IL28B-ITPA TYPE Cod. 04-47A Kit per l’identificazione simultanea di polimorfismi nei geni IL28B e ITPA mediante Ibridazione Inversa Allele Specifica (Reverse Line Blot) Sovrapponendo alla strip ottenuta il lucido interpretativo è possibile determinare in modo semplice e veloce i polimorfismi eventualmente presenti. CARATTERISTICHE TECNICHE NUMERO DI TEST: 20 test STABILITA’: 6 mesi INTRODUZIONE Il Hepatitis C Virus (HCV) causa un’infezione cronica che può evolvere in epatite cronica, in cirrosi epatica o in carcinoma epatocellulare. Il trattamento standard attualmente raccomandato è rappresentato da Peg-Interferone-alfa-2a (PEG- INF) e ribavirina (RBV) per 24-48 settimane, tuttavia, tale regime è ben tollerato ed efficace solo nel 60% dei soggetti, mentre il 40% dei pazienti con genotipo 1 del virus non riesce ad ottenere una risposta virologica sostenuta (SVR). In letteratura sono stati presentati diversi studi che correlano l’efficacia della terapia oltre che a fattori virali anche a fattori genetici legati all’ospite. Rilevanti risultano essere dei polimorifsmi nella regione del gene IL28B (Interleuchina 28). Numerosi studi hanno riportato che individui omozigoti WT per i polimorifsmi rs8099917 e rs12979860 nel gene IL28B rispondono più efficacemente alla terapia (raggiungimento della SVR); inoltre, recentemente si è visto che gli omozigoti WT per altri due polimorfismi nel gene ITPA (Inosina Trifosfatasi) presentano un maggior rischio di sviluppare un’anemia emolitica cronica in seguito a trattamento con Ribavirina. Risulta pertanto importante, ai fine della gestione clinica dei pazienti con epatite C, conoscere a priori lo stato genetico del paziente al fine di scegliere una terapia il più efficace e mirata possibile. MATERIALE DI PARTENZA: DNA estratto AMPLIFICAZIONE: Premix monodose pronte all’uso. POLIMORIFSMI IDENTIFICATI: rs12979860 C>T nel gene IL28B rs8099917 T>G nel gene IL28B rs7270101 A>C nel gene ITPA rs1127354 C>A nel gene ITPA TEMPO DI ESECUZIONE: 3,5 ore PROCEDURA 1. AMPLIFICAZIONE DEL DNA: amplificazione multiplex premix, circa 2h e 30 minuti. 2. DEN. DELL’AMPLIFICATO: incubazione 5 min. a temperatura ambiente con soluzione di denaturazione; 3. IBRIDAZIONE e LAVAGGI: 60 minuti. 4. RIVELAZIONE COLORIMETRICA: 20 min mediante incubazione con i cromogeni (NBT/BCIP). PRINCIPIO DEL TEST Il kit IL28B-ITPA TYPE permette l’identificazione delle varianti genetiche associate alla variabilità inter-individuale nella riposta alla terapia con Interferone (IFN) e Ribavirina (RBV) in pazienti con Epatite C cronica. In particolare vengono indagate mediante amplificazione genica e successiva ibridazione inversa allele specifica i polimorifsmi: rs8099917 e rs12979860 nel gene IL28B e i polimorifsmi rs1127354 e rs7270101 nel gene ITPA. Controllo di colorazione IL28B rs12979860 C IL28B rs12979860 T IL28B rs8099917 T IL28B rs8099917 G ITPA rs7270101 A ITPA rs7270101 C ITPA rs1127354 C ITPA rs1127354 A REFERENZE Ge D, Fellay J, Thompson AJ et al.. Nature 2009; 461(7262): 399-401 Lindi NA, Wagner 6;115(18):3827-34. MJ et al. Blood. 2010 Meinkoth, J. and Wahl, G. et al., In Analytical Biochemistry, 138: 267, 1984. Rauch A, Kutalik Z et al., Gastroenterology. 2010 Apr;138(4):1338-45, 1345.e1-7. Suppiah V, Moldovan M et al., Nature Genetics 2009; 41: 1100-4 SCH TEC IL28 R030512 AB ANALITICA srl Via Svizzera 16 – 35127 PADOVA – ITALIA Tel. 049 761698 - Fax 049 8709510 e-mail: [email protected] www. abanalitica.it May