Anno Accademico 2010-2011 UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI SALERNO Facoltà di Medicina e Chirurgia Corso di Laurea Specialistica in Medicina e Chirurgia Biologia Molecolare e Cellulare Docenti del corso: Prof.ssa Rosanna Martinelli, Prof. Paolo REMONDELLI, Prof. Nicola Zambrano, Modulo di Biologia Molecolare: Prof.ssa Rosanna Martinelli [email protected] Prof. Nicola Zambrano [email protected] Settore Scientifico-Disciplinare: BIO/11 (Biologia molecolare) CFU tot.: 5 Pertinenza crediti per S.S.D.: BIO/11 ADF(attività didattica frontale): 30 ore ADI(attività didattica interattiva):10 ore Tipologia: base Modulo di Biologia cellulare Prof. Paolo Remondelli [email protected] Settore Scientifico-Disciplinare: BIO/13 (Biologia applicata) CFU tot.: 5 Pertinenza crediti per S.S.D.: BIO/13 ADF(attività didattica frontale): 30 ore ADI(attività didattica interattiva):10 ore Tipologia: base Codice identificativo di ateneo: Anno di corso: 1 Semestre: secondo Obiettivi formativi del corso Conoscere la struttura e le funzioni delle macromolecole biologiche e delle loro interazioni. Conoscere i meccanismi molecolari fondamentali legati alla propagazione ed al mantenimento dell’informazione genetica. Conoscere i meccanismi molecolari fondamentali dell’espressione genica e delle sue regolazioni. Saper descrivere e selezionare appropriate tecnologie per l’analisi di meccanismi biomolecolari. Conoscere la funzione dei compartimenti cellulari ed i processi che regolano la loro biogenesi e mantenimento. Individuare l’origine molecolare e cellulare delle patologie. Conoscere i processi della divisione cellulare e della riproduzione degli organismi Conoscere i processi generali attraverso i quali l'informazione genetica viene trasmessa ed espressa Contenuto del corso - Struttura di acidi nucleici e delle loro interazioni con proteine – Meccanismi della replicazione, del Anno Accademico 2010-2011 UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI SALERNO Facoltà di Medicina e Chirurgia Corso di Laurea Specialistica in Medicina e Chirurgia riparo di danni al DNA – Trascrizione e modifiche post-trascrizionali – Traduzione – Regolazione dell’espressione genica – Tecnologie del DNA ricombinante ed analisi dell’espressione genica -Biogenesi e mantenimento dei compartimenti cellulari - Organizzazione e funzioni dei compartimenti cellulari della via secretoria – Organizzazione e funzioni delle componenti cellulari della via endocitica – Organizzazione molecolare e funzioni delle componenti del citoscheletro –– Meccanismi di riproduzione degli organismi - Principi di genetica formale – Analisi degli alberi genealogici Organizzazione didattica Lezioni frontali, ed esercitazioni: utilizzo di banche dati e lettura critica e presentazione di lavori scientifici esemplari, laboratorio di colture cellulari e analisi microscopica delle cellule, laboratorio di Biologia Molecolare, amplificazione del DNA, separazione ed analisi di acidi nucleici Modalità di frequenza - Percentuale minima di ore di frequenza obbligatoria Frequenza obbligatoria – Percentuale minima di frequenza obbligatoria 75% Prerequisiti Conoscenze di base di Chimica Generale, Chimica Organica, Fisica secondo i programmi didattici degli Istituti di Istruzione Secondaria Superiore Propedeuticità Chimica e Propedeutica Biochimica Modalità di accertamento del profitto Prova finale scritta e colloquio orale Core curriculum - Programma di esame Struttura e topologia del DNA, organizzazione della cromatina Struttura degli acidi nucleici; superavvolgimenti e parametri topologici; ruolo funzionale dei superavvolgimenti; le topoisomerasi e loro meccanismo di azione; inibitori delle topoisomerasi; istoni e nucleosomi; livelli di organizzazione della cromatina. Replicazione del DNA L’inizio della replicazione; origini di replicazione (oriC, ARS); proteine del complesso di inizio; enzimi e proteine della replicazione; assemblaggio del replisoma; struttura e funzioni delle DNA polimerasi; attività enzimatiche delle polimerasi e loro significato; sintesi coordinata sui due stampi; la terminazione della replicazione. replicazione alle estremità dei cromosomi: telomeri e telomerasi. Riparo di danni al DNA e ricombinazione Sistema di riparo di appaiamenti errati; danni al DNA; riparo diretto dei danni; meccanismi di riparo per escissione della base ed escissione dei nucleotidi; lo Xeroderma pigmentosum; riparo di interruzioni a doppio filamento Trascrizione Struttura e funzioni delle RNA polimerasi procariotiche ed eucariotiche; promotori e formazione dei complessi di inizio; fattori basali della trascrizione dei geni di classe II; assemblaggio del complesso di inizio; elementi distali ed enhancers; organizzazione modulare dei fattori trascrizionali; esempi di domini di legame al DNA; regioni di dimerizzazione dei fattori trascrizionali; regioni di transattivazione; interazioni con l’apparato basale; il complesso del mediatore; modificazioni della cromatina e trascrizione; istone acetilasi e deacetilasi; complessi di rimodellamento della cromatina; il codice istonico; bromodomìni; fattori architetturali; enhanceosoma; schema di regolazione del promotore dell’interferone beta. Modificazioni e maturazione dei trascritti Processing dell’RNA messaggero: capping e poliadenilazione; lo splicing dei precursori nucleari dell’mRNA; splicing alternativo; controllo post trascrizionale dell’espressione genica: stabilità e degradazione dei trascritti, RNA interference, microRNA. La traduzione Anno Accademico 2010-2011 UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI SALERNO Facoltà di Medicina e Chirurgia Corso di Laurea Specialistica in Medicina e Chirurgia Struttura e funzione dei tRNA; le amminoacil-tRNA sintetasi; ribosomi ed RNA ribosomali; l’inizio della traduzione; cis-elements dell’inizio; fattori di inizio; controllo dell’inizio; il codice genetico; allungamento della catena polipeptidica e fattori di allungamento; terminazione della traduzione. Laboratorio di Biologia Molecolare Elettroforesi di acidi nucleici; endonucleasi di restrizione; vettori e strategie di clonaggio; denaturazione e rinaturazione del DNA; temperatura di fusione; ibridazione di acidi nucleici su membrana: Southern e Northern blot; sintesi di cDNA; amplificazione del DNA mediante PCR; RTPCR; PCR “Real-Time”; sequenziamento del DNA Metodi per l’analisi della trascrizione: primer extension, trascrizione in vitro, interazioni DNA-proteina (EMSA, footprinting), Sintesi di proteine in vitro Organizzazione generale delle cellule. Membrane biologiche. Composizione e proprietà chimico-fisiche delle membrane; proteine intrinseche ed estrinseche di membrana; fluidità di membrana; modalità di trasporto di membrana per diffusione semplice, diffusione facilitata, trasporto attivo.. I mitocondri - Organizzazione generale del metabolismo cellulare - I mitocondri e la evoluzione della cellula eucariotica – Organizzazione delle membrane mitocondriali Biogenesi e mantenimento dei compartimenti cellulari - Meccanismi generali di trasporto di proteine ai differenti compartimenti cellulari: ruolo dei segnali di smistamento - Trasporto di molecole tra nucleo e citoplasma - Traslocazione di proteine nei mitocondri e perossisomi- Traslocazione di proteine nel reticolo endoplasmatico. Organizzazione e funzioni della via secretoria – Organizzazione e funzioni del reticolo endoplasmatico - Modifiche post-traduzionali e controllo dell’omeostasi proteica - Modalità di trasporto vescicolare di proteine e lipidi tra i compartimenti della via secretoria- Struttura e funzioni dell’apparato di Golgi - Secrezione costitutiva e secrezione regolata - Esocitosi. Organizzazione e funzioni della via endocitica - Organizzazione e mantenimento del compartimento endosomiale - Meccanismi molecolari della fagocitosi ed endocitosi mediata da recettore - Transcitosi – Endosomi reciclanti. Il citoscheletro e le interazioni tra cellule – Organizzazione strutturale e ruolo funzionale delle diverse componenti del citoscheletro - Regolazione dell'assemblaggio e disassemblaggio delle diverse componenti del citoscheletro – Proteine motrici: caratteristiche molecolari e ruolo funzionale Le principali molecole coinvolte nell'interazione cellula-cellula e loro ruolo funzionale Divisione cellulare e riproduzione degli organismi Il ciclo cellulare e le sue fasi – Complessi cicline-CDK e loro regolazione – Punti di controllo del ciclo cellulare – Proliferazione, sopravvivenza e morte cellulare – Significato biologico e stadi della mitosi Modificazioni strutturali della cellula durante la mitosi - Stadi della meiosi e loro significato biologico Meccanismo e significato biologico della ricombinazione genetica – Ovogenesi e spermatogenesi – Fecondazione. Principi di genetica - Trasmissione mendeliana dei caratteri ereditari – Ereditarietà autosomica ed eterocromosomica - Ereditarietà mitocondriale - Alberi genealogici - Interazione fra geni e fra geni e ambiente: relazioni di dominanza, alleli multipli, epistasi, penetranza ed espressività, caratteri poligenici - Tipologia delle mutazioni: aberrazioni cromosomiche, aneuploidie autosomiche ed eterocromosomiche. Testi consigliati Weaver, Biologia Molecolare, Casa Ed. McGraw-Hill; Lewin et al., Cellule, Casa Ed. Zanichelli; Russel et Al., “Fondamenti di Genetica”, Casa Ed. Edises Materiale didattico fornito dai docenti Anno Accademico 2010-2011 UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI SALERNO Facoltà di Medicina e Chirurgia Corso di Laurea Specialistica in Medicina e Chirurgia Testi utili per la consultazione Alberts et Al., “Biologia Molecolare della Cellula”, V Edizione, Casa Ed. Zanichelli; Watson, Biologia Molecolare del Gene, Casa Ed. Zanichelli.