HIV – HCV - HBV EPIDEMIOLOGIA, PREVENZIONE E PROFILASSI Diagnostica di Laboratorio 6 GIUGNO 2012 M. BONGERA I° parte DNA Acido desossiribonucleico RNA Virus EPATITI Virus AIDS HBV HCV HIV 1 -2 epatotropi linfotropi Definizione di virus Luria e Darnell (1968) I virus sono entità, il cui genoma è un elemento di acido nucleico, DNA o RNA, il quale si riproduce all’interno di cellule viventi usandone i sistemi enzimatici per dirigere la sintesi di particelle specializzate, i virioni, che contengono il genoma virale e lo trasferiscono ad altre cellule. GENOMA HBV-DNA HCV-RNA HIV-RNA Reazione polimerasica a catena Ideata da Kary Mullis nel1983 1995 Premio Nobel per la Chimica. PCR : procedure generali campione Estrazione DNA/RNA Se RNA retrotrascrizione immunoenzimatica rivelazione Gel elettroforesi altro amplificazione Polymerase Chain Reaction : principio CICLI TERMICI 1) denaturazioone 94-95°C 2) annealing 50-65°C 3) extension 72°C Resa teorica di una reazione di PCR a partire da una singola copia di DNA Numero di cicli 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 Numero di molecole di amplificati 2 4 8 16 32 64 128 256 512 1.024 2.048 4.096 8.192 16.384 32.768 65.536 131.072 262.144 524.288 1.048.576 2.097.152 4.194.304 8.388.608 16.777.216 35.544.432 67.777.216 134.217.728 268.435.456 536.870.912 1.073.741.724 la PCR real time E’ un’amplificazione di acidi nucleici durante la quale i prodotti di PCR vengono rivelati e quantificati man mano che si formano, in tempo reale. Vengono quindi prodotti dati qualitativi e quantitativi in contemporanea, attraverso la lettura di un segnale fluorescente. La fluorescenza viene emessa dal DNA in via di formazione All’aumentare del DNA amplificato, aumenta proporzionalmente la fluorescenza DNA Fluorescenza Real time PCR DNA amplificato CARICA VIRALE quantità di virus presente nel sangue viremia ANALISI GENOTIPICHE CARICA VIRALE VIRAL LOAD. Direttamente proporzionale al grado di attività replicativa del virus . UNITA’ DI MISURA : UI/ml (S.I. WHO) copie/ml genomi eq/ml Es. 1.000 UI/ml = 1X10^3 = 3 log UI/ml 10 UI/ml = 1x10^1 = 1 log UI/ml CARICA VIRALE = riduzione PERIODO FINESTRA • PERIODO DI TEMPO CHE INTERCORRE TRA L’INFEZIONE E LA COMPARSA DEL PRIMO MARCATORE RILEVABILE CON I TEST DI LABORATORIO • Periodo finestra anticorpale • Periodo finestra antigenico Capobianchi, Ministero Salute 2012 TEST BIOMOLECOLARI HVB HCV HIV • Approccio terapeutico : carica virale, genotipi • Monitoraggio terapeutico: valutare la risposta alla terapia • Diagnosi : differenziare malattia/non malattia • Screening : identificare soggetti con malattia/evento in una popolazione di “ sani” - donatori da sangue terapia a base di interferone, nonché a un suo differente decorso e al gradseverità (anche se questo aspetto non è ancora del tutto chiarito): il 2 e il 3 sono i genotipi più facili da trattare, mentre l'1 e il 4 sono i più resistenti; il genotipo 1b, in particolare, è legato a una forma di infiammazione del fegato più acuta dal decorso particolarmente aggressivo.