COLONIE2007 rev D - www.immaginiecomputer.it

Colonie-Plus
Sistema Digitale Automatico per Acquisizione e Analisi
Quantitativa di colture cellulari e/o batteriche in vitro
Colonie-Plus è uno strumento per la conta di colonie di semplice ed immediato utilizzo, concepito per
impieghi di screening a medio/alto rendimento sia nel campo diagnostico che nella ricerca di base od
avanzate.
Colonie-Plus è caratterizzato da una filosofia costruttiva improntata alla semplicità ed immediatezza di
utilizzo asservita dalla più avanzata e sofisticata tecnologia disponibile nel campo della acquisizione digitale
e della analisi quantitativa di colture cellulari o batteriche in vitro.
Colonie-Plus è stato studiato e realizzato con l’obiettivo di fornire le massime prestazioni in termini di
accuratezza, ripetibilità ed affidabilità delle quantificazioni con la migliore sensibilità e definizione possibili,
nel modo più naturale e confortevole possibile per l’utente.
Colonie-Plus è uno strumento automatico, pratico e versatile, in grado di valutare con poche e dirette
istruzioni campioni, seminati sia in sospensione liquida o semisolida che fissati su plastica, in forma
indipendente dalla tipologia del supporto utilizzato per la crescita delle colonie. (Petri / Multipozzetto).
IMMAGINI & COMPUTER Snc
Via Don Carlo Riva, 4 – 20010 Bareggio (Mi)
Tel 02/90.36.40.90 – Fax 02/90.36.40.57
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SICUREZZA DEI DATI
Colonie-Plus garantisce la tracciabilità delle analisi effettuate sui campioni grazie alla registrazione di tutte le
fasi operative svolte dall’utente (in conformità allo standard internazionale CR21/11).
L’accesso al sistema è regolamentato attraverso la dichiarazione dell’utente e la digitazione del relativo
codice di accesso.
Le immagini, le informazioni ad esse relative ed i risultati ottenuti dalla analisi dei campioni saranno registrati
all’interno del database locale, unitamente alle referenze dell’utente che le ha generate.
Il database risulta consultabile e gestibile solo ad utenti autorizzati.
SEMPLICITÀ D’USO
La gestione del sistema Colonie-Plus avviene attraverso un semplice menù
contenente tutti i passaggi necessari al completamento dell’analisi.
Lo sviluppo delle operazioni è stato studiato nel modo più razionale e
naturale possibile per consentirne l’impiego anche ad operatori non esperti.
La procedura inizia con la creazione dell’esperimento all’interno del
database e termina con la esportazione dei risultati dell’analisi effettuata su
file ASCII (compatibile con Excel), toccando tutti i passi intermedi
(acquisizione, verifica delle immagini ect) necessari per il suo corretto
compimento.
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LETTURA DEI SUPPORTI
Colonie-Plus opera con differenti tipologie di supporti tra i quali:
Petri 90mm
Petri 50mm
Petri 35mm
Multiwells 6 pozzetti
Multiwells 12 pozzetti
Multiwells 24 pozzetti
(opzionale Multiwells 48 e 96 pozzetti)
Attraverso dei supporti meccanici di adattamento, forniti con il
sistema, i singoli supporti sono posizionati nell’unità di
acquisizione in corrispondenza della sorgente di illuminazione a
stato solido.
La sezione di digitalizzazione delle immagini è composta da una
telecamera digitale monocromatica ad elevata risoluzione interfacciata con un’ottica telecentrica a focale
fissa in grado di riprendere una superficie pari a 26 x 20 mm (equivalente alla dimensione di un singolo
pozzetto nella multiwell da 24).
L’ottica telecentrica assicura la completa assenza di deformazioni prospettiche dell’immagine in prossimità
dei bordi del supporto mantenendo perfetta la geometria delle colonie su tutta la superficie analizzata.
La sorgente di illuminazione a stato solido (LED) garantisce una emissione di intensità di illuminazione
costante ed una variazione della disomogeneità di diffusione della stessa su tutta la superficie del pozzetto
contenuta.
In presenza di pozzetti aventi una dimensione superiore a quella ripresa dall’ottica, il sistema provvederà
automaticamente a calcolare ed acquisire il numero di immagini necessarie a coprire l’intera superficie in
esame componendo le stesse in un’unica immagine rappresentante l’intero pozzetto.
Durante la scansione del pozzetto la piastra sarà mossa da un sistema di traslazione motorizzato XY
completamente controllato dal programma.
Con la tecnica a scansione Colonie-Plus è in grado di assicurare gli stessi standard di accuratezza,
ripetibilità e risoluzione in forma indipendente dalla tipologia del supporto utilizzato e senza la necessità di
regolazioni od impostazioni da parte dell’operatore.
La risoluzione spaziale assoluta è pari a 18 microns con possibilità di discriminare colonie aventi un diametro
minimo di 36 microns.
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ANALISI DEI SUPPORTI
Le immagini relative ai singoli pozzetti, acquisiti nell’ambito dello stesso
esperimento, vengono analizzate in sequenza da Colonie-Plus secondo
il seguente protocollo:
Individuazione dell’area interna al pozzetto.
Normalizzazione delle condizioni di contrasto dell’immagine.
Identificazione delle colonie con eliminazione degli artefatti o del
materiale inquinante.
Identificazione dei clusters
La discriminazione tra colonie singole ed i clusters (agglomerati di colonie) è effettuata attraverso la
valutazione di una serie di parametri di forma (Morfologici) e di dimensioni (Morfometrici) impostati in
accordo con le caratteristiche della linea cellulare o batterica in esame.
Tali parametri potranno essere sia estrapolati valutando una popolazione di riferimento presente nello stesso
esperimento (controlli) che definiti manualmente dall’operatore.
Colonie-Plus è in grado di fornire:
Numero di colonie singole presenti nel pozzetto
Numero di Clusters presenti nel pozzetto
Numero stimato di colonie per cluster
Numero stimato totale di colonie presenti nel pozzetto
Diametro Minimo, medio e massimo delle colonie singole
Area Minima, media e massima delle colonie singole
Statistica di base sui parametri ottenuti dai singoli pozzetti
ESPORTAZIONE DEI RISULTATI
Colonie-Plus memorizza i risultati dell’analisi all’interno del database esperimenti per future consultazioni.
E’ prevista la loro esportazione su file ASCII compatibili con i più diffusi fogli di calcolo (Excel)
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MODULI SOFTWARE OPZIONALI
AMES-PLUS
Modulo software per la valutazione del potenziale mutagenico (test di Ames)
Il Test di Ames e' utilizzato per determinare il potenziale mutagenico che un prodotto chimico puo'sviluppare
all' interno di un organismi vivente.
Il test e' realizzato attraverso l'esposizione di culture in vitro di un particolare batterio (Salmonella
Typhimuriom) all’agente potenzialmente mutagenico ed alla loro successiva quantificazione.
La valutazione del potenziale mutagenico avviene comparando la crescita del numero di colonie batteriche
presenti nella coltura esposta con uno standard di riferimento.
AMES-PLUS opera effettuando una precisa ed accurata conta batterica all'interno delle piastre di coltura
facenti parte dell'esperimento.
Basato su particolari ed innovativi algoritmi per il riconoscimento e la separazione delle colonie batteriche,
AMES-PLUS e' in grado rapidamente di valutare un'intero esperimento fornendo i dati statistici riassuntivi
dello stesso.
Le caratteristiche principali di AMES-PLUS sono:
Esperimento
6 concentrazioni di prodotto S9
7 repliche per concentrazione di prodotto
5 ceppi
6 standard
7 repliche per standard
Lettura Colonie
5 letture per piastra
Correzione del conteggio
Filtri per il riconoscimento delle colonie batteriche
Livello di sensibilita' regolabile (Manuale/Auto)
Separazione agglomerati di colonie
Definizione dell'area di analisi
Dati
Esportazione dei dati in formato ASCII
Stampa dati in formato tabellare
Esportazione dati e stampa report personalizzati
su programma Microsoft Word.
Statistica
Calcolo Media e Deviazione standard
Stampa della statistica
Esportazione della statistica in formato ASCII
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