16. Processamento e maturazione dell’RNA contiene materiale protetto da copyright, ad esclusivo uso personale; non è consentita diffusione ed utilizzo di tipo commerciale Rappresentazione schematica delle attività delle diverse nucleasi. Endonucleasi a doppia elica Endonucleasi a singolo filamento Esonucleasi 5'-­‐3’ Esonucleoasi 3'-­‐5’ Esonucleasi processiva Esonucleasi non processiva . 1 Maturazione dei tRNA nei procarioti. Maturazione dei tRNA eucariotici 2 Processamento dell’ rRNA I geni per gli rRNA sono ripetuti in tandem nei genomi eucariotici NTS 18S ETS 28S ITS RNA RNA DNA DNA DNA other repetitive elements 60/81 bp repeats spacer promoter 60/81 bp repeats spacer promoter gene promoter 3 Processamento del precursore dell’ rRNA 45 S umano Processamento dell’rRNA procariotico Operone rrn (ribosomial rna) 4 Modificazioni chimiche dell’RNA tRNA contengono nucleoAdi insoliA D, diidrouridina; Ψ, pseudouridina; m2G, N2-­‐me?lguanosina; m2,2G, N2,N2-­‐ dime?lguanosina; Cm, 2'-­‐O-­‐me?lcitosina; Gm, 2'-­‐O-­‐me?lguanosina; yW, wybutosina; m5C, 5-­‐me?lci?dina; m7G, 7-­‐me?lguanosina; m1A, N1-­‐me?ladenosina. 5 Principali modificazioni post-­‐trascrizionali degli rRNA eucarioAci Principali modificazioni post-­‐ trascrizionali degli rRNA eucarioAci small nucleolar RNAs (snoRNA) 6 snoRNA C/D e H/ACA NB snoRNA non agiscono come tali ma assembla2 con specifiche proteine in par2celle ribonucleoproteiche RNP: snoRNP 7 mRNA eucariotico è modificato ad entrambe le estremità Aggiunta del cap all’estremità 5' degli mRNA eucarioAci. 8 Sequenza degli evenA nel processo di capping. Ruolo della fosforilazione della coda CTD dell’RNA polimerasi II nel capping 9 Funzioni del cap ü Protegge mRNA dalla degradazione ü Aumenta efficienza della traduzione ü Facilita il trasporto dell’mRNA dal nucleo al citoplasma ü Contribuisce ad aumentare l’efficienza del processo di splicing 10 Processo di poliadenilazione segnale di poliadenilazione (AAUAAA) 5-­‐30 nt a monte del sito di taglio sequenza ricca di G+U (GU) a valle del sito di taglio, CPSF (cleavage and polyadenyla2on specificity factor) CstF (cleavage s2mula2on factor) 11 La poliadenilazione 1 3 2 StruYura della Poli(A) polimerasi (PAP). RBD PM Regione NLS1 e NLS2 dominio di legame all’RNA modulo polimerasico responsabile dell’aTvità polimerasica S/T regione C-­‐terminale ricca in serina e treonina due domini di localizzazione nucleare 12 FUNZIONI DEL POLY A Protezione degli mRNA Traducibilità 13