Inibizione dell`attività della trascrittasi inversa ad opera dell`ossido

UNIVERSITÀ DEGLI STUDI “MAGNA GRÆCIA” DI
CATANZARO FACOLTÀ DI FARMACIA
SCUOLA DI SPECIALIZZAZIONE FARMACIA OSPEDALIERA
CATTEDRA DI CHIMICA FARMACEUTICA
INIBIZIONE DELL’ATTIVITA’ DELLA
TRASCRITTASI INVERSA AD OPERA
DELL’OSSIDO NITRICO
STRUTTURA DEL VIRUS DELL’HIV-1
RUOLO DELL’RNA VIRALE
SUBUNITA’ CHE
FORMANO
L’ETERODIMERO
TRASCRITTASI
INVERSA
Carson, M. (1987) J. Mol. Graphics 5, 103-106.
SUPERFICIE DELL’ENZIMA ACCESSIBILE AL SOLVENTE
RESIDUI
AMINOACIDICI DI
CONTATTO TRA
P66 E P51
In blu: V21, k22, P25, P52,
E53, N57, T131, N136, N137,
E138, T139.
In azzurro: P392, I393, Q394,
E396, T397, T400, W401,
N418, P420, L422.
In rosa: N255, Q258, V261,
N265, V276, L283, T296,
L289.
Pradeep K. Et al., BMC Biochemistry 2002, 3:18
ATTIVITA’ CATALITICHE ED OMOLOGIE
NELLA STRUTTURA PRIMARIA
MOTIVO RESPONSABILE DELL’ATTIVITA’
POLIMERASICA: YMDD
D. W. Rodgers et al., (1995) Biochemistry 92: 1222-1226.
INETRAZIONI TRA IL POLLICE DI P51 E IL SITO RNasi H DI P66
Julias, J. G. et al., (2001). J. Virol. 75, 6537-6546.
POSSIBILI TARGETS DELLA TERAPIA ANTI-HIV
RESIDUI AMINOACIDICI
MUTANTI CHE
INDUCONO RESISTENZA
AGLI INIBITORI
NUCLEOSIDICI E
NON-NUCLEOSIDICI.
SITO POLIMERASICO LEGATO A CP-94,707
INIBITORE NON-NUCLEOSIDICO DI RT.
RUOLO DEI MACROFAGI DURANTE
L’EVOLUZIONE DELL’INFEZIONE
Presentazione dell’antigene
Fagocitosi
Thomas R. et al., Virology 212:174-178 (1995)
Secrezione di
citochine
Produzione di radicali reattivi
ed ossido nitrico
Donatori dell’ossido nitrico usati da Persichini e
collaboratori:
•SIN-1
•NOC-18
•NOR-3
•SNO-102
•SNP
MODELLI CRISTALLOGRAFICI USATI IN QUESTO STUDIO:
PDP ID: 1RTJ, 2.35 Ǻ
PDP ID: 1RTD, 3.20 Ǻ
OSSIDO NITRICO
Ossidazione
S-nitrosilazione
• Y183
• Y188
• W229
• C38
• C280
• C62
CO2H
H2NCH
H2C SH
FATTORI FAVORENTI:
 Accessibilità del solvente ai gruppi tiolici.
 Presenza di residui basici che facilitano la deprotonazione del gruppo
tiolico aumentandone la reattività (istidina, arginina, lisina).
 Presenza di residui basici che stabiliscono la forma protonata del
gruppo tiolico (acido aspartico, acido glutammico).
CONCLUSIONI
OSSIDO NITRICO
Patologie cardiovascolari
AIDS ?