Corsi 2012
Corso Teorico-Pratico di
Proteomica/Elettroforesi 2D 2012
Genova
Corso Teorico-Pratico di Real-time PCR
Milano
Corso Teorico-Pratico di Real-time PCR
Ariano Irpino (AV)
qPCR Assay Design and Sample Preparation
Marnes-la-Coquette, France
qPCR and Statistical analysis of Gene
Expression
Marnes-la-Coquette, France
Corso Teorico di Real-time PCR
Roma
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QX100™ Droplet Digital™ PCR System
Droplet Digital™ PCR: Molecular Biology in High
Resolution
Droplet Digital PCR è la terza generazione della tecnologia PCR.
Il sistema QX100™ Droplet Digital PCR di Bio-Rad Laboratories
consente di ottenere una misurazione assoluta del numero di
copie di DNA con un’accuratezza, precisione e sensibilità mai
viste prima d’ora, al prezzo incredibilie di circa 3 € a campione.
Droplet Digital PCR offre ai ricercatori un nuovo strumento per
misurazioni precise di copy number variation, identificazione
di sequenze poco rappresentate, di mutazioni rare, inclusa
l’identificazione di sequenze rare in campioni tumorali, e per l’analisi
di gene expression.
3
Organizzato da Bio-Rad Laboratories, con il patrocinio della
Scuola Internazionale di Scienze Pediatriche dell’Istituto
G. Gaslini, in collaborazione con il RenalChild Foundation
Corso Teorico-Pratico di
Proteomica/Elettroforesi 2D 2012
L’organizzazione e le date del corso saranno definite in funzione
delle richieste e delle disponibilità. Per informazioni:
[email protected]
Il Corso si terrà presso l’Istituto Giannina Gaslini di Genova
Largo Gerolamo Gaslini, 5
Relatori:
Dr. G. Candiano; Dr. M. Bruschi;
Istituto Giannina Gaslini, Genova
09.00
09.30
10.30
12.30
15.30
Primo Giorno
Presentazione del Corso
Preparazione del campione e reidratazione delle IPG.
Parte teorica
Pausa pranzo
Caricamento del campione per la prima dimensione e partenza della focalizzazione.
Preparazione dei gel per la seconda dimensione in SDS-PAGE e soluzioni di equilibrazione delle IPG focalizzate.
Parte teorica
Secondo Giorno
Equilibrazione delle IPG
Allestimento dei gel per seconda dimensione e inizio corsa.
Preparazione delle soluzioni di colorazione: Coomassie blue, Coomassie colloidale e Sypro Ruby
12.30 Pausa pranzo
14.30 Termine della seconda dimensione e inizio colorazione.
09.00
4
15.30
Parte teorica:
Introduzione alla tecnologia Stain Free e visualizzazione di una mappa 2D mediante Criterion Stain Free Imager.
Terzo Giorno
09.00Termine fase colorazione
Acquisizione delle mappe bidimensionali con densitometro in luce bianca per gel colorati e con scanner laser per gel in fluorescenza.
11.00 Elaborazione delle immagini con software PDQuest.
12.30 Pausa pranzo
14.00 Termine elaborazione con software PDQuest.
15.00 Taglio spot e relativo trattamento per l’analisi in spettometria di massa.
16.30 Discussione finale.
La quota di 800 Euro (IVA esclusa) comprende:
iscrizione, materiale didattico e pranzi di lavoro.
Il Corso prevede un numero massimo di 5
partecipanti
Per le modalità di iscrizione si veda pag. 14
5
Organizzato da Bio-Rad Laboratories
Corso Teorico-Pratico di Real-time PCR
Il corso si terrà presso
Bio-Rad Laboratories S.r.l. Via B. Cellini 18/A
Segrate - MI
04-07 Giugno 2012 - 22-25 Ottobre 2012
Relatori del corso:
Dr. M.G. Bianchi; Dr. L. Boveri Dr.ssa E. Cardillo
Bio-Rad Laboratories S.r.l.
Dr. A. Beghini Dip. di Biologia e Genetica per le Scienze
Mediche – Università di Milano
Dr. A. Gori Dip. di Biotecnologie Agrarie – Università di Firenze
Dr. G. Spinsanti Dip. di Biologia Evolutiva – Università di Siena
14.10
14.30
15.20
16.15
16.30
16.30
Primo giorno
Introduzione al corso e presentazione del programma.
Principi generali della tecnologia Real -Time.
Chimiche fluorogeniche in Real -Time PCR.
Coffee Break
Principi della quantificazione relativa ed assoluta e
significato degli standard.
Principi della quantificazione relativa.
Secondo giorno
09.00 Pre-PCR – RNA; analisi, estrazione e valutazione della qualità del campione.
10.15 Pre-PCR – L’ottimizzazione della reazione di retrotrascrizione e l’influenza di diversi approcci sull’accuratezza del dato di espressione genica.
11.15 Coffee Break
11.30 Prova pratica – Elettroforesi microfluidica dell’RNA e Retrotrascrizione.
12.15 Pausa Pranzo
13.45 Prova pratica – Risultato della corsa di elettroforesi microfluidica.
14.30 HRM: Utilizzo di HRM per una rapida e accurata determinazione di differenti pathovar di Pseudomonas savastanoi.
15.45 Coffee Break
6
16.00
16.45 Linee guida per il disegno di sistemi SybrGreen, TaqMan e nuovi sviluppi per l’analisi epigenetica.
HRM: lo screening per la ricerca di mutazioni ed altre applicazioni per una tecnologia in continuo sviluppo.
Terzo giorno
08.45 Sistemi di analisi – Software e parametri di analisi in PCR Real-Time.
09.45 Prova Pratica - Preparazione di un test Real-Time con
SybrGreen per l’analisi quantitativa dell’espressione genica.
10.45 Coffee Break
11.00 Troubleshooting – Conoscere la chimica, l’hardware ed
il software utilizzati per comprendere il significato di plot di amplificazione strani o aberranti.
12.15 Pausa pranzo
13.30 Risultato della prova pratica di PCR Real-Time con SybrGreen.
14.45 Selezione di geni controllo in biopsie cutanee di Stenella coeruleoalba (Cetacea, Odontoceti).
15.45 Coffee Break
16.00 Real-time PCR e statistica di base. Considerazioni su un appropriato disegno sperimentale per esperimenti di gene expression.
16.45 Prova pratica – preparazione test multiplex e preparazio-
ne di un test di High Resolution Melting per la ricerca di mutazioni.
08.45
09.45
11.00
11.20
Quarto giorno
Progettazione PCR - Stem-loop RT-PCR, un sistema
ingegnoso ed efficace per la rilevazione e la quantifica-
zione dei micro-RNA.
Risultato del test TaqMan in multiplex e risultato del test High Resolution Melting per la ricerca di mutazioni.
Coffee Break
La terza generazione della PCR quantitativa – droplet digital PCR. La soluzione per quantificazioni assolute e applicazioni complesse quali; detection di sequenze rare, analisi di Copy Number Variation e quantificazioni che richiedono un’accuratezza superiore.
La quota di 800 Euro (IVA esclusa) comprende:
iscrizione, materiale didattico e pranzi di lavoro.
Il Corso prevede un numero massimo di 12
partecipanti
Per le modalità di iscrizione si veda pag. 14
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Organizzato da Bio-Rad Laboratories S.r.l.
in collaborazione con l’istituto di ricerche genetiche
“Gaetano Salvatore” di Ariano Irpino (Biogem Scarl)
Corso Teorico-Pratico di Real-time PCR
Il Corso si terrà presso Biogem s.c.a.r.l.
Via Camporeale Area P.I.P. - Ariano Irpino (AV)
24 - 27 Settembre 2012
Relatori del Corso:
Dr.ssa L. Ciccone, Dr.ssa E. Cardillo, Dr. L. Boveri
Bio-Rad Laboratories S.r.l.
Primo Giorno
14.10 Introduzione al corso e presentazione del programma
14.30 Principi generali della tecnologia Real-Time
15.20 Chimiche fluorogeniche in Real-Time PCR.
16.15 Coffee Break
16.30 Principi della quantificazione assoluta e significato degli standards.
17.15 Principi della quantificazione relativa.
08.45
10.00
11.00 11.15
12.00
13.00
14.30
15.00
8
Secondo Giorno
Pre-PCR – Modulazione dell’espressione, profilatura, isolamento dell’RNA, valutazione della qualità e della
resa del campione. Quale influenza attribuire a ciascuno step sulle fasi successive dell’analisi.
Prova pratica – Elettroforesi microfluidica dell’RNA
Coffee Break
Pre-PCR – L’ottimizzazione della reazione di retro-trascrizione e l’influenza di diversi approcci sull’accuratezza del dato di espressione genica
Risultato della corsa di elettroforesi microfluidica Software e parametri di analisi.
Pausa Pranzo
Prova pratica – Reazione di retro-trascrizione con l’iScript cDNA Synthesis kit.
La Real Time PCR per lo studio dello stato di metilazione delle sequenze promotrici o per la ricerca di mutazioni o polimorfismi.
15.45
16.00
16.30
Coffee Break
Prova pratica – Preparazione di un test di Real Time in Sybr Green.
Progettazione PCR – Linee guida per il disegno di sistemi SybrGreen, TaqMan e nuovi sviluppi per l’analisi epigenetica.
Terzo Giorno
08.45 Troubleshooting – Conoscere la chimica, l’hardware ed il software utilizzati per comprendere il significato di plot di amplificazione strani o aberranti. Validità ed accettabilità dei dati sperimentali.
10.45 Coffee Break
11.00 Prova pratica – Preparazione di un test TaqMan in multiplex.
12.00 Sistemi di analisi – Software e parametri di analisi in PCR Real-Time – risultato della prova pratica di PCR Real Time con SybrGreen.
13.00 Pausa Pranzo
14.30 Esempio di disegno con BD.
15.30 Risultato del test TaqMan in multiplex.
16.30 Coffee Break
16.45 Prova pratica – Preparazione di un test di High Resolution Melting.
Quarto Giorno
08.45 Risultato del test di High Resolution Melting.
09.45 Nozioni basilari di statistica utili alla comprensione dei dati di Real-Time PCR.
Considerazioni sulla corretta impostazione di uno studio di espressione genica.
10.45 Commenti a chiusura del corso
11.00 La terza generazione di PCR quantitativa - droplet digital PCR. La soluzione per quantificazioni assolute e applicazioni quali: detection di sequenze rare, analisi di Copy Number Variation e quantificazioni che richiedono un’accuratezza superiore.
12.00 Commenti a chiusura del corso
La quota di 600 Euro (IVA esclusa) comprende:
iscrizione e materiale didattico, i coffee break, due
pranzi e la cena sociale
Il Corso prevede un numero massimo di
16 partecipanti
Per le modalità di iscrizione si veda pag. 14
9
La Bio-Rad Laboratories,
al fine di promuovere un’informazione costante e qualificata sulle
più moderne tecnologie di laboratorio,
è lieta di invitarLa al
Corso Teorico di Real-time PCR
Il corso si terrà presso
Università “La Sapienza”
Dipartimento di Biologia Ambientale
Aula ‘’Valerio Giacomini’’
P.le A.Moro, 5 - 00185 Roma
25-27 Giugno 2011
Relatori del corso:
Dr.ssa L. Ciccone, Dr. M.G. Bianchi
Bio-rad Laboratories S.r.l.
Dr. A. Gori
Dip. di Biotecnologie Agrarie - Università degli Studi di Firenze
Dr. M. Pilotti
C.R.A. - Consiglio per la Ricerca e la Sperimentazione
in Agricoltura - Roma
14.10
14.30
15.20
16.15
16.30
Primo giorno
Introduzione al corso e presentazione del programma.
Principi generali della tecnologia Real-Time.
Chimiche fluorogeniche in Real-Time PCR
Coffee Break
Principi della quantificazione relativa ed assoluta.
08.45
10.00
10.30
10.45
Secondo giorno
Modulazione dell’espressione, profilatura, isolamento
dell’RNA, valutazione della qualità e della resa del campione. Quale influenza attribuire a ciascuno step sulle fasi successive dell’analisi.
L’ottimizzazione della reazione di retro-trascrizione e l’influenza di diversi approcci sull’accuratezza del dato di espressione genica.
Coffee Break
Preparazione degli standard e loro significato nei diversi approcci quantitativi.
10
11.30 La Real Time PCR per lo studio dello stato di metilazione delle sequenze promotrici o per la ricerca di mutazioni e polimorfismi.
12.15 Pausa Pranzo
13.45 HRM: Utilizzo di HRM per una rapida e accurate determinazione di differenti pathovar di Pseudomonas savastanoi.
15.00 Sistemi di analisi – Software e parametri di analisi in PCR Real Time.
16.00 Coffee Break
16.20 Progettazione PCR – Linee guida per il disegno di sistemi SybrGreen, TaqMan e nuovi sviluppi per l’analisi epigenetica; studio dello stato epigenetico mediante EpiQ.
08.45
09.45
10.45
11.00
Terzo Giorno
Messa a punto di una metodica di PCR Real Time per il rilevamento di Ceratocystis platani (agente del cancro colorato) in legno di platano.
Troubleshooting – Conoscere la chimica, l’hardware ed il software utilizzati per comprendere il significato di plot di amplificazione strani o aberranti.
Validità ed accettabilità dei dati sperimentali.
Coffee Break
Nozioni basilari di statistica utili alla comprensione dei dati di Real Time PCR. La corretta impostazione di uno studio di espressione genica dal punto di vista statistico.
La quota di 550 Euro (IVA esclusa) comprende:
iscrizione e materiale didattico, i coffee break, due
pranzi e la cena sociale
Il Corso prevede un numero massimo di
30 partecipanti
Per le modalità di iscrizione si veda pag. 14
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Corso Avanzato Teorico-Pratico
qPCR Assay Design
and Sample Preparation
in collaborazione con TATAA Biocenter
Il Corso si terrà presso
Bio-Rad European Training Centre
Marnes-La-Coquette, France
3-4 Luglio 2012 e 4-5 Dicembre 2012
L’obiettivo di questo corso è fornire l’opportunità di effettuare prove pratiche di laboratorio sotto la supervisione di istruttori.
Saranno suggerite le migliori strategie per un’ottimale preparzione dei campioni, per condurre un’efficiente retro-trascrizione, per generare dati di PCR di buona qualità e per impostare un adeguato disegno sperimentale.
Gli argomenti trattati includono:
•• Introduzione alle tecniche e ai principi per la preparazione dei campioni
•• Prova pratica su differenti metodologie per la preparazione dei campioni
•• Estrazione da matrici difficoltose e da campioni di piccole dimensioni
•• Controllo della qualità del DNA e dell’RNA
•• Elettroforesi automatizzata
•• Disegno di saggi In silico “Disegna il tuo saggio personalizzato”
•• Introduzione alla PCR e alla qPCR
•• Disegno di primer e sonde
•• Trascrizione inversa: linee guida e dimostrazione pratica per la sintesi del cDNA
•• PCR quantitativa Real time: linee guida sperimentali ed esperimenti pratici in laboratorio
Istruttori: Specialisti Tattaa Biocenter e Bio-Rad
* Il corso sarà tenuto in lingua inglese
Per l’iscrizione al corso visita il nostro sito
www.bio-rad.com/qPCRtraining
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Corso Avanzato
qPCR and Statistical Analysis
of Gene Expression
Il corso si terrà presso
Bio-Rad European Training Centre
Marnes-La-Coquette, France
5-6 Luglio 2012 e 6-7 Dicembre 2012
L’obiettivo di questo corso è fornire gli strumenti necessari per
la comprensione delle procedure di elaborazione e analisi statistica dei dati ottenuti per mezzo di Real-Time PCR. Le esercitazioni pratiche basate su dati reali e su dati forniti dai partecipanti
saranno un fattore chiave di questo corso. Verranno presentati i disegni sperimentali più diffusi; i dati derivanti da studi di questo genere saranno quindi analizzati dai partecipanti sotto la supervisone
dei nostri istruttori. Grazie a questo corso i partecipanti acquisiranno familiarità con i più comuni casi sperimentali e creeranno modelli
basati su Excel per l’analisi dei dati; tali modelli rimarranno a disposizione dei partecipanti e sarà possibile per loro usufruirne in seguito. Durante il corso verrà inoltre fornita una panoramica dei differenti strumenti software correlati a metodiche di Real-Time PCR.
Gli argomenti trattati includono:
•
•
•
•
•
•
•
•
Introduzione alla statistica
Processo di amplificazione
Livello di threshold e valore Cq
Calcolo del numero di copie
Calcolo del valore di espressione
Metodiche di normalizzazione
Selezione e normalizzazione con geni Reference
Test statistici per l’analisi di dati Real Time PCR (Verrà fornita una versione demo dei software)
• Qbase Plus, etc…
• MIQE guidelines
Istruttori: Specialisti Tattaa Biocenter e Bio-Rad
* Il corso sarà tenuto in lingua inglese
Per l’iscrizione al corso visita il nostro sito
www.bio-rad.com/qPCRtraining
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Modalità di iscrizione
Per l’iscrizione ai corsi che si terranno c/o
Bio-Rad European Training Centre Marnes-La-Coquette
è necessario compilare il modulo online che troverete alla
pagina internet
www.bio- rad.com/qPCR
Per richiedere l’iscrizione ai Corsi
è necessario compilare il modulo online che troverete alla
pagina internet discover.bio-rad.it
(sezione Eventi)
Per l’ammissione ai Corsi
Teorico - Pratico di Real Time PCR del
04-07 Giugno 2012 / 22-25 Ottobre 2012
Teorico - Pratico di Real Time PCR del
24 - 27 Settembre 2012
saranno considerati requisiti preferenziali il possesso
di un apparecchio Bio-Rad per PCR Real-Time
e un’esperienza, seppur minima, in questa tecnologia
Segreteria Organizzativa
Bio-Rad Laboratories Srl
Rossella Fumagalli
Via Cellini 18/A
20090 Segrate (Milano)
tel 02 21609436 fax 02 21609399
e-mail: [email protected]
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Bio-Rad è impegnata a dare un supporto costante sulle
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prodotti e sulle applicazioni specifiche.
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