CLASSIFICAZIONE dei VIRUS

CLASSIFICAZIONE dei VIRUS
dal 1966 Comitato Internazionale per la Tassonomia dei Virus (ICTV)
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/Ictv/index.htm)
Criteri:
• acido nucleico (DNA o RNA)
• simmetria del capside (icosaedrica, elicoidale, complessa)
• envelope o no
• architettura del genoma (ds o ss, +/-)
• modalità replicative
• polimerasi associata al virione
• diametro virione (nm) e n. capsomeri
• dimensioni genoma (kb)
Raffaella Baldellli
DSPVPA
→ classe di Baltimore
Solido a 20 facce
A SIMMETRIA ELICOIDALE
I capsomeri sono disposti
come i gradini di una scala
a chiocciola
A SIMMETRIA ICOSAEDRICA
triangolari uguali
CLASSIFICAZIONE dei VIRUS
⇓
Famiglia
Sottofamiglia
Genere
Specie
•
•
•
comportamento in colture cellulari (tropismo, cpe, velocità repl.)
epidemiologia (recettività, modalità di trasmissione, patogenicità)
sensibilità agenti fisico-chimici : resistenza a pH 3 per 30’
stabilità a 50-56°C per 30’
•
•
caratteristiche antigeniche
caratteristiche genomiche
→ sierotipi
→ genotipi
Raffaella Baldellli
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Nomenclatura virale
•
•
•
•
Ordine
Famiglia
Sottofamiglia
Genere
suffisso -virales
suffisso –viridae
suffisso –virinae
suffisso –virus
• prefissi ad indicare caratteri morfologici, sigle o acronimi
• nome di specie indica malattia, anche con sigla
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Nomenclatura virale
• Es.:
• Es.:
Ordine
Famiglia
Genere
“specie”
Ordine
Famiglia
Sottofamiglia
Genere
“specie”
Mononegavirales
Rhabdoviridae
Lyssavirus
virus della rabbia
Mononegavirales
Paramyxoviridae
Paramyxovirinae
Morbillivirus
virus del cimurro del cane
• non tutte le famiglie sono comprese in un ordine
• non tutte le famiglie hanno una sottofamiglia
• alcune famiglie hanno 1 solo genere, altre numerosi generi
Raffaella Baldellli
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CLASSIFICAZIONE dei VIRUS
secondo Baltimore
• Classe I:
ds DNA (Adeno, Asfar, Herpes, Papilloma, Polio, Pox)
• Classe II: ss DNA (Circo, Parvo)
• Classe III: ds RNA (Birna, Reo)
• Classe IV: ss (+) RNA (Calici, Corona, Flavi, Pico, Toga)
• Classe V:
ss (–) RNA (Arena, Bunya, Filo, Ortho, Para, Rhabdo)
• Classe VI: ss (+) RNA con intermedio DNA (Retro)
• Classe VII: ds DNA con intermedio RNA (Hepadna)
Http://www.virology.net/Big_Virology/BVFamilyGroup.html
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CLASSIFICAZIONE dei VIRUS
• attualmente in uso un sistema di classificazione “misto” in
cui i caratteri primari (tipologia dell’acido nucleico; simmetria
del capside, presenza o meno dell’envelope) sono associati alle
caratteristiche architettoniche del genoma (che
definiscono la classe secondo Baltimore) e ad altre proprietà
(dimensioni del capside e del genoma) che contribuiscono alla
descrizione delle famiglie.
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