La rete dei centri di
genetica e il futuro della
medicina
Rosario Casalone, MD, PhD
SSD Genetica
Dipartimento Materno Infantile
Azienda Ospedaliera-Polo Universitario
Ospedale di Circolo e Fondazione Macchi
Varese
TOMA, Busto Arsizio, 11 maggio 2012
Prof. Marco Fraccaro
Composizione, 1982
Malattie Rare, Eurordis
Variabilità clinica e molecolare della sindrome di Noonan
1953
La diagnosi delle Malattie
Rare genetiche è un processo
in continua evoluzione
2003
9. Il Laboratorio di Citogenetica
•
1970: Bandeggio standard
•
1980: Bandeggio ad alta risoluzione
(3-10 Mb)
10. Il Laboratorio di Genetica Molecolare
Dalla Genetica Molecolare…
•
1990: Citogenetica molecolare
Fluorescent In Situ Hybridization
(FISH, 40-100 kb)
alla Genetica Funzionale
•
>2000: CGH-array (1Mb-75kb)
“Genetic testing is the analysis of a specific gene, its product or function,
or other DNA and chromosome analysis, to detect or exclude an alteration
likely to be associated with a genetic disorder”
Peter Harper, J Med Genet 34: 749-752, 1997
Rilevanza clinica delle nuove tecnologie
Array-CGH
Tecnologia rivoluzionaria
permette lo screening in un unico esperimento
di tutto il genoma
per l’identificazione di anomalie cromosomiche
quantitative in forma di
microdelezioni o duplicazioni
di dimensioni inferiori alle 100-200kb
Comparative Genomic
Hybridization
Oligonucleotidi
Array: griglia di sonde
Approccio globale multidisciplinare al paziente con malattia genetica
U.O. Dipartimentale Genetica
Laboratorio + Genetica Clinica
SERVIZI DI GENETICA:
DISTRIBUZIONE SUL TERRITORIO REGIONALE
Lombardia
Monza
Monza
Densità (ab/km2)
: AO
: PRIV
: IRCCS PUB FOND
: IRCCS PRIV
: UNIV
: OSP CLASS
: CdC
Anno 2010
: 2088
: 1930
: 720
: 394.55 - 453
: 201 - 285.53
: 172.6 - 177.6
: 56.17
Distribuzione ambiti di attività di Genetica
Struttura clinica di Genetica Medica
4%
Ambulatorio di Genetica Clinica in
struttura non dedicata
17%
19%
58%
39%
19%
Laboratorio con Ambulatorio di
Genetica Clinica dedicato
Laboratorio in collegamento con
Medico Genetista
Laboratorio non collegato al
Medico Genetista con consulenza
legata al test
2%
Laboratorio non collegato al
Medico Genetista senza consulenza
legata al test
LA CONSULENZA GENETICA PRE E POST TEST
Linee guida europee
Accordo Stato – Regioni per la attività di genetica
U.O. Dipartimentale Genetica
-Visite dismorfologiche
-Consulenza genetica
-Follow up pazienti e familiari
Accident findings
CARIOTIPO Villo coriale
CARIOTIPO
padre
=
ESAC
ESAC
CGH normale!!!...ma…
ANALISI CGH-ARRAY
PADRE
Delezione 1,3 Mb
4q35.2
CONFERMA FISH
4q
4p
4p
Sonda Ctrl
Sordità sindromica
Geni responsabili di sordità nonsindromica per i quali è disponibile nel
nostro centro la ricerca di mutazioni
Gene
Locus/mutazione
Ereditarietà
Proteina
Cromosoma
GJB2+promotore DFNB1/A3
AR/AD
Connessina26 13q11-12
GJB6
DFNB1/A3
AR/AD
Connessina30 13q12
Delezione 1830 e delezione1854
MTRNR1
1555A>G
Mito
MTTS1
7445A>G
Mito
miR-96
GJB3
DFNA2B
AD/AR
Connessina 31 1p32-36
GJ A1
per ricerca
AR
Connessina 43
6q14-24
AR= autosomica recessiva AD=autosomica dominante
XL= legata alla X Mito=mitocondriale
PAZIENTI ANALIZZATI
Risultati di Varese (687 pazienti non sindromici)
59%
58.5 % pazienti
Nessuna mutazione
assenza mutazioni
mutazioni patogenetiche
34.3% pazienti
Mutazioni patogenetiche
7.1%
Mutazioni
7%
Eterozigoti
0%
GJB2
mutazioni eterozigoti
34%
Patogenetiche: omozigoti,eterozigoti composte, mutazioni
promotore , doppie eterozigosi,
mutazioni mitocondriali
Del(4)(q13.1-13.3)
Paziente con sordità bilaterale profonda
3 geni OMIM
Presente anche nel padre
Del(22)(q13.1)
Conclusioni
• L’array_CGH ad alta risoluzione (almeno 100kb200kb), è una indagine utile nei pazienti con
sordità sindromica
• Non inquadrabili in altro modo
• Senza mutazioni nei geni-sordità noti
• Con sordità di tipo centrale
UO Dipartimentale GENETICA
Geni indagati in Ematologia:
Abl/bcr
FLIT
NPMI
PML/RARA
Inv(16)
t(8;21)
JAK2
LA GENETICA AL LETTO DEL MALATO
AMBULATORI DI EMERGENZA
del paziente (o del feto) con malattia genetica
Evitare dispersioni di forze, doppioni e inutili spese
European _Union commettee of expert on Rare Diseases,2006
Centri di riferimento
Non ha piu senso che esistano centri di
primo e secondo livello, ma soltanto centri di eccellenza,
adeguatamente finanziati
Conosciuti dalla popolazione
rete verticale dal medico di base
In rete tra loro
Centri di genetica
I vantaggi della Genetica
solo per i paesi ricchi?
Obiettivo
Fornire ai cittadini dei paesi in via di sviluppo informazioni utili sulle malattie
genetiche più frequenti nei loro paesi e rendere possibile l’accesso tramite
internet a una consulenza genetica relativa alle stesse malattie e in futuro ad
analisi genetiche specialistiche non effettuabili in loco.
