MLL Break Apart Sonde per Citogenetica Molecolare (FISH) Descrizione della sonda La sonda CGI MLL Break Apart è stata sviluppata per la rilevazione delle traslocazioni che coinvolgono il gene MLL sul cromosoma 11q23.3 mediante ibridazione in situ fluorescente (FISH). Sono stati descritti almeno 54 geni partner di traslocazione. Traslocazioni che coinvolgono MLL sono state trovate sia nella leucemia linfoblastica acuta (LLA) (3-10%) che nella leucemia mieloide acuta (LMA) (8-10%) e hanno rilevanza clinica. Le implicazioni prognostiche tuttavia dipendono dall’età e dal fenotipo della leucemia. LLA infantili con riarrangiamenti del MLL (circa 80%) sono ad alto rischio e richiedono un trattamento aggressivo. Nella LMA, la prognosi è intermedia e non è in relazione all’età. Traslocazioni di MLL si osservano anche in quasi il 25% dei pazienti con leucemie correlate alla terapia, in particolare quelle che insorgono a seguito di un trattamento co gli inibitori del DNA topoisomerasi II e la pognosi in questi pazienti è infausta. Oltre alle traslocazioni, in un sottogruppo di LLA e LMA possono verificarsi delezioni al 3’ e amplificazioni di MLL. Rappresentazione schematica della sonda MLL Break Apart MLL 11q23 centromere 5’ ~770kb Le barre orizzontali rossa e verde indicano le regioni coperte dalla sonda (approssimate alla scala NCBI Build 36.1/Hg18/2006). I breakpoints sul gene MLL coprono una regione di 8 kb compresa tra gli esoni 5 e 11 (frecce). La marcatura diretta 5’ MLL (verde) si affianca al gene MLL e può rilevare traslocazioni, amplificazioni e delezioni della parte 3’ MLL. telomere 3’ ~820kb MLL 11 Interpretazione del segnale Nei nuclei metafisici e interfasici normali diploidi, la sonda genera due segnali di fusione (rosso/verde o giallo) corrispondenti ai due cromosomi che coinvolgono MLL, il pattern che si osserva con più frequenza è una fusione che rappresenta il cromosoma 11 normale ed un segnale rosso e uno verde che rappresentano i cromosomi derivativi (figura 2). Le amplificazioni, le delezioni a 3’ di MLL, le copie aggiuntive del cromosoma 11, eventuali traslocazioni sbilanciate, le copie multiple dei derivativi possono dare luogo a delle variante nel pattern dei segnali e queste dovrebbero essere confermate analizzando la metafase qualora sia possibile. Figura 1: Metafase diploide normale e nucleo in interfase (da sangue periferico normale) con 2 segnali di fusione (rosso/verde o giallo) Referenze 1. Meyer, C., et al., Leukemia, 2009. 23: 1490-9. 2. Coenen, E.A., et al., Blood, 2011. 117(26): 7102-11. 3. Chowdhury, T., et al. Blood Cells Mol Dis, 2008. 40:192-199. 4. Barber, K. E, et al. Genes Chromosomes Cancer, 2001. 41:226-271. 5. Andersen, M. K, et al. Genes Chromosomes Cancer, 2001. 31:33-41 www.technogenetics.it Figura 2: Nucleo in interfase con 1 segnale di fusione (rosso/verde o giallo), 1 rosso (3’ MLL) e 1 verde (5’ MLL). Filtri Microscopio a Fluorescenza Fluoroforo Eccitazione max Emissione max Verde 496 nm 520 nm Rosso 580 nm 603 nm DAPI 360 nm 460 nm 27