Programma Straordinario di Ricerca Oncologica 2006 - Art.3 DM 21 luglio 2006 1 “Rete solidale e collaborazioni internazionali” RELAZIONE STATO AVANZAMENTO DEI LAVORI PROGRAMMA 2 “INTEGRAZIONE DELLE ATTIVITÀ DI RICERCA ATTRAVERSO LA COSTRUZIONE DI STRUTTURE E RETI DI COLLABORAZIONE INTERISTITUZIONALI” PROGETTO: Rete Italiana delle Biobanche per l’Oncologia (RIBBO) Coordinatori: Angelo Paradiso (Istituto Tumori Bari), Giovanni Migliaccio (ISS Roma) Stato generale di sviluppo del progetto e conseguimento dei risultati (max 1000 parole) Lavoro svolto al 2009-11-09 dal Coordinamento di Progetto A. Attivazione del sito web (ISS Roma) Allo scopo di organizzare la comunicazione sia interna al progetto di rete nazionale di biobanche oncologiche, sia esterna con i membri del pubblico e le organizzazioni interessate ai campioni biologici a scopi di ricerca è in corso di approntamento un sito WEB http://www.iss.it/ribo/ Documenti descrittivi sono disponibili sul sito ACC http://www.iss.it/accs/cont.php? id=111&lang=1&tipo=57 B. Attivazione del database centralizzato B.1 Minimum Data Set (IT Bari) Si é proceduto all’individuazione dei dati essenziali con cui identificare i campioni biologici al fine di valorizzarli maggiormente e conferire agli stessi caratteristiche peculiari, permettendo, così, al ricercatore maggiori opzioni selettive, in relazione al tipo di studio ipotizzato. Il gruppo di lavoro per la realizzazione del sito web del RIBBO, i cui componenti furono individuati in seguito all’incontro di Bari il 5/6/2008 e costituito da: Fabio Ciceri M.Assunta Fonsi Giuseppe Pelagio Agostino Steffan Barbara Parodi Ist. San Raffaele Milano Ist Regina Elena Roma Ist Tumori Bari CRO Aviano IST Genova nella riunione operativa tenutasi presso l’ISS di Roma in data 16.12.2008, alla quale hanno partecipato: Giovanni Migliaccio, Giuseppe Pelagio, Maria Assunta Fonsi, Silvano Rossini (in sostituzione di Fabio Ciceri), Barbara Parodi, Valentina Tirelli, Paolo Roazzi, Cintia Carella, sono stati definiti: 1. la strutturazione del sito web del RIBBO, prevedendo due sezioni distinte: una generale descrittiva con accesso libero ed una riservata ai membri, accessibile Programma Straordinario di Ricerca Oncologica 2006 - Art.3 DM 21 luglio 2006 2 “Rete solidale e collaborazioni internazionali” previo inserimento delle credenziali, contenente documenti e quant’altro concernente le attività delle UUOO. 2. i criteri per la costruzione del database nel quale far confluire i dati sui campioni disponibili nei centri RIBBO per la condivisione da parte di utenti esterni; 3. la tipologia dei dati associati ai campioni biologici nel database. Si é preso atto del lavoro sull’argomento già svolto nell’ambito del progetto NICaB, nel quale veniva individuato un “Minimum Data Set” (MDS) simile a quelli utilizzati in altri database internazionali (Tubafrost, NCI, Confederation of Cancer Biobanks). Nell’incontro è stato deciso di integrare a questi i dati del modello OCSE. Successivamente, il team ha prodotto un modello di MDS che è stato sottoposto ai membri RIBBO che hanno prodotto commenti e/o suggerimenti che hanno condotto alla stesura di una versione finale dello stesso, pubblicato nell’area riservata del sito web. Attualmente è in corso una fase di prova di caricamento di dati nel database al fine di verificarne la funzionalità e rilevarne eventuali anomalie. B.2 Software (ISS Roma) Oltre al sito dedicato alla comunicazione si è provveduto a mettere in opera il database centrale dei campioni al sito http://www.iss.it/Site/Ribbo/Default.aspx? ReturnUrl=%2fsite%2fribbo%2 fsearch.aspx Questo sito insieme al software necessario per gestire il database è stato preparato dall’UO 2. Il dataset minimo dei dati da far confluire nel database centralizzato è stato identificato in collaborazione con i membri del RIBBO. Scopo del sito e del database centralizzato è permetter la rapida identificazione dei campioni biologici disponibili, per tipo, patologia e biobanca originaria. C. Preparazione della partecipazione della rete al BBMRI C. 1 Rapporti con le UUOO RIBBO (IT Bari) Tutte le attività del Network si sono svolte sotto la supervisione del Coordinamento, in costante contatto con le UUOO, che ha fornito direttive e modalità di partecipazione ai lavori, accogliendo i numerosi suggerimenti e proponendo congrue soluzioni. Tutte le UUOO hanno intrapreso iniziative volte al miglioramento delle proprie procedure, introducendo strumenti utili al miglioramento degli standard qualitativi dei campioni e dei dati conservati presso le proprie biobanche. In relazione alla partecipazione alla rete europea BBMRI, il coordinamento ha costantemente aggiornato le UUOO sugli sviluppi della fase preparatoria, che ha condotto alla candidatura del RIBBO per la partecipazione al progetto prototipale del BBMRI, in qualità di rete di biobanche oncologiche. Alle UUOO é stato richiesto, come indicato dal coordinamento europeo, di adeguare le proprie modalità operative a quelle di riferimento internazionale (OECD, Tubafrost, IARC) al fine di armonizzare le stesse per una migliore interazione trans-nazionale. Il coordinamento ha curato l’invio, da parte dei singoli centri, dei questionari BBMRI che ha permesso a quest’ultimi di prendere atto delle risorse disponibili nell’ambito di RIBBO, determinandone la candidatura al Prototipe Project. Il coordinamento ha inoltre sottolineato la necessità di adeguarsi ai requisiti stringenti per la partecipazione al prototipo BBMRI ed ha affiancato le singole UUOO focalizzando sugli obiettivi richiesti da BBMRI: produzione di procedure (SOPs) e modulistica per il trasferimento di campioni e dati all’estero (MTA) in accordo con le normative etiche e legali produzione di procedure per collaborazioni scientifiche che rispettino i parametri richiesti da accademia ed industria Programma Straordinario di Ricerca Oncologica 2006 - Art.3 DM 21 luglio 2006 3 “Rete solidale e collaborazioni internazionali” l’applicazione delle linee guida OECD e WHO/IARC per i Centri di Risorse Bilogiche coordinamento delle attività con altri consorzi e con il responsabile del rispettivo workpackage (WP3) la creazione di un portale comune accessibile dal sto web BBMRI l’adozione di procedure adeguate per l’integrazione nel concetto operativo di BBMRI il trasferimento di tutta a documentazione prodotta al Consorzio del Prototype Project per la costruzione di BBMRI C.2 Interfacciamento con Organi BBMRI (ISS Roma) In seguito agli accordi con le altre reti di biobanche a scopo di ricerca, l’ISS si è fatto carico di partecipare e rappresentare RIBBO e le altre reti presso il progetto di infrastruttura europea di ricerca BBMRI. Come risultato di tale attività RIBBO è entrato a far parte delle strutture che partecipano ad un progetto presentato per FPVII denominato I3 D. Consuntivo attività UU.OO. La notevole mole di lavoro svolto dalle singole UUOO è efficacemente condensato nella seguente tabella riassuntiva che dimostra l’utilizzo di una serie di strumenti di qualità adottati durante il corso del seguente anno di attività. Per il dettaglio si rimanda alle relazioni delle singole UUOO. Programma Straordinario di Ricerca Oncologica 2006 - Art.3 DM 21 luglio 2006 4 “Rete solidale e collaborazioni internazionali” ISTITUTO CENTRO DI RIFERIMENTO ONCOLOGICO –AVIANO ISTITUTO REGINA ELENA ROMA ISTITUTO NAZIONALE PER LA RICERCA SUL CANCRO (IST) GENOVA FONDAZIONE G. PASCALE IRCCS ISTITUTO NAZIONALE TUMORI NAPOLI ISTITUTO NAZIONALE TUMORI MILANO I.R.C.C.S ISTITUTO ORTOPEDICO RIZZOLI BOLOGNA IRCCS BESTA MILANO IRCCS MULTIMEDICA ISTITUTO TUMORI BARI ISTITUTO SCIENTIFICO ROMAGNOLO – FORLI’ CONSENSO PROCEDURE SCAMBIO INT.LE CAMPIONI E DATI CONTROLLO DI QUALITA’ SISTEMA INFORMATICO CERTIFICAZIONE SI SI MTA SI Matrix + EasyTrack IN CORSO SI SI MTA SI SI SI Dr. Mauro Truini Dr. Paola Visconti SI SI MTA SI Freezerworks SI Dr. Gerardo Botti SI SI MTA SI SI HOMEBREW IN CORSO Dr. M. Grazia Daidone SI SI MTA SI SI IN CORSO Dr. Marco Alberghini SI SI MTA SI SI SI SI SI MTA SI Gestione SOL IN CORSO SI SI MTA SI SI SI SI SI MTA SI SI SI SI SI MTA SI IN CORSO VALUTAZIONE IN CORSO RESONSABILE Dr. Agostino Steffan Dr. Vincenzo Canzonieri (DIR) Dr. Marcella Mottolese Dr. M.Assunta Fonsi Barbara Antoniani Dr. Serena Pellegatta Dr. Adriana Albini Dr. Giuseppe Pelagio Dr. Wainer Zoli A) Riunioni dei partecipanti a) Roma ISS 16.12.2008 WG Sito Web e Minimum data set (ISS Roma) b) Roma ISS 21.7.2009 Strategie di Partecipazione al Prototipo BBMRI (ISS Roma) c) Roma ISS 9.2.2009“Rete Nazionale Solidale e Collaborazioni Internazionali” (ISS per ACC) Consuntivo Attività Scientifica 2007-2008. Pubblicazioni conseguite nell’ambito del presente progetto 1. V.Cappelletti et al., "Impact of Biospecimens handling on biomarker research in breast cancer". BMC Cancer 2009, 9:409 2. Folgiero, Mottolese et “ One Induction of ErbB-3 Expression by a6b4 Integrin Contributes to Tamoxifen Resistance in ERb1-Negative Breast Carcinomas” PLoS ONE February 2008 Volume 3 Issue 2 e1592