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Definizioni:
• genoma
• trascrittoma
• proteoma
Paradosso del valore C
• Eccesso di DNA rispetto alla complessità
• Variazioni di valore C per complessità simili
Struttura del genoma eucariotico
• Sequenze ripetute
• DNA non
codificanti
• Geni interrotti
Sequenze ripetute nel genoma umano
Uniche
(1-10 volte)
circa 40%
Maggior parte dei geni
in tandem
Geni reiterati
(rRNA, 5S RNA, tRNA, Istoni etc.)
Mediamente ripetute
(da centinaia a migliaia
Alcune sequenze regolative
di volte)
intersperse
40-50%
Alcune sequenze a funzione speciale
(centromeri, origini, etc.)
Altamente ripetute
(da decine di migliaia
a milioni di volte)
5-10%
DNA satelliti
sequenze semplici
geni per: rRNA (300)
tRNA (1300)
5S RNA (2000)
istoni (20)
sequenze ripetute intersperse
sequenza Alu: 300 nt (x 1.000.000)
sequenze semplici o satelliti: 2-10 nt (x 2-100 copie in tandem x 1-100 blocchi interspersi)
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
• Le proporzioni relative delle componenti del
DNA variano nei diversi genomi eucariotici
• Il contenuto assoluto di DNA non ripetitivo
aumenta con le dimensioni del genoma, ma
raggiunge un plateau a circa 2 x 109 bp.
La percentuale di DNA non ripetitivo tende a diminuire
con l'aumentare della grandezza del genoma
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Gene per il collagene 1a2 di pollo
• Esoni: sequenze rappresentate nell’RNA
maturo
• Introni: sequenze rimosse dal trascritto
primario
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
