CENTRO DI BIOTECNOLOGIE
SETTORE DOCUMENTAZIONE BIOMEDICA
“A.O.R.N. A.CARDARELLI”- NAPOLI
LA RICERCA BIBLIOGRAFICA NEL
SETTORE BIOMEDICO: Pubmed
Prof.ssa Daniela Scala
Dott.ssa Barbara Andria
Pubmed
rappresenta, con tutti i database
disponibili, il sistema di ricerca
bibliografica in campo biomedico
Pubmed è un’interfaccia web accessibile gratuitamente,
sviluppata dal National Center for Biotechnology
Information (NCBI), istituito dal 1988, presso la
National Library of Medicine (NLM),a sua volta parte
del National Institute of Health (NIH) di Bethesda
(USA).
E’accessibile dal seguente indirizzo:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi
Altri fornitori di Pubmed gratuiti
Fornitore
URL
Science direct http://www.sciencedirect.com/
HealthGate
http://www.healthgate.com
Infotrieve http://www3.infotrieve.com/medline/infotrieve/
Medscape
http://www.medscape.com
Sifo
http://www.sifoweb.it/sifo_ntw/dome.asp
PubMed
È il sistema di riferimento quando si intende
effettuare una ricerca bibliografica via Entrez
ENTREZ è il sistema integrato per la ricerca ed il
recupero dell’informazione usato da NCBI per le
principali banche dati. Entrez è un sistema che
integra la banca dati Pubmed con archivi sulla
biologia molecolare.
Il sistema Entrez + MEDLINE è stato incorporato
dall’NCBI con il nome di PubMed
Pubmed: Cosa contiene?
4 database
• MEDLINE
citazioni dal 1966 ad oggi; abstract; MESH;
aggiornamento settimanale;
• OLDMEDLINE
con citazioni dal 1951 al 1965 , no abstract, no MESH
• PREMEDLINE (In Process citations)
per citazioni non ancora indicizzate; no MeSH ;
aggiornamento giornaliero
• PUBLISHER SUPPLIED CITATIONS
per citazioni ricevute via elettronica direttamente
dall’editore, non ancora pubblicate in cartaceo
Nucleotide: sequence database
(GenBank)
UniGene: gene-oriented clusters of
transcript sequences
Protein: sequence database
CDD: conserved protein domain database
Genome: whole genome sequences
3D Domains: domains from Entrez
Structure
Structure: three-dimensional
macromolecular structures
UniSTS: markers and mapping data
Taxonomy: organisms in GenBank
SNP: single nucleotide polymorphism
Gene: gene-centered information
HomoloGene: eukaryotic homology
groups
PubChem Compound: small molecule
chemical structures
PubChem Substance: chemical
substances screened for bioactivity
Genome Project: genome project
information
PubMed: biomedical literature citations
and abstracts
PubMed Central: free, full text journal
articles
PopSet: population study data sets
GEO Profiles: expression and molecular
abundance profiles
GEO DataSets: experimental sets of GEO
data
Cancer Chromosomes: cytogenetic
databases
PubChem BioAssay: bioactivity screens
of chemical substances
GENSAT: gene expression atlas of mouse
central nervous system
Books: online books
OMIM: online Mendelian Inheritance in
Man
Site Search: NCBI web and FTP sites
Struttura integrata tra le banche dati di
Entrez
Componenti del sistema
Documenti primari
Articoli originali
Database (producers)
National Library of Medicine (NLM), con sede a Bethesda USA
Banche Dati (vendors)
Terminali (users)
