Corso di laurea in Biotecnologie
Modulo di Biologia molecolare 2 (3 CFU, 30 ore)
A.A. 2006-07
Docente: prof. Franco Quadrifoglio
Obbiettivi formativi
Fare acquisire allo studente le competenze per la comprensione dei meccanismi con cui viene
regolata l’espressione dei geni negli eucarioti, anche nello sviluppo.
Programma
0.0 Ricapitolazione dell’interazione DNA-proteine e sulla formazione del complesso basale di
trascrizione negli eucarioti.
1. La struttura della cromatina e il controllo dell’espressione genica negli eucarioti
1.1 La struttura della cromatina
1.2 La struttura secondaria e terziaria degli istoni
1.3 La formazione dei nucleosomi e il loro possibile posizionamento
1.4 Le modificazioni chimiche degli istoni e il loro effetto sulla struttura della cromatina. Gli
agenti modificatori e il loro reclutamento nel complesso di trascrizione.
1.5 Eucromatina ed eterocromatina. Modificazioni epigenetiche. La mutilazione del DNA.
1.6 Il rimodellamento della cromatina: la funzione della superfamiglia SWI/SNF.
1.7 L’epigenetica nei mammiferi: l’imprinting genomico. L’inattivazione del cromosoma X.
1.8 Gli isolatori.
2. I meccanismi genetici dello sviluppo embrionale
2.1 Strategie di regolazione genica differenziale durante lo sviluppo: la localizzazione
dell’mRNA, il contatto cellula-cellula, il gradiente dei morfogeni.
2.2 Lo sviluppo di Drosophila: la formazione degli assi, i geni gap, pair-rule e omeotici. I geni
Hox nei mammiferi.
2.3 La determinazione del sesso negli insetti e nei vertebrati.
2.4 L’adesione cellulare nello sviluppo.
2.5 Le vie principali di segnalazione nello sviluppo.
3. Il ruolo dei piccoli RNA nell’espressione genica.
4. La ricombinazione sito-specifico: i geni delle immunoglobuline.
5. Analisi dell’espressione genica su larga scala: microarrays, tecniche di proteomica e SAGE.
6. Metodologie di base per lo studio dei network di interazione proteina-proteina: GST
pulldown, Farwestern, CoIP.
7. PCR quantitativa.
Testi consigliati
B. Alberts et al. “Biologia molecolare della cellula” Zanichelli
J. Watson et al. “Biologia molecolare del gene” Zanichelli
R.F. Weaver “Biologia molecolare” McGraw-Hill
Dispense ed articoli forniti dal docente a lezione.
Propedeuticità
Chimica generale. Chimica organica. Fisica. Biochimica. Biologia molecolare 1.
Modalità di esame
Prova scritta con domande aperte. Il voto dell’esame del Corso integrato di Biologia molecolare 2 è
calcolato facendo la media numerica tra il voto del modulo di BM2 e quello del modulo di
Laboratorio di BM2.