Andrea Angius Curriculum Vitae ANDREA ANGIUS Curriculum Vitae et Studiorum Titoli 2014 – Abilitazione Scientifica Nazionale in 05/I1 Seconda Fascia– Genetica e Microbiologia (BIO 18) 1999 - Dottorato di Ricerca in Biochimica Comparata degli Ecosistemi, Università Studi di Sassari 1993 - Abilitazione all'esercizio della professione di Biologo 1992 - Laurea in Scienze Biologiche presso l'Università degli Studi di Cagliari Posizioni e responsabilità lavorative 2010-2014 – Responsabile Scientifico del Laboratorio di Genomica - SGP, CRS4, Pula, Cagliari 2006-2010 – Lab Manager del Laboratorio di Genotyping di Sardegna Ricerche, Pula, Cagliari. 2002-2006 - Responsabile del Laboratorio della Società SHARDNA Spa, Cagliari. 2011-oggi - Ricercatore a tempo indeterminato, Ist. Ricerca Genetica e Biomedica (IRGB) Monserrato, CA 2001-2011 - Ricercatore a tempo indeterminato, Istituto di Genetica delle Popolazioni CNR, Sassari 2000-2001 - Ricercatore a tempo determinato, Istituto di Genetica Molecolare CNR, Alghero 1996-1999 - Dottorando di Ricerca, IGM CNR, Alghero – Università di Sassari 1996 - Biologo Borsista, Lab. Patologia Molecolare – Ospedale Reg. per le Microcitemie Cagliari 1995-1996 - Borsista C.N.R., Istituto di Ricerca sulle Talassemie ed Anemie Mediterranee, IRTAM, Cagliari 1992-1995 - Biologo Borsista, Lab. Patologia Molecolare – Ospedale Reg. per le Microcitemie Cagliari Conoscenze linguistiche Inglese: livello C1 parlato, comprensione e scritto. Attività di ricerca Il Dott. Angius si occupa attualmente di progetti di ricerca focalizzati sullo studio delle patologie complesse, dei tumori, delle malattie mendeliane rare e su progetti internazionali di sequenziamento massivo (1000 Genomes Project Consortium). Inoltre collabora attivamente con vari gruppi di ricerca per studi di LOH, CNV ed Expression profliling su casistiche mirate di malattie autoimmuni e campioni tumorali. Questi progetti hanno permesso di: - creare la referenza completa di tutto il genoma sardo da impiegare in studi di associazione con le malattie complesse frequenti in Sardegna (es. diabete, sclerosi multipla, etc.). Studio in collaborazione con l’Università di Ann Harbor e The National Institute on Aging (NIA) a Baltimore (USA). - sequenziare l’intera porzione codificante (esoma) del genoma di circa 100 individui affetti da malattie complesse autoimmuni da Disabilità Intellettiva causata da forme sindromiche. Studio in collaborazione con l’Università di Bologna e di Sassari e l’Istituto Humanitas IRCCS. - sequenziare il trascrittoma di circa 40 pazienti affetti da sindrome di Crisponi e Cold-induced sweating syndrome type 1 (CISS1), negativi alla analisi mutazionale del gene CRLF1, alla ricerca di nuovi geni coinvolti in questa sindrome. - sequenziare il trascrittoma di circa 600 individui per esaminare da un punto di vista qualitativo e quantitativo (eQTL) i profili di espressione da associare a malattie. Studio in collaborazione con l’Università di Stanford (USA). - effettuare studi popolazionistici e filogenetici sulla struttura del DNA mitocondriale e del cromosoma Y finalizzati alla datazione ed evoluzione della popolazione sarda e alla storia dell'insediamento umano nell'isola mediterranea e nel continente europeo dell'Homo sapiens moderno. Studio in collaborazione con l’Università di Sassari e di Pavia. Nel periodo 2000-2010, il Dott. Angius ha coordinato alcune linee di un progetto di ricerca sulle malattie multifattoriali in popolazioni dell’isolato genetico della regione Ogliastra. Questo progetto multidisciplinare ha previsto l'utilizzo di dati demografici, genealogici, ambientali, sociali, clinici e genetici. Sono stati portati avanti studi popolazionistici e filogenetici e per la determinazione dei principali parametri genetici di queste popolazioni sia utilizzando i marcatori classici che mediante l’utilizzo di DNA-chip ad alta processività con marcatori biallelici distribuiti lungo tutto il genoma. Il Dott. Angius ha coordinato il gruppo di studio volto all’identificazione dei fattori di rischio genetici e non coinvolti nei disordini cardiovascolari ed in particolare nell'Ipertensione Essenziale per cui è stato possibile identificare vari loci in associazione con la malattia. Gli screening su larga scala in questi paesi hanno permesso la valutazione del rischio cardiovascolare globale e di attuare un programma di prevenzione per le malattie cardiovascolari in queste popolazioni. Nell’ambito del progetto di studio finalizzato all’identificazione dei tratti quantitativi coinvolti nell’eziologia delle malattie complesse, lo studio dei fattori coinvolti nella variazione dell’assetto lipidico ha portato all’identificazione di un locus in associazione alle variazioni dei livelli di colesterolo totale e colesterolo HDL. In collaborazione con il National Institute of Deafness and Other Communication Disorders, Rockville, USA, ha condotto uno studio sulla percezione del gusto nell’uomo che ha permesso di identificare una serie di marcatori molecolari responsabili della sensibilità alle sostanze amare sul gene TAS2R38 bitter receptor gene. Nel periodo 1996-1999, presso l’Università di Sassari durante il dottorato, il Dott. Angius ha collaborato e coordinato lo studio genetico di un gruppo multicentrico a livello italiano per lo studio delle basi molecolari delle malattie dell'occhio: ha identificato una mutazione con effetto fondatore in alcune famiglie con membri affetti da Glaucoma Primario Giovanile ad Angolo Aperto (POAG) ed ha identificato un fattore di rischio genetico per il POAG di tipo adulto. Ha identificato una nuova mutazione nel gene VMD2 che causa la 1 Congenital Stationary Night Blindness. Inoltre durante questo periodo ha collaborato con l’Istituto di Anatomia Patologica di Sassari, all’identificazione di una mutazione del gene BRCA2 con effetto fondatore in numerose famiglie del nord Sardegna con casi di tumore alla mammella. Nel periodo 1992-1996, presso l’Istituto di Ricerca sulle Talassemie ed Anemie Mediterranee, IRTAM, CNR, Cagliari, il Dott. Angius ha partecipato al mappaggio ed al clonaggio del gene ATP7B responsabile del morbo di Wilson e attraverso gli studi sulla popolazione Sarda ha identificato "l'effetto fondatore" della malattia nell’isola. Ha esteso e caratterizzato le basi molecolari della malattia di Wilson a tutta l'area mediterranea identificando numerose mutazioni e ponendo le basi per un programma di screening prenatale della malattia. Ha collaborato con varie Cliniche dell'Università di Cagliari per studi sull'ipertensione ed infarto del miocardio acuto nella popolazione sarda mediante studi di polimorfismi predisponenti in vari geni candidati. Partecipazione scientifica a progetti di ricerca internazionali e nazionali, ammessi al finanziamento sulla base di bandi competitivi Il dott. Angius ha partecipato alla stesura e alla gestione sia come responsabile che come collaboratore a vari progetti di ricerca a livello regionale e nazionale ammessi al finanziamento sulla base di bandi competitivi, come descritto in dettaglio nell’elenco sottostante. Progetto: Fondo Telethon Fondazione Onlus per il Progetto " Post GWAS functional characterization of BCL11A locus toward the development of a treatment for ß-thalassemia". Telethon Grant 2013 GGP13246 – Durata: 24 mesi - Ruolo Ricoperto: Responsabile Unità Progetto: Fondo Telethon Fondazione Onlus per il Progetto “Identification of novel gene(s) associated with Crisponi/Cold Induced Sweating syndrome-like phenotypes by exome sequencing”. Telethon Grant 2013 GEP13093 – Durata: 12 mesi - Ruolo Ricoperto: Coordinatore analisi genomiche tramite NGS Progetto: Regione Autonoma della Sardegna " Dissezione delle basi genetiche della Disabilità Intellettiva nell'era dell'exome sequencing".– Durata: 24 mesi. Ruolo Ricoperto: Coordinatore analisi genomiche tramite NGS Progetto: Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca. FIRB Laboratori 2003: Identificazione di geni-malattia mediante genotipizzazione ad alta densità di popolazioni. - Durata: 72 mesi- Ruolo Ricoperto: Responsabile Progetto Progetto: Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca. "Identificazione di fattori genetici associati a malattie multifattoriali comuni tramite un originale approccio allo studio di isolati genetici" (Art. 5 del D.M. 593 8 agosto 2000) - Durata: 60 mesi- Ruolo Ricoperto: coordinatore gruppo di ricerca Progetto: Fondo Telethon Fondazione Onlus per il Progetto "Sardinian Isolated Population For The Study of Complex Traits". Telethon Grant E 1185– Durata: 36 mesi - Ruolo Ricoperto: collaboratore Progetto: Regione Autonoma della Sardegna. "Studio della componente genetica e nutrizionale nell'insorgenza di malattie complesse" POR Sardegna 2000-2006, deliberazione Giunta Regionale della Sardegna n.27/30 del 7/08/2001. – Durata: 24 mesi. Ruolo Ricoperto: collaboratore Progetto: Regione Autonoma della Sardegna "Identificazione di geni associati a malattie multifattoriali con alto impatto socio-economico: Ipertensione arteriosa essenziale e Alopecia androgenetica". Determinazione n. 107 del 22/06/2005. – Durata: 24 mesi. Ruolo Ricoperto: coordinatore gruppo di ricerca Progetto: Regione Autonoma della Sardegna “Metodologie computazionali ibride per l’analisi statistica del flusso genico in grandi Dataset”.PON “Ricerca, Sviluppo Tecnologico ed Alta Formazione” 20002006 per le Regioni dell’ obiettivo 1 Decreto 192/Ric del 04/12/2007 – Durata: 18 mesi- Ruolo Ricoperto: collaboratore Progetto: Regione Autonoma della Sardegna “Infrastruttura bioinformatica per un approccio “system biology” alle malattie complesse”. Programma di R&S "Tecnologie bio-informatiche applicate alla medicina personalizzata" Bando di selezione N. 364.173 A – Durata: 20 mesi- Ruolo Ricoperto: collaboratore Attività didattica 2014-15; 2013-14; 2012-23; 2011-12; 2010-11 – Docente Corso di “Genetica Medica”, Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale e Applicata, Facoltà di Scienze MM. FF. NN., Università degli Studi di Sassari 2014-15; 2013-14 - Docente Corso Integrato di Diagnostica molecolare, Modulo di “Tecniche di Genotipizzazione ed Espressione Genica”, Laurea Magistrale in Biotecnologie Sanitarie Mediche e Veterinarie, Facoltà di Medicina Veterinaria in collaborazione con la Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università degli Studi di Sassari 2013-14; 2012-13 - Docente Modulo 07 “Genetics and Technics of Genetic Characterization”, Master Universitario internazionale di II livello denominato “International Master in Medical Biotechnology”, Hue University of Medicine and Pharmacy, Vietnam, e Dipartimento di Scienze Biomediche Università degli Studi di Sassari 2012-13; 2011-12; 2010-11 – Docente Corso Integrato di Diagnostica molecolare, Modulo di “Tecniche di Genotipizzazione”, Laurea Magistrale in Biotecnologie Sanitarie Mediche e Veterinarie, Facoltà di Medicina Veterinaria in collaborazione con la Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università degli Studi di Sassari 2010-11; 2009-10; 2008-09; 2007-08; 2006-07 - Docente Corso di “Genetica Umana”, Laurea Triennale Scienze Biologiche, Facoltà di Scienze MM. FF. NN., Università degli Studi di Sassari 2007- Docente Master in R&S in Biotecnologie Mediche, Parco Tecnologico Sardegna Ricerche Ed. 2007 2003-04 – Docente Corso di “Genetica Fondamenti e Laboratorio”, Laurea Triennale Scienze Biologiche, 2 Facoltà di Scienze MM. FF. NN., Università degli Studi di Sassari Ha svolto l’attività di tutore di 1 neolaureata in Scienze Biologiche presso l’Università di Cagliari per il Tirocinio post-lauream. Anni accademici 2005/2006. Ha svolto l’attività di tutore di 3 partecipanti al Master in Tecnologie bioinformatiche applicate alla medicina personalizzata ed. 2006 presso Polaris - Parco Scientifico e Tecnologico della Sardegna. 2014/2015; Tutore di 1 laureando in Scienze Biologiche presso l’Università di Sassari per il Tirocinio prelauream. 2005/2006; Tutore di 3 laureandi in Scienze Biologiche presso l’Università di Cagliari per il Tirocinio prelauream. 2004/2005, 2005/2006; Tutore di 1 dottorando del corso di Biochimica, Biologia e Biotecnologie Molecolari presso l’Università degli Studi di Sassari (20° ciclo) svolti presso l’Istituto di Genetica Molecolare del CNR e SHARDNA Spa, Cagliari. 2003/2004, 2004/2005; Tutore di 2 neolaureati in Scienze Biologiche presso l’Università di Cagliari per il Tirocinio post-lauream. 2002/2003; Tutore di 1 studente del Master di I° Livello in Bioinformatica presso la Facoltà di Scienze Matematiche, Fisiche e Naturali dell’Università degli Studi di Torino. 1999/2000, 2000/2001, 2001/2002; Docente esercitazioni pratiche di Biologia Molecolare II agli studenti del Corso di Laurea in Scienze Biologiche della Università di Sassari. Memberships e attività di reviewer E’ membro ordinario della Società Italiana dell’Ipertensione Arteriosa e dell’American Society of Human Genetics. Svolge/ha svolto attività di reviewer per Journal of Medical Genetics, Journal of Endocrinological Investigation, American Journal of Human Genetics, BMC Medical Genetics, PloS ONE Journal, Nutrition, Metabolism & Cardiovascular Diseases, Gene, Chemical Senses, Hypertension e Human Genetics. Pubblicazioni scientifiche e Comunicazioni e relazioni a congressi Durante gli anni dell’attività di ricerca il Dr. Angius ha pubblicato più di 70 articoli scientifici su varie riviste internazionali e nazionali, ha collaborato con alcuni capitoli alla stesura di libri ed ha partecipato con comunicazioni e relazioni a più di 100 congressi internazionali e nazionali. Indice citazioni e impact factor Media Impact Factor: 8,37 Impact Factor Totale: 593,21 Indice H: 28 Totale Citazioni: 4357 3 Elenco delle pubblicazioni scientifiche Dott. Andrea Angius 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. Erre G, Piga M, Carru C, Angius A, Carcangiu L, Piras M, Sotgia S, Zinellu A, Mathieu A, Passiu G, Pescatori M. Global microRNA profiling of peripheral blood mononuclear cells in patients with Behçet's disease. Clin Exp Rheumatol. 2015 Nov-Dec;33(6 Suppl 94):S72-9. Ding J, Sidore C, Butler TJ, Wing MK, Qian Y, Meirelles O, Busonero F, Tsoi LC, Maschio A, Angius A, Kang HM, Nagaraja R, Cucca F, Abecasis GR, Schlessinger D. Correction: Assessing Mitochondrial DNA Variation and Copy Number in Lymphocytes of ~2,000 Sardinians Using Tailored Sequencing Analysis Tools. PLoS Genet. 2015 Sep 29;11(9):e1005549. doi: 10.1371/journal.pgen.1005549. eCollection 2015 Sep. Sidore C, Busonero F, Maschio A, Porcu E, Naitza S, Zoledziewska M, Mulas A, Pistis G, Steri M, Danjou F, Kwong A, Ortega Del Vecchyo VD, Chiang CW, Bragg-Gresham J, Pitzalis M, Nagaraja R, Tarrier B, Brennan C, Uzzau S, Fuchsberger C, Atzeni R, Reinier F, Berutti R, Huang J, Timpson NJ, Toniolo D, Gasparini P, Malerba G, Dedoussis G, Zeggini E, Soranzo N, Jones C, Lyons R, Angius A, Kang HM, Novembre J, Sanna S, Schlessinger D, Cucca F, Abecasis GR. Genome sequencing elucidates Sardinian genetic architecture and augments GWAS findings: the examples of lipids and blood inflammatory markers. Nat Genet. 2015 Sep 14. doi: 10.1038/ng.3368. Danjou F, Zoledziewska M, Sidore C, Steri M, Busonero F, Maschio A, Mulas A, Perseu L, Barella S, Porcu E, Pistis G, Pitzalis M, Pala M, Menzel S, Metrustry S, Spector TD, Leoni L, Angius A, Uda M, Moi P, Thein SL, Galanello R, Abecasis GR, Schlessinger D, Sanna S, Cucca F. 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