MODULI BIOLOGIA E GENETICA (10 CFU) PARTE I - 5 CFU DOCENTE: DOTT.SSA LAURA MORELLI RISULTATI DELL'APPRENDIMENTO Inquadramento in senso evoluzionistico di meccanismi biologici. Comprensione dei modelli di eredità mendeliani e multifattoriali, genetici e epigenetici. Acquisizione di strumenti critici per l’autoformazione, e il reperimento di informazioni sui database elettronici. Prerequisiti: chimica generale e inorganica, chimica organica, biochimica. Co-requisiti: Biologia molecolare, citologia e istologia. ARGOMENTI STRUTTURA DEGLI ACIDI NUCLEICI, REPLICAZIONE DEL DNA E ESPRESSIONE GENICA. La proprietà semidiscontinua e semiconservativa della replicazione del DNA. Elementi coinvolti nella replicazione del DNA. Il modello del replisoma. le DNA polimerasi svolgono attività di sintesi, riparo e ricombinazione; il genoma a RNA di alcuni virus. Espressione genica. La trascrizione nei procarioti e negli eucarioti. I compiti delle tre diverse RNA polimerasi eucariotiche. Organizzazione del promotore. La maturazione del trascritto primario. Processamento dell'RNA messaggero e dell'RNA non codificante. RNA transfer e Ribosoma, snRNA. Aminoacidi e proteine. Il codice genetico, La traduzione. STRUTTURA E FUNZIONE DEL CROMOSOMA. Ploidia e ciclo cellulare. Mitosi e Meiosi. Assortimento indipendente e ricombinazione nella meiosi. Accoppiamento X-Y. Avvolgimento gerarchico del DNA. La cromatina interfasica e il grado di compattazione. Eucromatina e eterocromatina. Eterocromatina facoltativa e costitutiva. Corpo di Barr e corpo XY. Localizzazione specifica dei cromosomi nel nucleo. Il ruolo del centromero. Origine multipla della replicazione nei mammiferi. La struttura specializzata dei telomeri, loro funzione e evoluzione. La replicazione dei telomeri. ANOMALIE CROMOSOMICHE Anomalie di numero e loro cause. poliploidia, aneuploidia mixoploidia e conseguenze cliniche. anomalie di numero degli autosomi e dei cromosomi sessuali. Causa delle anomalie strutturali, tipi di anomalie strutturali e conseguenze cliniche. Disomia uniparentale. INPRINTING GENETICO diploidia e disomia uniparentale nell'uomo e nel topo. Funzione biologica dell'inprinting. Organizzazione dei geni soggetti a inprinting. Modalità di imposizione e evoluzione degli inprints. IL PIANO SPERIMENTALE DI MENDEL. Incrocio monoibrido e principio della segregazione. Cross test. Spiegazione cromosomica del primo principio. Definizioni di Genotipo e Fenotipo, Gene, Locus e Allele. Incrocio diibrido e principio della indipendenza. Spiegazione cromosomica del secondo principio. VARIAZIONI SUL MENDELISMO Dominanza incompleta, codominanza, allelia multipla, alleli letali, interazione genica, epistasi. Spiegazione in termini funzionali del contributo allelico e genico alla manifestazione fenotipica. Eredità X-linked. Deviazione dall'assortimento indipendente. Esperimenti diibridi di Sturtevart e Morgan sulla drosofila. il mappaggio genico dei cromosomi eucariotici mediante la frequenza di ricombinazione. Incrocio a tre punti. Relazione tra mappa fisica e mappa genetica. MODELLI DI PEDIGREE MENDELIANI: generalità delle trasmissioni autosomica dominante e recessiva, Xlinked dominante e recessiva. Inattivazione del cromosoma X e mosaicismo dovuto alla inattivazione del cromosoma X. Eredità dei geni Y-linked. Eredità dei genei nelle regioni pseudoautosomiche. Eredità mitocondriale. Ambiguità dell’analisi del singolo pedigree. Il bias da accertamento. Relazione tra caratteri mendeliani e sequenze geniche. Eterogeneità di locus e clinica. Complicazioni dei modelli mendeliani di base. Tratti recessivi possono sembrare dominanti. Difetto di penetranza nei tratti dominanti. Penetranza legata alla età e esordio tardivo. Espressione variabile, anticipazione, imprinting. Alleli letali. Inbreeding. Mutazione de novo, chimerismo e mosaicismo. GENETICA DEI TRATTI MULTIFATTORIALI: la diatriba negli anni ‘20 tra i biometristi e i mendelisti sul modello di trasmissione dei caratteri complessi. La sintesi Fisheriana: teoria poligenica della determinazione dei tratti continui. Regressione verso la media e effetti dell’incrocio non casuale. Varianza genetica e ambientale, ereditabilità. Teoria della soglia nella estensione della teoria poligenica ai caratteri dicotomici. Applicazione della Teoria della soglia per la definizione dei rischi di ricorrenza nei tratti multifattoriali e rischio empirico. LA GENETICA DELLE POPOLAZIONI. Scopi e definizione della genetica delle popolazioni, concetto di popolazione mendeliana e di pool genico. calcolo delle frequenze alleliche e delle frequenze genotipiche. La distribuzione di Hardy e Weinberg e gli assunti di validità. L'impiego della distribuzione di HW in consulenza genetica. Deviazioni dalla distribuzione di Hardy Weinberg nelle popolazioni per effetto deriva genetica, migrazione, mutazione, inincrocio, selezione. L'evoluzione per darwin e la sintesi evoluzionistica moderna. ARCHITETTURA DEL GENOMA UMANO confronto fra genoma umano e genoma mitocondriale (mtDNA). peculiarità del genoma mitocondriale e modello di eredità. omoplasmia e eteroplasmia. replicazione trascrizione e traduzione del mtDNA. perché il tasso di mutazione del mtDNA è maggiore di quello nucleare. fissazione delle mutazioni mitocondriali. caratteristiche delle mutazioni patogene e delle malattie mitocondriali. Variabilità mitocondriale e applicazione in evoluzione umana. Famiglie geniche. Organizzazione dei geni globinici. Meccanismi di origine e evoluzione delle famiglie geniche. I geni a RNA. Classificazione funzionale e organizzazione genica. Interferenza dell'RNA. Cenni sulla attività trasposonica. LA VARIABILITÀ GENETICA UMANA E LE SUE CONSEGUENZE Tipi di variazione: SNPs, ripetizioni in tandem e intersperse, STRs, grandi variazioni in numero di copie. Danneggiamento del DNA e meccanismi di riparo. Complessi multiproteici coinvolti nella replicazione, la trascrizione e la ricombinazione e il riparo del DNA. I meccanismi di riparazione. i difetti della riparazione sono causa di patologia. Varianti patogene del DNA: mutazioni puntiformi missenso, nonsenso, che colpiscono il processamento del trascritto primario, frameshift, che modificano il livello di espressione genica, mutazioni sinonime (patogeniche). Patogenicità delle corte sequenze ripetute in tandem, mutazioni dinamiche. Malattie causate da aggregazione anomala di proteine. mutazioni che causano alterazione del dosaggio genico PATOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE La classificazione funzionale delle mutazioni, acquisto e perdita di funzione e caratteristiche ad esse associate, spiegazione molecolare dei termini recessività e dominanza, e della eterogeneità allelica LE BASI GENETICHE DEI TUMORI selezione clonle nella evoluzione dei tumori, modello two hit e multihit, oncogeni e geni oncosopressori, mutazioni che causano attivazione dei protooncogeni, mutazioni che causano perdita di funzione degli oncosopressori. Principali classi di prodotti proteici coinvolti nella cancerogenesi. PARTE II - 5 CFU DOCENTE: DOTT.SSA FOGU GIUSEPPA ARGOMENTI Ereditarietà Mendeliana Gli esperimenti di Mendel Ereditarietà mendeliana classica Ereditarietà autosomica dominante Ereditarierà autosomica recessiva Ereditarietà X-linked Costruzione e Analisi di alberi genealogici Irregolarità di trasmissione di condizioni mendeliane Penetranza, Espressività, anticipazione L'ordine dei geni sui cromosomi Gameti parentali e ricombinanti Mappaggio genico Marcatori genetici Analisi di linkage Meiosi informative e non informative Mappaggio di geni malattia mediante analisi di linkage Struttura dei cromosomi umani Metodi di studio dei cromosomi Il cariotipo umano normale Mitosi e meiosi Gametogenesi maschile e femminile Citogenetica molecolare Patologia cromosomica Anomalie cromosomiche di numero Sindrome di Down, sindrome di Edwards, sindrome di Patau Anomalie dei cromosomi sessuali Sindrome di Klinefelter, sindrome di Turner, maschi XYY, femmine con tripla X, Anomalie cromosomiche di struttura Delezioni, duplicazioni, inversioni, cromosomi ad anello Traslocazioni reciproche Traslocazioni Robertsoniane Rischio riproduttivo nei portatori di traslocazione Sindromi da delezione: sindrome del Cri du Chat sindrome di Wolff-Hirschorn Cromosomi marcatori Sindrome da invdup(15) sindrome di Pallister-Killian Disordini genomici Sindromi da microdelezione sdr di Di George sdr di Miller-Dieker sdr. Di Smith - Magenis Il fenomeno dell'imprinting genomico Dimostrazione dell'esistenza dell'imprinting genomico Imprinting e disomia uniparentale Malattie da difetti dell'imprinting genomico : sindrome di Prader-Willi e sindrome di Angelman Ibridazione in situ Fluoresecente (FISH) e Comparative genomic Hybridization (CGH) nella diagnosi di microdelezioni e microduplicazioni Inversione del sesso Sindrome da insensibilità agli androgeni (sdr di Morris) Maschi XX e Femmine XY Mutazioni dinamiche Microsatelliti e meccanismi di espansione Classificazione delle patologie da mutazioni dinamiche : Sindrome dell'X-Fragile . Fenotipo clinico, gene e mutazioni , diagnosi molecolare Distrofia miotonica, fenotipo clinico, gene e mutazioni, diagnosi molecolare Malattia di Huntington, mappaggio del gene tramite linkage, fenotipo clinico, gene e mutazioni, diagnosi molecolare Distrofia muscolare di Duchenne Clonaggio del gene DMD Struttura e funzione del gene della distrofina Mutazioni del gene DMD Malattie da mutazioni nei geni per i recettori per i fattori di crescita fibroblastici Generalità Patologie da mutazioni del gene FGFR3 Patologia molecolare Patogenesi Malattie ereditarie del tessuto connettivo Il tessuto connettivo Geni e proteine della matrice extracellulare Osteogenesi imperfecta Sindrome di Marfan La Fibrosi cistica Aspetti clinici Patologia molecolare Ricerca di mutazioni del gene CFTR Distrofia muscolare di Duchenne e di Becker Aspetti clinici Gene della distrofina e sue mutazioni Complesso proteico associato alla distrofina Mutazioni somatiche Effetti di alterazioni genetiche nei tumori Anomalie cromosomiche nei tumori Effetti di traslocazioni bilanciate nei tumori La leucemia mieloide cronica e il cromosoma Philadelphia Leucemia Promielocitica e t(15;17) Linfoma di Burkitt e t(8;14) Riarrangiamenti IgH (14q32) Oncogeni e geni oncosoppressori TP53 Il modello del retinoblastoma Tumori eredo-familiari: carcinoma della mammela e ovarico La diagnosi prenatale di malattie genetiche Diagnosi ecografica e test predittivi Indicazioni alla diagnosi prenatale Tecniche di prelievo di materiale fetale Analisi citogenetiche Diagnosi genetica preimpianto La consulenza genetica