HPC e Big Data per la bioinformatica

NEXT GENERATION SEQUENCING -PRECISION MEDICINE
-
AGROFOOD
HPC E BIG DATA PER LA
BIOINFORMATICA
ll trattamento delle grandi moli di dati prodotte negli
esperimenti di sequenziamento del genoma (Next-generation
DNA sequencing - NGS) richiede potenza di calcolo,
capacità di storage, un ricco ambiente software e dati
pubblici di tipo “omico”. Tutto deve essere opportunamente
combinato per permettere l'analisi, la ricerca,
l'organizzazione e la comparazione dei dati prodotti da
centinaia o anche migliaia di esperimenti NGS.
L'ambiente Data Intensive per la bioinformatica costruito al
Cineca risponde a diverse finalità: salute umana (NGS
applicata alla diagnostica, trascrittomica, epigenetica ed
interazione proteina-DNA; modellistica di proteine e
mutanti patogeni; docking e drug design); genetica animale
(modelli di miglioramento genetico; studio di malattie da
modelli animali); agroalimentare (metagenomica per
l'identificazione di patogeni, qualità e tracciabilità del
prodotto), e altri ancora.
Il Cineca è un Consorzio Interuniversitario senza scopo di
lucro. Costituito nel 1969, oggi è composto da 70 Università
italiane cinque Enti nazionali di ricerca e il Ministero
dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca (MIUR).
Offre
supporto alla comunità scientifica tramite il supercalcolo e le
sue applicazioni, e sviluppa sistemi informativi per le
amministrazioni universitarie e il MIUR, oltre che per imprese,
sanità e pubblica amministrazione.
Dispone di
un’infrastruttura all'avanguardia, e competenze scientifiche di
eccellenza a supporto del mondo della ricerca pubblica e
privata: è infatti il maggiore centro di supercalcolo italiano per
la ricerca e uno dei più importanti a livello mondiale.
CINECA
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2016