01. i marcatori in sequenze di DNA sono rigorosi nella sintassi/definizione come i pattern o i profili PROSITE? 02. marcatori funzionali in sequenze di DNA: associati a sequenze codificanti o no codificanti? 03. illustrare le differenze tra matrici per marcatori in proteine e marcatori nel DNA 04. che importanza ha la frequenza per i marcatori funzionali, anche per quelli nel DNA? 05. scoperta di marcatori sulla base di identificazione di dati "sorprendenti": a cosa si fa riferimento? 06. è possibile ricercare siti regolativi nel DNA? Di che tipo? 07. nella predizione di promotori e siti di legame per TF, come si può evitare di cercare nell'intero genoma? 08. cosa può rendere più affidabile le predizione di REGIONI regolative? 09. oltre ai promotori, quali elementi non codificanti con un ruolo regolativo importante possono essere predetti? 10. quali approcci sono utilizzati per predire miRNA nel genoma? 11. quali approcci sono utilizzati per predire i siti target dei miRNA nei messaggeri? 12. come si possono ridurre le probabilità di associare una predizione a falsi positivi? 13. sono più conservate le sequenze dei marcatori PROSITE o dei marcatori di DNA? 14. è più importante ammettere mismatch per i marcatori PROSITE o i marcatori di DNA? 15. partendo da una sequenza proteica è possibile giungere all'identificazione del promotore?