle interazioni inter-cellulari. • Polisaccaridi: Cm(H2O)n con m≥200. – Cellulosa, amidi, glicogeno, pectina, chitina, ecc. – Le capsule secrete da alcuni batteri sono composte da spessi strati di polissaccaridi che ricoprono gli antigeni, ostacolando la risposta immunitaria. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 34 Carboidrati oligo/polisaccaridi Amido: polisaccaride del glucosio • Riserva fondamentale di energia nelle piante. • Due strutture principali: • Amilosio, catena lineare (struttura elicoidale) tramite legame glicosidico α-1,4. • Costituisce circa 20% della struttura dell’amido. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 35 Carboidrati oligo/polisaccaridi Amido: polisaccaride del glucosio • Riserva fondamentale di energia nelle piante. • Due strutture principali: • Amilopectina, presenta ramificazioni tramite legame glicosidico α-1,6. • Rapporto tra legami 1,6 e 1,4 circa 1/24-30. • Costituisce circa 80% della struttura dell’amido. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 36 Carboidrati oligo/polisaccaridi Glicogeno: polisaccaride del glucosio • Riserva fondamentale di energia negli animali. • Struttura simile all’amilopectina, ma più ramificata (rapporto fra legami α-1,6 e α-1,4 circa 1/10). • Sintetizzato a partire dalla proteina glicogenina. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 37 Carboidrati oligo/polisaccaridi Cellulosa: polisaccaride del glucosio • Componente strutturale fondamentale del regno vegetale. • ~1015 Kg sintetizzati e degradati ogni anno sulla Terra. • Struttura planare dovuta a legami glicosidici β-1,4, funzionale per costruire fibre ad alta resistenza. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 38 Carboidrati oligo/polisaccaridi Differenza fra legame α-1,4 e β,1-4 • Le strutture aventi legami α-1,4 tendono ad assumere una conformazione elicoidale. • Le strutture costruite da legami β-1,4 tendono ad assumere strutture lineari e formare piani tramite legami idrogeno. Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 39 Nucleobasi, nucleosidi e nucleotidi • Basi degli acidi nucleici: 5 tipi fondamentali • 2 classi: purine (2) e pirimidine (3) Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 40 Nucleobasi, nucleosidi e nucleotidi DNA: A, G, C, T Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 41 Nucleobasi, nucleosidi e nucleotidi RNA: A, G, C, U Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 42 Nucleobasi, nucleosidi e nucleotidi • Una base legata covalentemente (legame glicosidico) a una molecola di (deossi)ribosio o si chiama (deossi)nucleoside. • La glicosilazione avviene sempre fra l’atomo C1’ dello zucchero e gli atomi N9 (purine) o N1 (pirimidine) delle nucleobasi. 5’ 3’ 1’ Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 43 Nucleobasi, nucleosidi e nucleotidi • Si definisce nucleotide un nucleoside legato a uno o più gruppi fosfato. 5’ • 5’ o 3’ a seconda della posizione in cui avviene la sostituzione. 5’ 3’ 1’ 5’ 3’ 3’ 5’-ATP Adenosine Tri-Phosphate 3’-dGMP deoxyGuanosine Mono-Phosphate Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 44 Amminoacidi • 21 tipi diversi di α-aminoacidi negli eucarioti • Scheletro comune, diverse catene laterali R • Zwitterionici in soluzione (terminali amino e carbossile) Neutro Zwitterionico Amina (base) Carbossile (acido) Catena laterale Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 45 Amminoacidi Molecole chirali (non sovrapponibili a propria immagine allo specchio) Enantiomers • Enantiomeri (isomeri ottici) D e L • Tutti gli aminoacidi esistono nella forma L durante la traslazione. • Enantiomeri D da processi post-traslazionali, nel peptidoglicano, come neurotrasmettitori... Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 46 Chiralità Esiste piano di simmetria Se una molecola possiede un piano di simmetria, un centro di inversione e un asse improprio di rotazione non può essere chirale. Non c’è nessun piano di simmetria Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 47 Chiralità Chiralità parametro essenziale nell’interazione con altre molecole e con componenti cellulari L carvone (profumo di menta) R carvone (profumo di cumino) Recettori dell’olfatto contengono gruppi chirali! Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 48 Chiralità Chiralità parametro essenziale nell’interazione con altre molecole e con componenti cellulari L methorphan (analgesico) R methorphan (sedativo tosse) Molecole con diversa chiralità possono interagire o meno con recettori aventi diverse funzionalità Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 49 Amminoacidi Maggior parte sono idrofobici • Alifatici: A, V, I, L, M • Aromatici: F, Y, W Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 50 Amminoacidi Altri polari: S, T, N, Q (pH 7.4) Carichi (pH 7.4): • +: R, H, K • -: D, E Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 51 Amminoacidi “Speciali” • C: contiene il gruppo tiolo (SH), è polare e utilizzata per legami disulfidici • G: idrogeno come catena laterale, unico achirale • P: la catena laterale include il legame C-N (idrofobica) Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 52 Amminoacidi Diversi gruppi funzionali rappresentati Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 53 Amminoacidi Nomenclatura atomi carbonio catena laterale In alcuni casi gruppo ammino legato al carbonio β o γ, da cui β/γ-amminoacidi Dispense del Corso di Biofisica, Dipartimento di Fisica, Università di Cagliari. A.A.: 2014/2015. Docente: Dott. Attilio Vittorio Vargiu NB: Queste dispense non sostituiscono il materiale didattico suggerito a piè del programma! 54
