LE PROTEINE SONO Polimeri formatidall’unione di ATOMIDI C,H,N,O CHESONO AMMINOACIDI (AA) Unititralorodal 20TIPIDIVERSI MAHANNO Catenepeptidiche STESSASTRUTTURA GENERALECON ALCENTRO SITROVA UNATOMO DICAL CENTRO Legamepeptidico UNGRUPPOR (CATENALATERALE) e’ questoche Rendediversii20AA l’uno dall’altro UNGRUPPOCARBOSSILICO-COOH Acui sono legati UNGRUPPOAMMINICO UNATOMODIH Cateneidrocarburiche e gruppi funzionali diversi LASTRUTTURADELLEPROTEINE UNAPROTEINA PUO’ESSERE FORMATA LACUISTRUTTURAVIENE DISTINTASECONDO4LIVELLI STRUTTURA PRIMARIA STRUTTURA QUATERNARIA STRUTTURA SECONDARIA UNASOLACATENA PEPETIDICA PIU’CATENE PEPETIDICHE CHESIATTORCIGLIANOSUSE STESSEOSIRIPIEGANO ASSUMENDOFORME PARTICOLARI E’LASEQUENZADEGLI AMMINOACIDICHE FORMANOUNA SINGOLACATENA PEPETIDICA STRUTTURA TERZIARIA E’ILMODOINCUIUNACATENA PEPTIDICASIDISPONENELLO SPAZIOPERESEMPIO ATTORCIGLIANDOSIASPIRALE QUANDOPIU’ CATENESI RIPIEGANOTRA LORO E’ILRISULTATODEL RIPIEGAMENTODI UNACATENA PEPTIDICAINUNA FORMAPIU’ COMPLESSA Le catene polipeptidiche possono avvolgersi lungo il proprio asse o formare interazioni tra due tratti di catena proteica struttura β NEGLI AMMINOACIDI IL GRUPPO AMMINICO (BASICO) E IL GRUPPO CARBOSSILICO (ACIDO) INTERAGISCONO, FORMANDO UNO IONE DIPOLARE (ZWITTERIONE). IL PH AL QUALE L’AA E’ SOTTO FORMA DI ZWITTERIONE H SI DICE PH ISOELETTRICO (E’ CARATTERISTICO PER OGNI AMMINOACIDO) R C COO- PERCIO’ GLI AA SONO SOLUBILI IN ACQUA (PRESENZA DI GRUPPI IONICI ) MENTRE A TEMPERATURA AMBIENTE GLI AA SONO SOLIDI A CAUSA DEI LEGAMI IONICI TRA GLI IONI DIPOLARI. NH3+ GLI AMMINOACIDI MOSTRANO QUINDI SIA PROPRIETA’ ACIDE CHE BASICHE E IL PH DELLE LORO SOLUZIONI DIPENDE DALLA FORZA DEI GRUPPI NH3+ E COO- ,TUTTAVIA ALCUNI AA CONTENGONO PIU’ DI UN GRUPPO ACIDO O BASICO E QUINDI DA QUESTO DIPENDE IL PH DELLE LORO SOLUZIONI A SECONDA DELLA NATURA DEL RADICALE R, GLI AMMINOACIDI SI CLASSIFICANO IN: AMMINOACIDI CON • R POLARE (IDROFILICO) • R APOLARE (IDROFOBICO) • R CATIONICO (BASICO) • R ANIONICO (ACIDO) R apolare(IDROFOBICO) R neutropolare(IDROFILICO) R CARICOACIDO R CARICOBASICO LA PREVALENZA DI AMMINOACIDI BASICI SU QUELLI NEUTRI ED ACIDI CONFERISCE ALLA LANA UN CARATTERE BASICO E QUESTO NE DETERMINA UN’ELEVATA AFFINITÀ PER I COLORANTI ACIDI NELLALANAMERINALASEQUENZADEGLIAMMINOACIDIE’: … ALA PRO ARG CYS CYS SER VAL ARG THR GLY PRO ALA THR THR ILE CYS SER SER … CYS THR SER PRO LEU CYS VAL GLY CYS ARG CYS PHE LYS ASP SIPOSSONOFORMARELEGAMI INTRACATENA (TRAATOMIDENTROLA STESSACATENA): • LEGAMIAPONTECISTINICI(PONTEDI SOLFURO–S-S- TRA2UNITA’DICISTEINA • LEGAMIAIDROGENO(TRAGRUPPI POLARINONCONSECUTIVIDELLASTESSA CATENA) OPPURESIPOSSONOFORMARELEGAMI INTERCATENA (TRA2CATENE PEPTIDICHE) LEGAMIINTERCATENA=FAVORISCONOLAFORMAZIONEDIZONE CRISTALLINE LEGAMIINTRACATENA=FAVORISCONOLAFORMAZIONEDIZONE AMORFE(PONTIADHSTABILIZZANOLASTRUTTURAALFAELICADELLA CHERATINA) • LEGAMIAPONTESALINO(DITIPO IONICOTRARESIDUIANIONICICOO- E CATIONICINH3+ • LEGAMIAPONTECISTINICI(TRAUNITA’ DICISTEINA,LEGAMICOVALENTI–S-S-) • LEGAMIAIDROGENO(LEGAMIPIU’ DEBOLI) LEGAMI INTERCATENA (INTER CHAIN) • LEGAMIAPONTECISTINICI(PONTEDISOLFURO–S-S- TRA2UNITA’DI CISTEINADICATENEDIVERSE) LEGAMI INTRACATENA (INTRA CHAIN) • LEGAMIAPONTECISTINICI(PONTEDISOLFURO–S-S- TRA2UNITA’DI CISTEINACONTIGUE) LA CHERATINA DELLA LANA ( E ANCHE DEI CAPELLI E DELLE UNGHIE)PRESENTA LA FORMA STRUTTURALE AD ALFA ELICA I RESIDUI AMMINOACIDICI (-R) SPORGONO ESTERNAMENTE DAL FILAMENTO SPIRALIZZATO (ELICA) MA QUANDO E’ SOTTOPOSTA A TENSIONE ASSUME LA FORMA A FOGLIETTO O BETA. due o più filamenti beta tendono ad affiancarsi lateralmente ed a legarsi tramite ponti a idrogeno, generando strutture estese, pieghettate, dette foglietti β