The PubChem Project

The PubChem Project
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PubChem è un componente
del National Institutes of
Health (NIH) Roadmap
Molecular Libraries Initiative.
PubChem contiene le nozioni
sulle sostanze, le strutture
dei composti ed i dati di
bioattività.
•3 database principali:
PubChem è integrato con
•PC Substance;
Entrez, il principale motore
•PC Compound;
di ricerca di NCBI.
•PC BioAssay.
PubChem Substance Database
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PubChem Substance
contiene le strutture
chimiche, i sinonimi, gli
ID di registrazione, la
descrizione, le strutture
proteiche in 3D, i risultati
di esami biologici, …
Pubchem Compound Database
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PubChem Compound
contiene le descrizioni
chimiche fornite per
descrivere le sostanze
contenute in PubChem
Substance.
PubChem Compound
consente anche la ricerca
per proprietà chimica
(es. peso molecolare).
PubChem BioAssay Database
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PubChem BioAssay
contiene gli esami di
bioattività delle sostanze
chimiche descritte in
PubChem Substance.
PubChem BioAssay
permette la ricerca delle
descrizioni di ogni
bioattività, incluse le
descrizioni delle
condizioni della
procedura d’esame.
PubChem Structure Search
PubChem Summary Display
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3 pagine di risultati:



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substance,
compound,
bioassay.
Forniscono link ad ogni
database di PubChem ed
agli altri database di NCBI.
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SID: Link a Entrez
PCSubstance.
CID: Link a Entrez
PCCompound.
Bioactivity: Link alla pagina
di bioassay data summary.
Related Substances: Link ai
record di Entrez PCSubstance
con quelli che contengono
questa sostanza.
Similar Substances: Link ai
record di Entrez PCSubstance.
Tutti i composti mostrati
hanno un punteggio di
somiglianza superiore al 90%.
PubChem Substance Results
PubChem Compound Results
Substance Summary
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La pagina mostra un
indice standard delle
informazioni riguardanti
la sostanza.
Ampia possibilità di
scelta per quanto
riguarda sinonimi,
descrittori, commenti,
cross link, etc.
Possibilità di salvare i
dati in vari formati
(ASN.1, XML, and SDF)
per un ulteriore uso.
ChemIDPlus
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Sistema di ricerca gratuito
che consente l’accesso agli
authority files di strutture e
nomenclatura usata per
l’identificazione di sostanze
chimiche citate nei database
della National Library of
Medicine (NLM).
ChemIDplus fornisce anche
link a molte risorse
biomediche della NLM per i
prodotti chimici di interesse.
Il database contiene più di
368.000 records ed è
ricercabile per





Nome,
Sinonimo,
CAS Registry Number,
Formula Molecolare,
Struttura.
ChemIDPlus Lite
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ChemIDplus Lite è
concepito per essere
più rapido e facile da
usare nella ricerca di
singoli prodotti
chimici.
Possibilità di ricerca:


Nome della sostanza;
CAS Registry Number.
Toxnet
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Toxnet racchiude un
insieme di databases di
tossicologia, prodotti
chimici pericolosi ed
argomenti correlati.
Sono disponibili varie
modalità di ricerca: è
possibile interrogare uno,
alcuni o tutti i database
simultaneamente.
In quest’ultimo caso il
Front Page Search Screen
mostra il numero di record
trovati per ogni database e
consente di vedere i
risultati individuali.
Toxline
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Toxline è un database
bibliografico riguardante gli
effetti biochimici,
farmacologici, fisiologici e
tossicologici di farmaci ed
altri prodotti chimici.
Contiene più di 3 milioni di
citazioni, quasi tutte con
abstracts e/o index terms
e CAS Registry Numbers.
I riferimenti provengono
da varie sorgenti riunite in
due gruppi principaliTOXLINE Core and
TOXLINE Special, che
operano all’interno di un
versatile motore di