Sandionigi Anna

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Curriculum vitae
INFORMAZIONI PERSONALI
Sandionigi Anna
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Sesso ##
| Data di nascita ##
| Nazionalità ##
ESPERIENZA
PROFESSIONALE
01/05/2014–alla data attuale
Postdoctoral researcher
Università degli Studi Milano Bicocca, Milano (Italia)
Data analysis, Bioniformatics, Analisi statistiche di dati metagenomic, NGS data analysis.
01/03/2014–30/04/2014
Collaborazione esterna
Università degli Studi Milano Bicocca, Milano (Italia)
Disegno e scrittura di progetti scientifici ed educativi per la Ricerca.
Scrittura per chiamate Progetti Fondazione Cariplo Lombardia
01/2011–12/2013
Dottorato di ricerca in Biologia
Università degli Studi di Milano Bicocca, Milano (Italia)
Sviluppo di nuove capacità e nuovi strumenti per l'analisi di sistemi biologici complessi.
01/2010–12/2010
Collaboratore di ricerca
Laboratorio di Antropologia molecolare; Università degli studi di Firenze, Firenze (Italia)
Responsabile di uno studio sulla caratterizzazione genetica della popolazione etrusca
09/2010–12/2010
Collaboratore di ricerca
Museo di Storia Naturale del Mediterraneo, Livorno (Italia)
Consulente per la messa appunto di un laboratorio di analisi molecolare per la valorizzazione delle
collezioni scientifiche naturalistiche museali.
07/2009–10/2009
Guida naturalistica
Orto Botanico Pietro Pellegrini, Pian della Fioba, MS (Italia)
Guida naturalistica botanica con particolari mansioni nell'ambito dell'educazione ambientale indirizzata
alle scuole.
09/2007–12/2009
Stage di tesi
Laboratorio di Antropologia Molecolare; Università degli studi di Firenze, Firenze (Italia)
Ricerca applicata nell'ambito della caratterizazione genetica delle popolazioni antiche abitanti la piana
di Lucca.
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05/2003
Sandionigi Anna
Stage di Tesi
Università degli Studi di Milano, Milano (Italia)
Ricerca applicata allo studio del comportamento di Andrena agilissima (Ordine: Hymenoptera). Studio
in ambito ecologico ed etologico.
ISTRUZIONE E FORMAZIONE
12/2013
Dottorato di ricerca in Biologia
Università degli studi Milano Bicocca, Milano (Italia)
Data analysis, Biostatistica, Biologia molecolare, bioinformatica.
12/2009
Laurea in Scienze Biologiche
Università di Pisa, Pisa (Italia)
Laurea specialistica. Votazione 107/110.
02/2008
Laurea Scienze ecologiche e della biodiversità (Classe Scienze
biologiche)
Università di Pisa, Pisa (Italia)
Laurea triennale
09/2006–06/2007
Partecipante programma Socrates Erasmus
Universidad Complutense de Madrid, Madrid (Italia)
COMPETENZE PERSONALI
Lingua madre
italiano
Altre lingue
inglese
spagnolo
COMPRENSIONE
PARLATO
PRODUZIONE SCRITTA
Ascolto
Lettura
Interazione
Produzione orale
B2
C2
B2
B2
B2
C1
C1
C1
C1
B2
Livelli: A1 e A2: Utente base - B1 e B2: Utente autonomo - C1 e C2: Utente avanzato
Quadro Comune Europeo di Riferimento delle Lingue
Competenze comunicative
Ottime capacità di relazione acquisite durante i numerosi lavori di gruppo effettuati durante gli anni di
formazione e le diverse esperienze di insegnamento.
Ottime capacità di adattamento a diversi ambiti lavorativi e di inserimento in ambito di progetti già in
atto.
Tutte le competenze sono state acquisite sia in ambito nazionale che in quello internazionale.
Competenze organizzative e
gestionali
Ottime capacità di gestione e di logistica in progetti di tipo scientifico ed educativo maturate negli anni
di formazione e di lavoro con gruppi differenti. La frequentazione di diversi ambiti universitari ha
portato a un'ampia conoscenza di differenti strategie di progettazione sperimentale.
Ottime competenze al fine di programmare, progettare ed tenere corsi e lezioni in ambito scientifico.
Competenze professionali
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Creazione di strumenti per analisi statistiche di sistemi biologici complessi.
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Sandionigi Anna
Network analisi.
Creazione e gestione di Database.
Progettazione di piattaforme e siti web per la diffusione di materiale scientifico a scopo didattico e di
ricerca.
Utilizzo di software grafici per la creazione di presentazioni grafiche a scopo scientifico. (Grafici per
riviste IF, Poster, Presentazioni multimediali).
Scrittura progetti scientifici (nazionali/EU)
Scrittura articoli scientifici con target riviste internazionali ISI
Analisi della strutturazione in termini ecologici di comunità di tipo batterico.
Gestione di nuovi approcci di analisi statistiche in ambito filogenetico.
Gestione e analisi di output di sequenziamenti di nuova generazione (NGS).
Metodologie di analisi sperimentale in ambito molecolare quali estrazione di DNA e RNA da tessuti e
organismi differenti con una specializzazione nel trattamento di reperti antichi e museali;
quantificazione ed elettroforesi di acidi nucleici; amplificazione e sequenziamento di DNA.
Competenze informatiche
Uso avanzato di sistemi UNIX (Bash programming).
Ottima padronanza del linguaggio di programmazione R, ottima padronanza nell'uso dei pacchetti
(Bioconductor, RStudio)
Programmazione di base in Python e HTML.
Ottima padronanza dei maggiori strumenti per le analisi statistiche di dati biologici in ambito
genetico/molecolare. Ottima padronanza della pipeline di analisi QIIME.
Buone padronanza dei maggiori CSM per la creazione di piattaforme web (creatrice e webmaster
di :http://www.zooplantlab.it/).
Buona padronanza del sistema SQL per la gestione di database.
Buona padronanza dei principali software per la gestione di immagini (Illustrator, photoshop, GIMP,
Inskape)
Ottima padronanza del linguaggio di markup LaTeX
Ottima padronanza dei principali software di gestione di testi (Office package).
ULTERIORI INFORMAZIONI
Didattica
2011/12/13/14/15: Milano, Italia
Professore a contratto, Esercitazioni pratiche Zoologia, nell'ambito del corso di Zoologia I del Prof.
Maurizio Casiraghi
24/11/2014:Pisa, Italia
Lezione dal titolo: "Metagenomic: new perspective in the ecology field" nell'ambito del corso di
Macroecologia marina. Su invito di: Dr. Laura Tamburello
02/12/2013: Pisa, Italia
Lezione dal titolo: "Metagenomic: new perspective in the ecology field" nell'ambito del corso di
Macroecologia marina. Su invito di: Dr. Laura Tamburello
04/11/2013: Gothenburg, Svezia
Lezione/Tutorial nell'ambito del corso: "An Introduction to bioinformatic tools for metagenetic and
population genomic data analysis" (Prima parte). Su invito di: Dr. Sarah J. Bourlat
11-12/06/2013: Modena, Italia
Lezione dal titolo: " Processi di analisi. DNA barcoding", nell'ambito del corso "Corso base di DNA
barcoding". Su invito di: Dr. Roberto Guidetti
Presentazioni
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Selezione delle comunicazioni a Congressi Nazionali e Internazionali
Poster PAG XXIII2015, San Diego, CA, USA
Gian Maria Niccolò Benucci, Anna Sandionigi, Massimo Labra, Luisa Massacesi, Alberto Agnelli,
Domizia Donnini, Emidio Albertini. Different microbiomes are hosted in the rhizosphere and
mycorrhizosphere of Tuber magnatum truffle seedlings. 2014
Poster FISV2014, Pisa, Italy
Anna Sandionigi, Saverio Vicario, Antonia Bruno, Bachir Balech, Emanuele Ferri, Maurizio
Casiraghi. Testing PhyloH, a new phylogenetic approach on diversity analyses of bacterial
communities.
Poster MD2013, Turin, Italy
Anna Sandionigi , Erica Prosdocimi, Maurizio Casiraghi. Analysis of bacterial communities involved
in the parasite symbiosis between Apis mellifera and Varroa destructor.
Oral Presentation ISEB 2013, Trento, Italy
Anna Sandionigi , Erica Prosdocimi, Maurizio Casiraghi. A hypothesis on the interactions between
microbiomes in a parasitic relationship: The case of Apis mellifera and its parasite Varroa destructor.
Poster BioSyst.EU 2013, Wien, Austria
Anna Sandionigi , Erica Prosdocimi, Maurizio Casiraghi. Characterization of the microbial consortium
associated to Varroa destructor and its host, Apis mellifera
Poster SMBE 2012 Dublin, Irlanda
Silvia Ghirotto , Francesca Tassi , Erica Fumagalli , Vincenza Colonna , Anna Sandionigi, Martina
Lari, Stefania Vai , Emmanuele Petiti , Giorgio Corti , Ermanno Rizzi , Gianluca De Bellis, David
Caramelli , Guido Barbujani. Origins and evolution of the Etruscans’ DNA.
Poster UZI (Unione zoologica italiana) 2011, Bologna, Italy
A. Bellati, M. Sticco, A. Galimberti, A. Sandionigi, S. Scali, M. Casiraghi. First molecular
characterization of Natrix natrix complex.
Corsi e Workshop
22-24/04/2015 Pavia. Italy
"Casual inference in ecology"
15-19/09/2014 Wageningen. Olanda
"Environmental Metagenomics Course & Symposium"
11/06/2014 Milan. Italy
"RNA-Seq Workshop for the Bioinformatician"
4-8/11/2013 Gothenburg. Svezia
"An Introduction to bioinformatic tools for metagenetic and population genomic data analysis".
(Seconda parte)
12-14/09/2012 Basel. Svizzera
"The Evolution and Ecology of Host-associated Microbiota."
14-18/05/2012 Modena. Italia
"Italian workshop on phylogenetic methods and applications."
12-13/12/2011 Modena. Italia
"Il DNA barcoding: quali prospettive e applicazioni in Italia?"
29/08-1/09/2011 Asti. Italia
"Third italian workshop on phylogenetic methods and applications."
3-9/07/2011 Chioggia. Italia
"Summer School on Conservation Genetics of Marine Organisms"
Pubblicazioni
Comtet, T. et al., (2015) DNA (meta) barcoding of biological invasions: a powerful tool to elucidate
invasion processes and help managing aliens. Biological Invasions, 17(3), 905-922.
Sandionigi, A. et al., (2014) Towards a better understanding of Apis mellifera and Varroa destructor
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Sandionigi Anna
microbiomes: introducing ‘phyloh’as a novel phylogenetic diversity analysis tool. Molecular ecology
resources.
Galimberti, A. etal., (2014)A DNA barcoding approach to characterize pollen collected by honeybees.
PloS one 9(10), e109363.
Galimberti, A. et al., (2014) DNA Barcoding for Minor Crops and Food Traceability. Advances in
Agriculture.
Ghirotto, S. et al., (2013) Origin and Evolution of the Etruscan’mtDNA PloS one 8, e55519.
Sandionigi, A. et al. (2012) Analytical approaches for DNA barcoding data – how to find a way for
plants? Plant Biosystems 146, 805-813
Revisore Riviste
Bioinformatics
PloS ONE
Il sottoscritto acconsente, ai sensi del D.Lgs 30/06/2003 n.196, al trattamento dei
propri dati personali. Il sottoscritto acconsente alla pubblicazione del presente
curriculum vitae sul sito dell'Università di Ferrara
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