Novità dalla genetica nella sclerosi laterale amiotrofica Adriano Chiò Centro Regionale Esperto SLA (CRESLA) Dipartimento di Neuroscienze Università di Torino Modena, 18 maggio 2012 l La SLA oggi viene considerata una malattia complessa, caratterizzata dall’interazione fra fattori genetici e fattori ambientali. Genetica Genetica + Ambiente Ambiente l l l l British Twin Study: 10.872 certificati di morte di pz con SLA - identificate 75 coppie di gemelli di cui almeno uno con SLA Swedish Twin Register: su 86.411 coppie di gemelli identificati 73 coppie di gemelli, di cui almeno uno con SLA Ereditabilità : Componente ambientale: 0,61 (0,38-0,78) 0,39 (0,22-0,62) Le dimensioni fenotipiche della SLA II MN I + II MN I MN ALS PMA PLS Classic & bulbar Flail arm & Flail leg Axial ALS UMN pred. ALS Le dimensioni fenotipiche della SLA I asse II MN I + II MN I MN II asse ALS without dementia ALS Bi ALS Ci ALS-FTD Le dimensioni fenotipiche della SLA III asse ALS without extrapyramidal signs and symptoms ? ALS with extrapyramidal signs and symptoms La SLA familiare Frequenza di fALS in nel registro piemontese % Frequenza di fALS per età di esordio dei pazienti % classi d’età Classificazione delle SLA familiari Nomenclatura Frequenza dei casi Ereditarietà Nome della malattia Gene Locus Proteina ALS1 20% AD/AR SOD-FALS SOD1 21q22.1 Cu-Zn Superossido dismutasi ALS2 Rara AR ALS giovanile tipo 3 ALS2 2q33 Alsina ALS3 Singola famiglia AD FALS - 18q21 Sconosciuta ALS4 Rara AD Neuropatia ereditaria distale con segni piramidali SETX 9q34 Senatassina ALS5 Rara AR ALS giovanile SPG11 15q15.1q21.1 Spatacsina ALS6 4% AD/AR FALS FUS/TLS 16q12 FUS/TLS ALS7 Singola famiglia AD FALS - 20tel Sconosciuta Classificazione delle SLA familiari Nomenclatura Frequenza dei casi Ereditarietà Nome della malattia Gene Locus Proteina ALS8 Rara AD SMA tipo Finkel VAPB 20q13 VAPB (prossimale) ALS9 Rara AD? FALS ANG 14q11.2 Angiogenina ALS10 8% AD FALS TDP-43 1p36 TAR DNAbinding protein ALS11 Rara AD FALS FIG4 6q21 Fosfoinositide 5-fosfatasi ALS12 Rara AD/AR FALS OPTN 10p15p14 Optineurina ALS13 ? AD FALS ATXN2 12q24 Atassina2 ALS14 2% AD FALS VCP 9p13.3 Valosin containing protein ALS15 ? X-linked D FALS UBQLN2 Xp11.21 Ubiquilin2 Classificazione delle ALS-FTD familiari Nomenclatura Frequenza dei casi Ereditarietà Nome della malattia Gene Locus Proteina ALS/FTD1 Rara AD ALS con FTD - 9q21q22 Sconosciuta ALS/FTD2 Frequente AD ALS con lieve compromissione cognitiva c9orf72 9q21.29p13.3 c9orf72 FTD-ALS Rara AD Complesso disinibizionedemenzaparkinsonismoamiotrofia MAPT 17q.21.1 MAPT Un carrellata di geni ALS6 – FUS/TLS l l Mutazioni del gene FUS causano una SLA classica, raramente associata a FTD Sembra interessare il 4% delle SLA familiari e <1% delle SLA sporadiche Caratteristiche e funzione di FUS/TLS l Analogamente alla TDP43, nei casi con mutazione FUS sono presenti aggregati citoplasmatici l FUS/TLS è una RNA-DNA binding protein, con funzioni sullo splicing dell’mRNA FUS/TLS in Italia l Chiò: Due famiglie (3,7%) su 52 casi indice studiati (una nuova famiglia identificata dopo la pubblicazione del lavoro) l Ticozzi: Cinque famiglie (5,3%) su 94 casi indice studiati FUS/TLS nei casi sporadici Circa lo 0,5% dei casi sporadici di SLA presenta una mutazione verosimilmente patogena di FUS/TLS FUS è spesso caratterizzata da mutazioni de novo ALS13 l l l Espansioni poliQ di lunghezza intermedia del gene ATXN2 costituiscono un fattore rischio per la SLA Possibile ruolo di ATXN2 sul processing dell’RNA Cautela: l l Da: Van Damme et al, 2011 Non chiaro il cut-off di ripetizioni (>28?) Identificati soggetti sani con 30-32 ripetizioni ALS14 l l l l Da: Shaw, 2010 Identificato mediante tecnica degli esomi (DNA codificante per le proteine, 5% del DNA) VCP già noto come causa di miosite a corpi inclusi, malattia di Paget e demenza fronto-temporale (IBMPFT), autosomico dominante Proteina connessa sia con la degradazione del proteasoma e con l’autofagia. Stretta correlazione funzionale con TDP43 e progranulina Co-presenza di SLA e FTD nella stessa famiglia l l l l III-2: esordio a 59 anni, durata 23 mesi II-1, II-2, II-3: FTD II-3 anche affetto da SM II-6 deceduto a 31 anni per incidente stradale ALS15 l l l l Ubiquilina 2: primo gene X-linked (dominante) identificato nella SLA Fenotipo SLA e SLA-FTD UBQLN2 co-segrega con TDP43 Mutazioni del gene UBQLN2 compromettono la degradazione del proteasoma mediato da ubiquilina2 UBQLN2 causa sia SLA sia ALS-FTD l Nel pedigree originale sono presenti casi sia di SLA senza demenza, sia di SLA con demenza (indicati con l’asterisco) TARDBP (TDP43): un gene, molti fenotipi ALS 10 - TDP-43 l l l l Clinicamente si tratta di una SLA classica La mutazione sembra interessare il 2-5%% delle SLA familiari e l’1% delle SLA sporadiche MA Vi è un accumulo di TDP-43 nei neuroni corticali e nei motoneuroni di tutti i pazienti con SLA (tranne quelli con mutazione SOD1!) È una proteina nucleare che regola la trascrizione e lo splicing dell’RNA. Nella SLA appare sequestrata nel perikaryon e quindi non in grado di svolgere la sua funzione a livello nucleare. Caratteristiche della TDP-43 Da Strong et al, Mol Cell Neurosci 2007 l Localizzazione citoplasmatica della proteina nei pazienti con SLA Sano SLA l Da Banks et al, Mamm Gen 2008 SLA Mutazioni descritte in casi di SLA familiare e sporadica Confronto fra le casistiche italiane (casi sporadici) SALS età media genere (F) esordio % mutati (bulbare) mutati Corrado et al 541 52.2 35% ? 12 2.2 Del Bo et al 298 59.3 39% 21.4% 3 1.0 ITALSGEN 631 61.5 40% 30.0% 7 1.1 Mutazione più frequente in Italia: A382T Tutte e tre le famiglie presentano la mutazione missenso A382T nell’esone 6 Fenotipi correlati a mutazioni di TARDBP l l l l l l l SLA tipica (Sreedharan et al, 2008) SLA con FTD (Chiò et al, 2010) SLA con sintomi extrapidamidali (Floris et al 2012) SLA con paralisi sopranucleare (Chiò et al, 2010) TARBDP si comporta come un gene pleiotropico, cioè in grado Paralisi sopranucleare, corea e FTD (Kovacs et al, 2009) di determinare quadri clinici FTD senza malattia del motoneurone (Borroni et al, 2009) molto eterogenei Parkinsonismi atipici associati a FTD e UMN (Borghero et al, 2011) l Malattia di Parkinson tipica (Quadri et al, 2011) TARDBP è correlata a così tanti fenotipi clinici? l ‘… sono state identificate funzioni di TDP43 di considerevole complessità mediante le quali la proteina può agire influenzando vari processi cellulari (come la trascrizione del DNA, lo splicing pre-mRNA e l’export/import dell’m-RNA’ Fenotipi dei casi mutati Le mutazioni di TARDBP hanno una penetranza incompleta Penetranza : 77,9% (i.c. 95%, 61.7% - 87.2%) a 70 anni Ridotta penetranza nel sesso femminile? (Orrù et al, 2011) A382T/A382T C9ORF72: una lunga e difficile caccia 2006 2009 2010 l l l Presenza di un singolo aplotipo nei pazienti con linkage con 9p.21.2. Maggiore frequenza dell’aplotipo nelle popolazioni nord europee con gradiente nord-sud L’aplotipo si estende su 140kb e include tre geni MOBKL2B, C9orf72 e IFNK ALS/FTD2: Progressiva riduzione 9p21 previously linked to ALS dell’area di linkage del locus 9p21 Il locus sul cromosoma 9p21 giustifica un’elevata proporzione di casi di SLA 2011 Casi di SLA italiani sporadici consorzio ITALSGEN 140 120 100 80 60 40 20 0 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 28 30 32 34 36 38 40 42 44 46 48 50 52 54 56 58 60 62 64 66 68 70 Controlli, rosso SLA, blu Struttura genomica di c9orf72 e trascritti prodotti dallo splicing alternativo del pre-mRNA l Foci di RNA nucleare, possibile meccanismo patogeno di c9orf72 nella SLA e nella FTD C9orf72 - SLA e FTD: due espressioni fenotipiche dello stesso gene nella stessa famiglia Frequenza dei casi con espansione Renton et al # casi % c9orf72 exp. 112 46.4% # casi % c9orf72 exp. fALS finlandesi 112 46.4% fALS sALSamericani, finlandesi tedeschi e italiani 268 290 38.1% 21.0% 268 38.1% DeJesus-Hernandez et al # casi % c9orf72 exp. DeJesus-Hernandez et al # casi % c9orf72 exp. fFTD fFTD americani americani 237 237 19.0% 19.0% sFTD americani americani sFTD 256 5.5% fALS americani 34 23.5% sALS americani 195 4.1% fALS finlandesi Renton et al sALS finlandesi fALS americani, tedeschi e italiani 290 21.0% C9ORF72 in Italia Italiani # casi # espansi % # FTD %FTD fALS 120 45 37.5% 21 46.7% sALS 1624 60 3.7% 25 41.7% Sardi # casi % # FTD %FTD fALS 21 12 57.2% 7 58.3% sALS 133 9 6.8% 4 44.4% # espansi Chiò et al, Brain, 2012 Sabatelli et al, Neurobiol Aging, 2012 Confronto con gli altri geni della SLA Gene # index Gender Bulbar onset Cognitive Median age at onset cases (female) (%) impairment (%) (interquartile (%) range) C9ORF72 45 23 (51.1%) 19 (42.2%) 21 (46.7%) 59.0 (50.6-62.9) FUS 6 2 (33.3%) 1 (16.7%) 0 35.3 (30.4-39.6) SOD1 38 20 (52.6%) 3 (7.9%) 1 (2.6%) 50.0 (42.8-62.6) TARDBP 13 4 (30.8%) 4 (30.8%) 4 (30.8%) 66.0 (58.0-70.6) Unknown 75 32 (42.7%) 25 (33.3%) 7 (9.3%) 60.7 (53.0-68.9) Overall 177 § 81 (45.8%) 52 (29.4%) 32 (18.1%) 58.0 (47.7-67.5) p value - 0.54 0.011 0.0001 0.0001 gene Caratteristiche della disfunzione cognitiva nei pazienti con mutazione C9ORF72 Solo SLA e FTD? l Nei pazienti (e nelle famiglie) con SLA e FTD e mutazione C9ORF72 sono descritti sintomi ‘atipici’ l l l l Sintomi psicotici (allucinazioni e deliri) Altri disturbi psichiatrici (es, disturbo ossessivocompulsivo) Sintomi parkinsoniani Elevata frequenza di suicidi (FTD?) Un esempio di pleiotropismo del gene C9ORF72 l l l l l III-1: SLA pura III-2: SLA/bvFTD con sintomi psicotici II-1: bvFTD pura II-2: bvFTD pura III-4: diagnosi di schizofrenia FALS UNKNOWN TARDBP SOD1 FUS C9ORF72 … ma l’espressione fenotipica è davvero monogenica? Casi con doppia mutazione patogena C9ORF72 e TARDBP Caratteristiche cliniche della Famiglia A Famiglia A Età di esordio Esordio Fenotipo Durata di malattia Caso indice(II-2) 43 anni Bulbare ALS+FTD 34 mesi C9ORF72; TARDPB Padre del probando (II-8) 64 anni Spinale ALS+FTD 78 mesi C9ORF72 Madre del probando(II-9) 69 anni Spinale ALS+FTD 43 mesi TARDPB Fratello di probando (III-1) 33 anni Spinale ALS 75 mesi No DNA Nonno materno (I-3) Deceduto a 43 anni per incidente sul lavoro No DNA Nonna materna (I-4) Deceduta a a 91 anni per accidente carebrovascolare No DNA Nonno paterno (I-1) Deceduto a 47 anni per incidente sul lavoro No DNA Nonna paterna(I-2) Deceduta a 74 ani per tumore mammario No DNA Caso Mutazione Isolati genici: lo studio SARDINIALS l Caratteristiche l l l l Isolato genico Elevata incidenza Elevato numero di casi familiari Collaborazione fra l l l l l Università di Cagliari Università di Sassari Ospedale di Nuoro Università di Torino NIH, Bethesda, MD Sardegna Piemonte fALS 9% fALS 28% sALS 72% sALS 91% Sardegna, fALS Piemonte, fALS FUS 3% UNK 28% C9ORF72 30% UNK 43% SOD1 7% OPTN 3% C9ORF72 37% ANG 0% TARDBP 35% SOD1 TARDBP 6% 8% Calcolato sui casi indice Sardegna, sALS Piemonte, sALS C9ORF72 7% C9ORF72 4% TARDBP 19% SOD1 1% SOD1 0% UNK 74% TARDBP 1% UNK 94% NIA, NIH ITALSGEN l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l Gabriella Restagno Gabriele Mora Andrea Calvo Cristina Moglia Antonio Canosa Sara Gallo Maura Brunetti Irene Ossola Stefania Battistini Fabio Giannini Claudia Caponnetto Paola Mandich Gianluigi Mancardi Vincenzo La Bella Piera Paladino Rossella Spataro Maria Rosaria Monsurrò Gioacchino Tedeschi Isabella Simone Giancarlo Logroscino Kalliopi Mainou Maria A. Sotgiu l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l Mario Sabatelli Marcella Zollino Amelia Conte Jessica Mandrioli Patrizia Sola Fabrizio Salvi Ilaria Bartolomei Giuseppe Borghero Maria Rita Murru Giovanna M. Marrosu Maura Pugliatti Leslie D. Parish Gianluca Floris Antonino Cannas Laura Papetti Marco Luigetti Claudia Ricci Francesca L. Conforti Aldo Quattrone Massimo Corbo Silvana Penco Paolo Volanti Fabrizio Pisano • • • • • • • • • • • • • • Bryan J. Traynor Jennifer Schymick Hon-Chung Fung Sonja Scholz Linda Lai Michael Nalls Dena Hernandez Andrew Singleton Dalia Kasperaviciute (UCL, UK) Elizabeth Fisher (UCL, UK) Michael Sendnter (Wurtzberg, Germany) Marcus Beck (Wurtzberg, Germany) Erik Pioro (Cleveland, USA) Jeffrey Rothstein (Hopkins) Grazie per l’attenzione!