Bianca Maria Ciminelli Studio 319, lab 308 (settore H0) Tel 0672594319-4308 Mail: [email protected] Ricevimento su appuntamento Testo consigliato: Strachan e Read ‘Genetica molecolare umana’ Ed. Zanichelli Modalità di esame: Prova scritta (domande a risposta multipla e a risposta aperta) e prova orale Principali difficoltà nello studio dei caratteri genetici nell’uomo Non si possono programmare gli incroci Il tempo di generazione dello sperimentatore è uguale al tempo di generazione della specie oggetto di studio Le fratrie sono di piccole dimensioni Vantaggi Per l’uomo le conoscenze ‘mediche’ (anatomia, fisiologia, patologia ecc.) sono molto più avanzate rispetto a quelle sugli altri organismi Anche fenotipi molto rari è difficile che sfuggano all’osservazione Non sempre è facile dimostrare l’ereditarietà genetica di un carattere membri della stessa famiglia oltre a condividere una certa quota del loro patrimonio genetico condividono anche l’ambiente (alimentazione, stile di vita, interessi, esposizione a patogeni ecc.) non sempre è possibile avere informazioni dettagliate e complete sui rapporti di parentela e sul fenotipo dei vari membri di • Albero genealogico o pedigree figura che rappresenta in modo schematico individui con almeno un ascendente in comune, i loro discendenti, i loro coniugi e le relazioni di parentela che intercorrono tra di essi Sono utilizzati: per accertare se un carattere è di tipo geneticomendeliano e per stabilirne la modalità di trasmissione nella consulenza genetica (es. per calcolare il rischio di generare figli affetti o il rischio di sviluppare una determinata malattia genetica) per la mappatura genetica I PRINCIPALI SIMBOLI USATI PER LA COSTRUZIONE DEI PEDIGREE Talvolta un individuo del pedigree è contrassegnato da una freccia: è il probando cioè l’individuo attraverso cui si è arrivati alla costruzione e allo studio di quel pedigree Se si utilizzano i pedigree per stabilire le modalità di trasmissione di un carattere genetico è importante considerare la frequenza con cui il carattere in esame si presenta nella popolazione CARATTERE RARO possiamo assumere che l’allele(i) responsabile sia entrato nel pedigree una sola volta tra tutte le modalità di trasmissione compatibili con il/i pedigree in esame, consideriamo come più verosimile quella che ipotizza il minor numero di portatori indipendenti (cioè non imparentati) viceversa per CARATTERI COMUNI tale assunzione non può essere fatta Stabilire la modalità di trasmissione di un carattere COMUNE Aa aa 1 2 il pattern di trasmissione in questo pedigree è compatibile con le seguenti modalità: I aa Aa aa aa aa Aa aa 6 7 Aa aa II 1 2 aa aa 3 5 4 Aa aa aa Aa Autosomica Dominante l’allele che determina il carattere è stato introdotto solo da I-1 III Autosomica Recessiva l’allele I 2 1 Aa aa AA o Aa Aa Aa aa Aa II 1 2 3 aa III Entrambi Aa o AA 4 Aa 5 6 7 aa Aa è stato introdotto da 4 individui indipendenti (I-1, I-2, II-4 e II-7, genotipo in viola), trattandosi di un carattere comune questa assunzione è verosimile (sarebbe stata da scartare se il carattere fosse stato raro) BASANDOCI SU QUEST’UNICO PEDIGREE NON POSSIAMO SCEGLIERE TRA LE DUE IPOTESI Le generazioni sono indicate da numeri romani. Ogni individuo è identificato in modo non ambiguo da una coppia di numeri (uno romano ed uno arabo) PRINCIPALI MODALITA’ DI TRASMISSIONE DI UN CARATTERE MENDELIANO autosomica dominante autosomica recessiva X-linked dominante X-linked recessiva Y-linked mitocondriale dovuta a un gene soggetto a imprinting EREDITA’ AUTOSOMICA DOMINANTE • Maschi e femmine sono colpiti nelle stesse proporzioni • Maschi e femmine trasmettono il carattere con la stessa probabilità • Un individuo che presenta il carattere ha almeno un genitore che lo presenta • Non si osserva salto di generazione • La trasmissione si interrompe dopo una generazione in cui non ci sono affetti EREDITA’ AUTOSOMICA RECESSIVA • Maschi e femmine sono colpiti nelle stesse proporzioni • Maschi e femmine trasmettono il carattere con la stessa probabilità • Genitori normali di un individuo che presenta il carattere sono entrambi portatori • Si osserva salto di generazione • Dopo la nascita di un figlio affetto la probabilità di avere un figlio affetto è di 1/4 ad ogni gravidanza • I fratelli sani di un affetto hanno una probabilità di 2/3 di essere portatori • Se il carattere è raro molto spesso i genitori di un affetto sono consanguinei EREDITA’ X-LINKED RECESSIVA Il carattere è sempre espresso nei maschi E’ espresso nelle femmine omozigoti (molto raramente nelle eterozigoti) Una madre eterozigote lo trasmette, in media, a metà dei figli maschi Figlie femmine di una madre eterozigote hanno una probabilità di 1/2 di essere eterozigoti (portatrici) Una femmina affetta ha un padre affetto e una madre eterozigote (o affetta) Diffusione dell’allele dell’emofilia nelle famiglie reali europee EREDITA’ X-LINKED DOMINANTE Tra gli affetti il rapporto maschi:femmine è 1:2 • Il carattere è espresso nelle femmine eterozigoti e nei maschi emizigoti • Gli effetti nei maschi sono in genere più gravi • Se patologico in fasi precoci dello sviluppo si osservano alti tassi di aborto spontaneo o mortalità maschile precoce • Un maschio che presenta il carattere lo trasmette a tutte le figlie femmine e a nessuno dei figli maschi • Una donna che presenta il carattere lo trasmette, in media, alla metà dei suoi figli (sia maschi che femmine) EREDITA’ Y-LINKED trasmissione solo maschio-maschio non si conoscono (e probabilmente non esistono) patologie legate a geni del cromosoma Y (escluse quelle che riguardano la fertilità) FATTORI CHE COMPLICANO L’ANALISI DI PEDIGREE penetranza incompleta – La penetranza è la percentuale di individui che hanno il genotipo-malattia e che sono affetti. Affermare che una malattia genetica è a penetranza incompleta equivale a dire che esiste una certa quota di individui che non manifestano la malattia pur avendo il genotipo-malattia. Esempio 1. malattia Autosomica Dominante (AD) con penetranza dell’80% 100 soggetti Aa, 80 sono malati e 20 sono sani Esempio 2. malattia Autosomica Recessiva con penetranza del 70% 100 soggetti aa, 70 sono malati e 30 sono sani 2 1 1 1 2 3 2 1 3 2 3 4 4 5 5 6 6 7 8 4 ESEMPIO DI MANCATA PENETRANZA madre e figlia di II-2 presentano la stessa patologia possiamo escludere che il gamete da cui è nata III-3 portasse una mutazione fresca La penetranza incompleta è una caratteristica maggiormente frequente nelle malattie AD Il motivo per cui individui con il genotipomalattia non sono malati può essere: influenza dell’ambiente azione di altri geni (gene principale + geni modificatori) interazione gene-ambiente ESPRESSIVITA’ VARIABILE individui portatori dello stesso allele malattia presentano caratteristiche cliniche e gravità diverse Per le malattie X-linked l’espressività variabile, nelle femmine, può essere particolarmente accentuata: inattivazione del cromosoma X la gravità del quadro clinico dipende dalla proporzione di cellule che hanno mantenuto attivo il cromosoma X con l’allele anormale Espressività variabile e penetranza incompleta sono un continuum dello stesso fenomeno La penetranza incompleta è una forma estrema di espressività variabile ESPRESSIONE FENOTIPICA OGNI OVALE RAPPRESENTA UN INDIVIDUO INDIVIDUI DELLA STESSA RIGA HANNO UGUALE GENOTIPO PENETRANZA INCOMPLETA ESPRESSIVITA’ VARIABILE PENETRANZA INCOMPLETA + ESPRESSIVITA’ VARIABILE ETEROGENEITÀ GENETICA (eterogeneità di locus) malattie clinicamente uguali sono dovute a mutazioni in geni diversi Esempi classici sono la sordità non sindromica e l’albinismo cioè fenotipi alla cui determinazione concorrono numerosi eventi sequenziali, ognuno controllato da un gene, quindi il non verificarsi di uno qualsiasi di essi compromette del tutto il fenotipo finale Altri esempi: sindrome di Ehlers-Danlos (lassità di pelle e legamenti) e retinite pigmentosa: varie forme clinicamente indistinguibili ma geneticamente distinte (eredità AD, AR e X-linked recessiva); Quando si cerca di stabilire la modalità di trasmissione di una particolare malattia o si vuole mappare il genemalattia bisogna tenere presente questa possibilità e considerare che in pedigree diversi la patologia può essere causata da mutazioni in geni diversi ESEMPIO DI COMPLEMENTAZIONE NELL’UOMO (Sordità autosomica recessiva) Malattie recessive che presentano eterogeneità di locus mostrano il fenomeno della complementazione ETEROGENEITÀ GENETICA (eterogeneità allelica) mutazioni diverse dello stesso gene causano malattie diverse talvolta la differenza è quantitativa (es. Fibrosi cistica con e senza insufficienza pancreatica , CBAVD; distrofie di Duchenne e di Becker); altre volte è qualitativa alleli diversi dello stesso gene causano patologie molto diverse (es. l’insensibilità agli androgeni e l’atrofia muscolo-spinobulbare sono dovute a mutazioni differenti del gene AR che codifica il recettore degli androgeni) INSORGENZA TARDIVA penetranza dipendente dall’età I II 1 2 3 4 III II-1, II-3 e II-4 non hanno ricevuto l’allele malattia o non hanno ancora manifestato la malattia? malattia X-linked dominante letale nei maschi in alcuni casi si osserva poliabortività il rapporto sessi è alterato ma, a causa delle piccole dimensioni delle famiglie umane, generalmente è difficile dimostrarlo malattia X-linked recessiva: mutazione fresca o segregazione di un allele malattia ? Mosaicismo Presenza in un individuo di due linee cellulari geneticamente diverse ma derivanti da un unico zigote Mosaicismo somatico Mosaicismo germinale Mosaicismo somatico E germinale Mosaicismo funzionale nelle femmine dovuto a inattivazione del cromosoma X Le malattie X-linked dominanti in genere mostrano, nelle femmine, una notevole variabilità di espressione dovuta alla diversa percentuale di cellule che hanno inattivato il cromosoma X con l’allele mutante L’inattivazione del cromosoma X può anche essere responsabile dell’insorgenza di malattie X-linked recessive in femmine portatrici carattere X-linked comune: apparente trasmissione maschio-maschio esempio: daltonismo, freq. del carattere nei maschi (q) 0.08, freq. di femmine portatrici (2pq) = 0.147, quindi la probabilità di un matrimonio maschio daltonico x femmina portatrice = 0.08 x 0.147 = 0.012 EREDITA’ MITOCONDRIALE Il carattere è trasmesso solo dalle madri (eredità matrilineare) CARATTERE DETERMINATO DA UN GENE SOGGETTO A IMPRINTING NELLA MADRE (è attiva solo la copia fornita dal padre): figli di madri malate non sono mai malati; figli di padri malati hanno una probabilità del 50% di ricevere la malattia