Programma di Genomica ed elementi di genetica statistica A.A. 2014-15
Prof. A. Novelletto
Testo consigliato: Lesk, Introduzione alla Genomica, Zanichelli.
Conoscenze preliminari richieste
Fondamenti – Struttura degli acidi nucleici ed espressione genica.
Cellule e comunicazione cellula-cellula. I geni nelle famiglie e nelle
popolazioni. Amplificazione e ibridazione degli acidi nucleici,
clonaggio, metodi di analisi.
Argomenti specifici del corso
Sequenziamento del DNA. Dai metodi classici a quelli di nuova
generazione. La filosofia shotgun.
Il genoma umano.
Diversita’ del genoma.
Genomica comparata
Evoluzione e cambiamenti genomici
Genomica funzionale. Microarray, ChIP, DNAse hypersensitive sites
La distribuzione normale, tabelle di contingenza.
Identificazione delle regioni cromosomiche contenenti geni per
caratteri quantitativi e complessi
Capp.
Es. Strachan &
Read capp.
1
3.1-3.3
4.5
6
4 e Materiali
su didatticaweb
Strachan & Read
cap. 8
1
Tutorial nei
siti web
consigliati
2
3
5
Strachan & Read
cap. 7
Strachan & Read
capp. 3.4,15
Per la parte statistica:
Triola, Triola. Fondamenti di statistica, capp. 2,7 (Pearson ed.)
Withlock, Schluter. Analisi statistica dei dati biologici, cap. 9.1-9.3 (Zanichelli)
Su alcuni argomenti si consiglia di consultare anche Knight, J.C. Human genetic
diversity. Oxford Univ. Press.
Siti web da visitare:
http://www.hapmap.org/downloads/index.html.en
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK174586/
http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/originhaplotype.html.en
http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/healthbenefit.html.en
http://www.1000genomes.org/about
