Indice generale 5 Le membrane 93 I Le basi molecolari della vita Parte 1 La scienza della biologia 1 1.1 1.2 1.3 1.4 La scienza della vita 1 La natura della scienza 4 Un esempio di indagine scientifica: Darwin e l’evoluzione 8 Temi unificanti della biologia 12 2 La natura delle molecole e le proprietà dell’acqua 19 2.1 2.2 2.3 2.4 2.5 2.6 La natura degli atomi 20 Gli elementi fondamentali per i sistemi viventi 24 La natura dei legami chimici 25 L’acqua: un composto essenziale 28 Le proprietà dell’acqua 30 Acidi e basi 32 3 La chimica della vita 36 3.1 3.2 3.3 3.4 3.5 Il carbonio: struttura delle molecole organiche 37 I carboidrati: riserve energetiche e molecole strutturali 41 Gli acidi nucleici: molecole dell’informazione 44 Le proteine: molecole dalle numerose strutture e funzioni 47 I lipidi: molecole idrofobiche 57 II Biologia cellulare Parte 4 La struttura della cellula 63 4.1 4.2 4.3 4.4 4.5 4.6 4.7 4.8 La teoria cellulare 63 Le cellule procariotiche 67 Le cellule eucariotiche 69 Il sistema endomembranoso 73 Mitocondri e cloroplasti: i generatori della cellula 78 Il citoscheletro 80 Strutture extracellulari e movimento cellulare 82 Interazioni cellula-cellula 86 5.1 5.2 5.3 5.4 5.5 5.6 La struttura delle membrane 93 I fosfolipidi: alla base delle membrane 97 Le proteine: componenti multifunzionali 98 Il trasporto passivo attraverso le membrane 101 Il trasporto attivo attraverso le membrane 105 Il trasporto per endocitosi ed esocitosi 107 6 Energia e metabolismo 113 6.1 6.2 6.3 6.4 6.5 Il flusso dell’energia nei sistemi viventi 113 Le leggi della termodinamica e l’energia libera 115 L’ATP: la valuta energetica delle cellule 118 Gli enzimi: catalizzatori biologici 119 Il metabolismo: la definizione chimica della funzionalità cellulare 123 7 La respirazione 128 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 Visione d’insieme della respirazione 129 Glicolisi: la scissione del glucosio 133 L’ossidazione del piruvato a produrre acetil-CoA 136 Il ciclo di Krebs 137 La catena di trasporto degli elettroni e la chemiosmosi 140 7.6 La resa energetica della respirazione aerobica 143 7.7 La regolazione della respirazione aerobica 145 7.8 L’ossidazione in assenza di O2 145 7.9 Il catabolismo delle proteine e dei grassi 147 7.10 L’evoluzione del metabolismo 150 8 La fotosintesi 154 8.1 8.2 8.3 8.4 8.5 8.6 8.7 Una panoramica sulla fotosintesi 154 La scoperta dei processi fotosintetici 156 I pigmenti 158 L’organizzazione del fotosistema 161 Le reazioni luce-dipendenti 163 La fissazione del carbonio: il ciclo di Calvin 168 La fotorespirazione 170 9 La comunicazione cellulare 176 9.1 9.2 9.3 9.4 9.5 Visione d’insieme della comunicazione cellulare 176 I tipi di recettori 179 I recettori intracellulari 181 La trasduzione del segnale attraverso i recettori chinasici 183 La trasduzione del segnale attraverso i recettori associati a proteine G 187 xix 15.6 15.7 15.8 15.9 10 La divisione cellulare 195 10.1 10.2 10.3 10.4 10.5 La divisione cellulare batterica 196 I cromosomi eucariotici 198 Visione d’insieme del ciclo cellulare degli eucarioti 201 L’interfase: preparazione alla mitosi 202 La fase M: segregazione cromosomica e divisione dei contenuti citoplasmatici 203 10.6 Il controllo del ciclo cellulare 207 16 Il controllo dell’espressione genica 323 16.1 16.2 16.3 16.4 16.5 16.6 16.7 III Genetica e Parte biologia molecolare 11 Riproduzione sessuata e meiosi 217 11.1 11.2 11.3 11.4 17.1 17.2 17.3 17.4 17.5 17.6 12 Modelli di ereditarietà 232 13 Cromosomi, mappatura dei geni e relazione tra meiosi ed ereditarietà 252 Il controllo dell’espressione genica 323 Le proteine regolatorie 324 La regolazione procariotica 327 La regolazione eucariotica 331 La struttura della cromatina eucariotica 335 La regolazione post-trascrizionale eucariotica 337 La degradazione delle proteine 342 17 Biotecnologie 347 La riproduzione sessuata ha bisogno della meiosi 217 Caratteristiche della meiosi 219 Il processo della meiosi 221 Riassumendo: meiosi e mitosi a confronto 226 12.1 Il mistero dell’ereditarietà 232 12.2 Incroci monoibrido: il principio della segregazione 235 12.3 Incroci diibrido: il principio di assortimento indipendente 240 12.4 Probabilità: predire i risultati degli incroci 241 12.5 Il reincrocio: rivelare genotipi sconosciuti 243 12.6 Estensioni alle leggi di Mendel 244 La struttura del tRNA e dei ribosomi 309 Il processo di traduzione 311 L’espressione genica in sintesi 315 La mutazione: i geni alterati 315 La manipolazione del DNA 347 Il clonaggio molecolare 350 L’analisi del DNA 355 L’ingegneria genetica 362 Le applicazioni mediche 364 Le applicazioni in agricoltura 366 18 Genomica 374 18.1 18.2 18.3 18.4 18.5 La mappatura dei genomi 374 Il sequenziamento dell’intero genoma 378 La caratterizzazione dei genomi 380 Genomica e proteomica 384 Applicazioni della genomica 390 19 Meccanismi cellulari dello sviluppo 395 19.1 19.2 19.3 19.4 19.5 19.6 13.1 Eredità legata al sesso e teoria cromosomica dell’ereditarietà 253 13.2 I cromosomi sessuali e la determinazione del sesso 254 13.3 Eccezioni alla teoria cromosomica dell’ereditarietà 257 13.4 Mappatura dei geni 258 13.5 Malattie genetiche umane 262 Il processo di sviluppo 395 La divisione cellulare 396 Il differenziamento cellulare 398 La riprogrammazione nucleare 403 La formazione dello schema corporeo 407 La morfogenesi 414 14 DNA: il materiale genetico 271 14.1 La natura del materiale genetico 271 14.2 La struttura del DNA 274 14.3 Le caratteristiche di base della replicazione del DNA 278 14.4 La replicazione nei procarioti 281 14.5 La replicazione negli eucarioti 287 14.6 La riparazione del DNA 289 Parte 20 I geni nelle popolazioni 421 20.1 20.2 20.3 20.4 20.5 20.6 20.7 15 I geni e l’espressione del materiale genetico 295 15.1 15.2 15.3 15.4 15.5 xx La natura dei geni 295 Il codice genetico 299 La trascrizione nei procarioti 302 La trascrizione negli eucarioti 304 Lo splicing del pre-mRNA negli eucarioti IV Evoluzione 306 Variazione genetica ed evoluzione 422 Cambiamenti nella frequenza allelica 424 Cinque agenti del cambiamento evolutivo 426 La fitness e la sua misura 431 Interazioni tra le forze evolutive 432 Mantenimento della variabilità 433 Selezione agente su tratti influenzati da molteplici geni 435 20.8 Studi sperimentali sulla selezione naturale 437 20.9 I limiti della selezione 440 indice generale ! " # # $ % & ' % ( ' $ % ) $ ) * + $ , + % % 21 Le evidenze dell’evoluzione 444 21.1 Il becco dei fringuelli di Darwin: evidenza della selezione naturale 445 21.2 Falene punteggiate e melanismo industriale: un’ulteriore evidenza della selezione 447 21.3 La selezione artificiale: un cambiamento iniziato dall’uomo 449 21.4 Le evidenze fossili dell’evoluzione 451 21.5 Evidenze anatomiche per l’evoluzione 455 21.6 L’evoluzione convergente e i reperti biogeografici 458 21.7 Le critiche alla teoria evolutiva di Darwin 460 Parte V Diversità della vita sulla Terra 26 L’albero della vita 541 26.1 26.2 26.3 26.4 26.5 26.6 Le origini della vita 542 La classificazione degli organismi viventi 546 Le caratteristiche degli organismi viventi 548 Diamo un senso ai protisti 554 L’origine delle piante 555 L’organizzazione del regno animale 557 22 L’origine delle specie 464 22.1 La natura delle specie e il concetto biologico di specie 465 22.2 La selezione naturale e l’isolamento riproduttivo 469 22.3 Il ruolo della deriva genetica e della selezione naturale nella speciazione 471 22.4 La geografia della speciazione 472 22.5 La radiazione adattativa e la diversità biologica 474 22.6 Il ritmo dell’evoluzione 479 22.7 La speciazione e l’estinzione attraverso il tempo 480 23 La sistematica e la rivoluzione filogenetica 485 23.1 23.2 23.3 23.4 23.5 La sistematica 485 La cladistica 487 La sistematica e la classificazione 490 La filogenesi e la biologia comparativa 493 La filogenesi e l’evoluzione delle malattie 499 24 Evoluzione del genoma 505 24.1 24.2 24.3 24.4 24.5 24.6 24.7 Genomica comparata 505 Duplicazione dell’intero genoma 508 Evoluzione all’interno dei genomi 512 Funzione genica e pattern di espressione 516 DNA non codificante e funzione regolatrice 517 Dimensione del genoma e numero di geni 518 Analisi del genoma, prevenzione delle malattie e trattamenti 518 24.8 Miglioramento delle colture attraverso l’analisi del genoma 520 25 Evoluzione dello sviluppo 525 25.1 Una panoramica dell’embriologia comparata 525 25.2 Una o due mutazioni geniche, nuove forme 528 25.3 Stessi geni, nuove funzioni 529 25.4 Geni diversi, funzioni convergenti 531 25.5 Duplicazione genica e divergenza 532 25.6 Analisi funzionale di geni tra le specie 534 25.7 Diversità degli occhi nel mondo naturale: un caso di studio 534 27 I virus 563 27.1 27.2 27.3 27.4 27.5 La natura dei virus 564 Batteriofagi: i virus batterici 568 Il virus dell’immunodeficienza umana (HIV) 570 Altre malattie virali 574 Prioni e viroidi: particelle subvirali 576 28 I procarioti 581 28.1 28.2 28.3 28.4 28.5 28.6 28.7 Le prime cellule 582 Diversità dei procarioti 583 Struttura delle cellule procariotiche 588 Genetica dei procarioti 591 Metabolismo dei procarioti 596 Malattie batteriche nell’uomo 597 Procarioti utili 600 29 I protisti 605 29.1 Le origini degli eucarioti e la teoria endosimbiontica 606 29.2 Definizione di protisti 609 29.3 Diplomonadini e parabasalia: protisti flagellati privi di mitocondri 610 29.4 Euglenozoi: un gruppo diverso di cui alcuni membri possiedono cloroplasti 611 29.5 Alveolati: protisti dotati di vescicole sottomembrana 614 29.6 Stramenopili: protisti dotati di peli sottili 618 29.7 Rodofite: le alghe rosse 620 29.8 Coanoflagellati: possibili antenati degli animali 621 29.9 Protisti senza clade 621 30 Le piante verdi 628 30.1 30.2 30.3 30.4 30.5 30.6 30.7 30.8 30.9 Definizione di piante 628 Clorofite e carofite: le alghe verdi 631 Briofite: la generazione dominata dal gametofito 633 Piante tracheofite: le radici, gli steli e le foglie 636 Licofite: la generazione dominata dallo sporofito e il tessuto vascolare 638 Pterofite: le felci e le piante affini 639 L’evoluzione delle piante da seme 642 Gimnosperme: piante con il “seme nudo” 644 Angiosperme: le piante da fiore 647 xxi indice generale - . / 0 1 2 . 3 4 1 0 4 1 4 5 4 . 6 4 7 8 9 4 1 : : ; < = > ? @ > ; ? < ; < A B ; C B ? ? 31 I funghi 657 31.1 Definire i funghi 657 31.2 Microsporidi: parassiti unicellulari 661 31.3 Chitridi e affini: funghi che producono zoospore flagellate 662 31.4 Zigomiceti: funghi che producono zigoti 664 31.5 Glomeromiceti: simbionti asessuati delle piante 665 31.6 Basidiomiceti: funghi che producono spore all’interno di cellule a clava (basidio) 665 31.7 Ascomiceti: funghi che producono spore all’interno di cellule a sacco (asco) 667 31.8 Ecologia dei funghi 669 31.9 Funghi parassiti e patogeni 673 32 Una panoramica sulla diversità animale 678 32.1 32.2 32.3 32.4 Alcune caratteristiche generali degli animali 679 Evoluzione del piano strutturale degli animali 681 La classificazione degli animali 685 Le radici dell’albero filogenetico animale 691 33 Gli invertebrati non celomati 695 33.1 33.2 33.3 33.4 I Parazoi: animali privi di tessuti specializzati 696 Gli Eumetazoi: animali provvisti di veri tessuti 698 I Bilateria acelomati 703 Gli Pseudocelomati 707 34 Gli invertebrati celomati 713 34.1 34.2 34.3 34.4 34.5 34.6 Phylum Mollusca: i molluschi 713 Phylum Nemertea: i vermi nastriformi 719 Phylum Annelida: gli anellidi 720 I Lofoforati: Bryozoa e Brachiopoda 724 Phylum Arthropoda: gli artropodi 726 Phylum Echinodermata: gli echinodermi 735 35 I vertebrati 741 35.1 35.2 35.3 35.4 35.5 35.6 35.7 35.8 35.9 I cordati 742 I cordati non vertebrati 743 I cordati vertebrati 744 I pesci 746 Gli anfibi 751 I rettili 755 Gli uccelli 760 I mammiferi 765 L’evoluzione dei primati 769 VI Struttura e funzione Parte nelle piante 36 Struttura delle piante 781 36.1 Organizzazione della struttura delle piante: una panoramica 782 xxii D E F G H I E J K H G K H 36.2 I tessuti delle piante 785 36.3 Le radici: strutture che permettono l’ancoraggio e l’assorbimento dei nutrienti 791 36.4 Gli steli: funzione di supporto per organi che emergono fuori dal terreno 796 36.5 Le foglie: gli organi fotosintetici 800 37 Sviluppo vegetativo della pianta 807 37.1 37.2 37.3 37.4 Lo sviluppo dell’embrione 808 I semi 814 I frutti 816 La germinazione 818 38 I meccanismi di trasporto nelle piante 823 38.1 38.2 38.3 38.4 38.5 38.6 I meccanismi di trasporto 824 L’assorbimento dell’acqua e dei minerali 829 Il trasporto dello xilema 830 Il tasso di traspirazione 832 Le risposte allo stress idrico 834 Il trasporto del floema 836 39 La nutrizione delle piante 841 39.1 39.2 39.3 39.4 Il terreno: il substrato da cui dipendono le piante 842 I nutrienti delle piante 845 Strategie nutritive speciali 847 Il bilanciamento carbonio-azoto e i cambiamenti globali 850 39.5 Il fitorisanamento 853 40 I meccanismi di difesa delle piante 859 40.1 40.2 40.3 40.4 Meccanismi fisici di difesa 859 Meccanismi chimici di difesa 862 Animali che proteggono le piante 866 Reazioni sistemiche contro agenti esterni 867 41 Sistemi sensoriali nelle piante 872 41.1 41.2 41.3 41.4 41.5 Risposte alla luce 873 Risposte alla gravità 877 Risposte agli stimoli meccanici 879 Risposte all’acqua e alla temperatura 881 Ormoni e sistemi sensoriali 884 42 La riproduzione delle piante 899 42.1 42.2 42.3 42.4 42.5 42.6 Lo sviluppo riproduttivo 900 La produzione del fiore 902 Struttura ed evoluzione dei fiori 908 Impollinazione e fecondazione 912 La riproduzione asessuata 918 Durata della vita della pianta 920 indice generale K L K E M K N O P K H Q Q R R S T U V T R U W R W X Y R Z Y U U 48 Il sistema digerente 1051 VII Struttura e funzione Parte negli animali 43 Il corpo animale e i principi di regolazione 925 43.1 43.2 43.3 43.4 43.5 43.6 43.7 43.8 Organizzazione del corpo dei vertebrati 926 Il tessuto epiteliale 927 Il tessuto connettivo 930 Il tessuto muscolare 932 Il tessuto nervoso 934 Panoramica dei sistemi d’organi dei vertebrati 935 Omeostasi 938 Regolazione della temperatura corporea 940 44 Il sistema nervoso 950 44.1 Organizzazione del sistema nervoso 951 44.2 Il meccanismo di trasmissione dell’impulso nervoso 953 44.3 Le sinapsi: dove i neuroni comunicano con le altre cellule 959 44.4 Il sistema nervoso centrale: il cervello e il midollo spinale 964 44.5 Il sistema nervoso periferico: neuroni sensoriali e neuroni motori 972 45 I sistemi sensoriali 980 45.1 I recettori sensoriali 981 45.2 I meccanorecettori: tatto e pressione 983 45.3 Udito, vibrazione e rilevazione della posizione corporea 985 45.4 I chemiorecettori: gusto, olfatto e pH 991 45.5 La vista 993 45.6 La varietà delle capacità sensoriali 1000 46 Il sistema endocrino 1005 46.1 Regolazione dei processi corporei mediante messaggeri chimici 1006 46.2 Azione di ormoni lipofilici e idrofilici 1011 46.3 L’ipofisi e l’ipotalamo: i centri di controllo dell’organismo 1014 46.4 Le principali ghiandole endocrine periferiche 1020 46.5 Altri ormoni e i loro effetti 1024 47 Il sistema muscolo-scheletrico 1030 47.1 47.2 47.3 47.4 47.5 Tipi di sistemi scheletrici 1031 Uno sguardo più approfondito all’osso 1032 Articolazioni e movimento dello scheletro 1036 La contrazione muscolare 1038 Modalità di locomozione animale 1044 48.1 Tipi di sistemi digerenti 1052 48.2 La bocca e i denti: la cattura del cibo e il processamento delle fibre 1054 48.3 L’esofago e lo stomaco: l’inizio della digestione 1055 48.4 L’intestino: scomposizione, assorbimento ed eliminazione 1057 48.5 Variazioni nei sistemi digerenti dei vertebrati 1061 48.6 Regolazione nervosa ed ormonale del tratto digerente 1063 48.7 Funzione di organi accessori 1064 48.8 Energia del cibo, dispendio energetico e nutrienti essenziali 1065 49 Il sistema respiratorio 1073 49.1 49.2 49.3 49.4 Scambio gassoso tra superfici respiratorie 1074 Branchie, respirazione cutanea e sistemi tracheali 1076 I polmoni 1078 Strutture e meccanismi della ventilazione nei mammiferi 1081 49.5 Trasporto dei gas nei fluidi corporei 1085 50 Il sistema circolatorio 1092 50.1 50.2 50.3 50.4 50.5 50.6 I componenti del sangue 1092 I sistemi circolatori degli invertebrati 1096 I sistemi circolatori dei vertebrati 1097 Il cuore a quattro camere e i vasi sanguigni 1100 Caratteristiche dei vasi sanguigni 1104 Regolazione del flusso e della pressione sanguigna 1108 51 La regolazione osmotica e il sistema urinario 1114 51.1 51.2 51.3 51.4 51.5 51.6 Osmolarità e bilanciamento osmotico 1114 Organi osmoregolatori 1116 Evoluzione del rene nei vertebrati 1118 Rifiuti azotati: ammoniaca, urea e acido urico 1120 Il rene dei mammiferi 1122 Controllo ormonale delle funzioni osmoregolatrici 1126 52 Il sistema immunitario 1133 52.1 52.2 52.3 52.4 52.5 52.6 Immunità innata 1133 Immunità adattativa 1139 Immunità cellulo-mediata 1144 Immunità umorale e produzione di anticorpi 1147 Autoimmunità e ipersensibilità 1153 Gli anticorpi nella terapia e nella diagnosi delle malattie 1155 52.7 I patogeni che ingannano il sistema immunitario 1157 53 La riproduzione 1163 53.1 Strategie riproduttive degli animali 1163 53.2 Fecondazione e sviluppo dei vertebrati 1166 xxiii indice generale [ \ ] ^ _ ` \ a b _ ^ b _ b c b \ d b e f g b _ h h i j k l m n l i m o i o p q i j q m m 53.3 Struttura e funzione dell’apparato riproduttore umano maschile 1170 53.4 Struttura e funzione dell’apparato riproduttore umano femminile 1173 53.5 Contraccezione e cure per l’infertilità 1177 54 Lo sviluppo negli animali 1185 54.1 54.2 54.3 54.4 54.5 54.6 La fecondazione 1186 La segmentazione e lo stadio di blastula 1190 La gastrulazione 1193 L’organogenesi 1196 La formazione dell’asse dei vertebrati 1203 Lo sviluppo umano 1206 VIII Ecologia e Parte comportamento 55 Biologia del comportamento 1213 55.1 Storia naturale del comportamento 1214 55.2 Cellule nervose, neurotrasmettitori, ormoni e comportamento 1215 55.3 Genetica del comportamento 1216 55.4 Apprendimento 1218 55.5 Sviluppo del comportamento 1220 55.6 Cognizione animale 1222 55.7 Orientamento e comportamento migratorio 1223 55.8 Comunicazione animale 1225 55.9 Ecologia del comportamento 1229 55.10 Strategie riproduttive e selezione sessuale 1232 55.11 Altruismo 1236 55.12 L’evoluzione di gruppi e società animali 1240 56 Ecologia degli individui e delle popolazioni 1245 56.1 Le sfide ambientali 1245 56.2 Popolazioni: gruppi di una singola specie in un luogo 1248 56.3 Demografia e dinamica di popolazione 1251 56.4 Ciclo biologico e costo della riproduzione 1254 xxiv r s t u v w s x y v u y v y 56.5 Limiti ambientali alla crescita di popolazione 1256 56.6 Fattori che regolano le popolazioni 1258 56.7 Crescita della popolazione umana 1262 57 Ecologia della comunità 1269 57.1 57.2 57.3 57.4 57.5 Comunità biologiche: specie che vivono insieme 1270 Concetto di nicchia ecologica 1272 Relazioni predatore-preda 1276 I molti tipi di interazioni tra specie 1280 Successioni ecologiche, perturbazioni e ricchezza specifica 1286 58 Dinamica degli ecosistemi 1292 58.1 58.2 58.3 58.4 58.5 Cicli biogeochimici 1293 Il flusso dell’energia negli ecosistemi 1299 Interazioni tra livelli trofici 1304 Biodiversità e stabilità dell’ecosistema 1308 Biogeografia delle isole 1311 59 La biosfera 1316 59.1 Effetti del Sole, del vento e dell’acqua sugli ecosistemi 1316 59.2 I biomi della Terra 1321 59.3 Habitat d’acqua dolce 1324 59.4 Habitat marini 1327 59.5 Impatto umano sulla biosfera: inquinamento e consumo delle risorse 1331 59.6 Impatto umano sulla biosfera: i cambiamenti climatici 1336 60 Biologia della conservazione 1344 60.1 60.2 60.3 60.4 Quadro generale della crisi della biodiversità 1345 Il valore della biodiversità 1349 Fattori responsabili dell’estinzione 1352 Approcci per la conservazione di specie ed ecosistemi a rischio 1363 Appendice A A-1 Glossario G-1 Crediti C-1 Indice analitico I-1 indice genarale z y s { y | } ~ y v