Curriculum vitae INFORMAZIONI PERSONALI Sandionigi Anna ##### ##### ##### Sesso ## | Data di nascita ## | Nazionalità ## ESPERIENZA PROFESSIONALE 01/05/2014–alla data attuale Postdoctoral researcher Università degli Studi Milano Bicocca, Milano (Italia) Data analysis, Bioniformatics, Analisi statistiche di dati metagenomic, NGS data analysis. 01/03/2014–30/04/2014 Collaborazione esterna Università degli Studi Milano Bicocca, Milano (Italia) Disegno e scrittura di progetti scientifici ed educativi per la Ricerca. Scrittura per chiamate Progetti Fondazione Cariplo Lombardia 01/2011–12/2013 Dottorato di ricerca in Biologia Università degli Studi di Milano Bicocca, Milano (Italia) Sviluppo di nuove capacità e nuovi strumenti per l'analisi di sistemi biologici complessi. 01/2010–12/2010 Collaboratore di ricerca Laboratorio di Antropologia molecolare; Università degli studi di Firenze, Firenze (Italia) Responsabile di uno studio sulla caratterizzazione genetica della popolazione etrusca 09/2010–12/2010 Collaboratore di ricerca Museo di Storia Naturale del Mediterraneo, Livorno (Italia) Consulente per la messa appunto di un laboratorio di analisi molecolare per la valorizzazione delle collezioni scientifiche naturalistiche museali. 07/2009–10/2009 Guida naturalistica Orto Botanico Pietro Pellegrini, Pian della Fioba, MS (Italia) Guida naturalistica botanica con particolari mansioni nell'ambito dell'educazione ambientale indirizzata alle scuole. 09/2007–12/2009 Stage di tesi Laboratorio di Antropologia Molecolare; Università degli studi di Firenze, Firenze (Italia) Ricerca applicata nell'ambito della caratterizazione genetica delle popolazioni antiche abitanti la piana di Lucca. 5/5/15 ©Unione europea, 2002-2015 | http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 1 / 5 Curriculum vitae 05/2003 Sandionigi Anna Stage di Tesi Università degli Studi di Milano, Milano (Italia) Ricerca applicata allo studio del comportamento di Andrena agilissima (Ordine: Hymenoptera). Studio in ambito ecologico ed etologico. ISTRUZIONE E FORMAZIONE 12/2013 Dottorato di ricerca in Biologia Università degli studi Milano Bicocca, Milano (Italia) Data analysis, Biostatistica, Biologia molecolare, bioinformatica. 12/2009 Laurea in Scienze Biologiche Università di Pisa, Pisa (Italia) Laurea specialistica. Votazione 107/110. 02/2008 Laurea Scienze ecologiche e della biodiversità (Classe Scienze biologiche) Università di Pisa, Pisa (Italia) Laurea triennale 09/2006–06/2007 Partecipante programma Socrates Erasmus Universidad Complutense de Madrid, Madrid (Italia) COMPETENZE PERSONALI Lingua madre italiano Altre lingue inglese spagnolo COMPRENSIONE PARLATO PRODUZIONE SCRITTA Ascolto Lettura Interazione Produzione orale B2 C2 B2 B2 B2 C1 C1 C1 C1 B2 Livelli: A1 e A2: Utente base - B1 e B2: Utente autonomo - C1 e C2: Utente avanzato Quadro Comune Europeo di Riferimento delle Lingue Competenze comunicative Ottime capacità di relazione acquisite durante i numerosi lavori di gruppo effettuati durante gli anni di formazione e le diverse esperienze di insegnamento. Ottime capacità di adattamento a diversi ambiti lavorativi e di inserimento in ambito di progetti già in atto. Tutte le competenze sono state acquisite sia in ambito nazionale che in quello internazionale. Competenze organizzative e gestionali Ottime capacità di gestione e di logistica in progetti di tipo scientifico ed educativo maturate negli anni di formazione e di lavoro con gruppi differenti. La frequentazione di diversi ambiti universitari ha portato a un'ampia conoscenza di differenti strategie di progettazione sperimentale. Ottime competenze al fine di programmare, progettare ed tenere corsi e lezioni in ambito scientifico. Competenze professionali 5/5/15 Creazione di strumenti per analisi statistiche di sistemi biologici complessi. © Unione europea, 2002-2015 | http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 2 / 5 Curriculum vitae Sandionigi Anna Network analisi. Creazione e gestione di Database. Progettazione di piattaforme e siti web per la diffusione di materiale scientifico a scopo didattico e di ricerca. Utilizzo di software grafici per la creazione di presentazioni grafiche a scopo scientifico. (Grafici per riviste IF, Poster, Presentazioni multimediali). Scrittura progetti scientifici (nazionali/EU) Scrittura articoli scientifici con target riviste internazionali ISI Analisi della strutturazione in termini ecologici di comunità di tipo batterico. Gestione di nuovi approcci di analisi statistiche in ambito filogenetico. Gestione e analisi di output di sequenziamenti di nuova generazione (NGS). Metodologie di analisi sperimentale in ambito molecolare quali estrazione di DNA e RNA da tessuti e organismi differenti con una specializzazione nel trattamento di reperti antichi e museali; quantificazione ed elettroforesi di acidi nucleici; amplificazione e sequenziamento di DNA. Competenze informatiche Uso avanzato di sistemi UNIX (Bash programming). Ottima padronanza del linguaggio di programmazione R, ottima padronanza nell'uso dei pacchetti (Bioconductor, RStudio) Programmazione di base in Python e HTML. Ottima padronanza dei maggiori strumenti per le analisi statistiche di dati biologici in ambito genetico/molecolare. Ottima padronanza della pipeline di analisi QIIME. Buone padronanza dei maggiori CSM per la creazione di piattaforme web (creatrice e webmaster di :http://www.zooplantlab.it/). Buona padronanza del sistema SQL per la gestione di database. Buona padronanza dei principali software per la gestione di immagini (Illustrator, photoshop, GIMP, Inskape) Ottima padronanza del linguaggio di markup LaTeX Ottima padronanza dei principali software di gestione di testi (Office package). ULTERIORI INFORMAZIONI Didattica 2011/12/13/14/15: Milano, Italia Professore a contratto, Esercitazioni pratiche Zoologia, nell'ambito del corso di Zoologia I del Prof. Maurizio Casiraghi 24/11/2014:Pisa, Italia Lezione dal titolo: "Metagenomic: new perspective in the ecology field" nell'ambito del corso di Macroecologia marina. Su invito di: Dr. Laura Tamburello 02/12/2013: Pisa, Italia Lezione dal titolo: "Metagenomic: new perspective in the ecology field" nell'ambito del corso di Macroecologia marina. Su invito di: Dr. Laura Tamburello 04/11/2013: Gothenburg, Svezia Lezione/Tutorial nell'ambito del corso: "An Introduction to bioinformatic tools for metagenetic and population genomic data analysis" (Prima parte). Su invito di: Dr. Sarah J. Bourlat 11-12/06/2013: Modena, Italia Lezione dal titolo: " Processi di analisi. DNA barcoding", nell'ambito del corso "Corso base di DNA barcoding". Su invito di: Dr. Roberto Guidetti Presentazioni 5/5/15 © Unione europea, 2002-2015 | http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 3 / 5 Curriculum vitae Sandionigi Anna Selezione delle comunicazioni a Congressi Nazionali e Internazionali Poster PAG XXIII2015, San Diego, CA, USA Gian Maria Niccolò Benucci, Anna Sandionigi, Massimo Labra, Luisa Massacesi, Alberto Agnelli, Domizia Donnini, Emidio Albertini. Different microbiomes are hosted in the rhizosphere and mycorrhizosphere of Tuber magnatum truffle seedlings. 2014 Poster FISV2014, Pisa, Italy Anna Sandionigi, Saverio Vicario, Antonia Bruno, Bachir Balech, Emanuele Ferri, Maurizio Casiraghi. Testing PhyloH, a new phylogenetic approach on diversity analyses of bacterial communities. Poster MD2013, Turin, Italy Anna Sandionigi , Erica Prosdocimi, Maurizio Casiraghi. Analysis of bacterial communities involved in the parasite symbiosis between Apis mellifera and Varroa destructor. Oral Presentation ISEB 2013, Trento, Italy Anna Sandionigi , Erica Prosdocimi, Maurizio Casiraghi. A hypothesis on the interactions between microbiomes in a parasitic relationship: The case of Apis mellifera and its parasite Varroa destructor. Poster BioSyst.EU 2013, Wien, Austria Anna Sandionigi , Erica Prosdocimi, Maurizio Casiraghi. Characterization of the microbial consortium associated to Varroa destructor and its host, Apis mellifera Poster SMBE 2012 Dublin, Irlanda Silvia Ghirotto , Francesca Tassi , Erica Fumagalli , Vincenza Colonna , Anna Sandionigi, Martina Lari, Stefania Vai , Emmanuele Petiti , Giorgio Corti , Ermanno Rizzi , Gianluca De Bellis, David Caramelli , Guido Barbujani. Origins and evolution of the Etruscans’ DNA. Poster UZI (Unione zoologica italiana) 2011, Bologna, Italy A. Bellati, M. Sticco, A. Galimberti, A. Sandionigi, S. Scali, M. Casiraghi. First molecular characterization of Natrix natrix complex. Corsi e Workshop 22-24/04/2015 Pavia. Italy "Casual inference in ecology" 15-19/09/2014 Wageningen. Olanda "Environmental Metagenomics Course & Symposium" 11/06/2014 Milan. Italy "RNA-Seq Workshop for the Bioinformatician" 4-8/11/2013 Gothenburg. Svezia "An Introduction to bioinformatic tools for metagenetic and population genomic data analysis". (Seconda parte) 12-14/09/2012 Basel. Svizzera "The Evolution and Ecology of Host-associated Microbiota." 14-18/05/2012 Modena. Italia "Italian workshop on phylogenetic methods and applications." 12-13/12/2011 Modena. Italia "Il DNA barcoding: quali prospettive e applicazioni in Italia?" 29/08-1/09/2011 Asti. Italia "Third italian workshop on phylogenetic methods and applications." 3-9/07/2011 Chioggia. Italia "Summer School on Conservation Genetics of Marine Organisms" Pubblicazioni Comtet, T. et al., (2015) DNA (meta) barcoding of biological invasions: a powerful tool to elucidate invasion processes and help managing aliens. Biological Invasions, 17(3), 905-922. Sandionigi, A. et al., (2014) Towards a better understanding of Apis mellifera and Varroa destructor 5/5/15 © Unione europea, 2002-2015 | http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 4 / 5 Curriculum vitae Sandionigi Anna microbiomes: introducing ‘phyloh’as a novel phylogenetic diversity analysis tool. Molecular ecology resources. Galimberti, A. etal., (2014)A DNA barcoding approach to characterize pollen collected by honeybees. PloS one 9(10), e109363. Galimberti, A. et al., (2014) DNA Barcoding for Minor Crops and Food Traceability. Advances in Agriculture. Ghirotto, S. et al., (2013) Origin and Evolution of the Etruscan’mtDNA PloS one 8, e55519. Sandionigi, A. et al. (2012) Analytical approaches for DNA barcoding data – how to find a way for plants? Plant Biosystems 146, 805-813 Revisore Riviste Bioinformatics PloS ONE Il sottoscritto acconsente, ai sensi del D.Lgs 30/06/2003 n.196, al trattamento dei propri dati personali. Il sottoscritto acconsente alla pubblicazione del presente curriculum vitae sul sito dell'Università di Ferrara 5/5/15 ©Unione europea, 2002-2015 | http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 5 / 5