Corso di Laurea/Laurea Magistrale: BIOLOGIA MOLECOLARE E CELLULARE
Nome del corso: BIOLOGIA MOLECOLARE POSTGENOMICA (318EE)
Responsabile del
Corso
Vittoria Raffa
Altri docenti
Numero CFU e
tipologia
3 CFU lezioni frontali
Obiettivo formativo
generale del corso
Apprendimento e approfondimento dei metodi di indagine piu’ aggiornati
per analizzare i profli di espressione di interi genomi e le interazioni dei
prodotti genici
Elenco degli
argomenti trattati
INTRODUZIONE ALLE SCIENZE OMICHE
Introduzione all'Era PostGenomica e alle scienze "Omiche".
POSTGENOMICA e TRASCRITTOMICA
Tecnologie di base di DNA ricombinante. Vettori specializzati per
contenere grandi frammenti di DNA. Studio dei genomi e strategie di
sequenziamento “Top down e shotgun”. Progetto ENCODE. Tecnologie
di analisi di profli di espressione: "Differential display". Banche di EST,
SAGE, microarray e chip. Metodi di sequenzamento di nuova
generazione (next generation sequencing) e sequenziamento a singola
molecola. Consultazione delle banche dati.
Introduzione all'epigenomica e studi su larga scala: ChIP-chip e ChIPSeq. Rivelazione delle citosine metilate mediante studi su larga scala
basati su differenti metodologie (digestione con endonucleasi sensibili a
metilazioni, arricchimento per affnità, trattamento con bisolfto)
PROTEOMICA e INTERATTOMICA
Introduzione alla proteomica. Metodi di purifcazione di proteine. SDSPAGE ed elettroforesi 2D e banche dati. DIGE. Spettrometria di massa
(ESI e Maldi). Problematiche della proteomica e nuovi approcci per
analisi di proteine e proteomi basati su nanotecologie. Interattomica:
analisi di reti di interazioni proteiche e studio dei domini di interazione.
Studi di interattomica: metodi analitici (pull-down, TAP) e metodi sintetici
(Phage Display, Doppio Ibrido).
Testi consigliati
Articoli e review relative ai vari argomenti
Melino G. - Argomenti di Biologia Molecolare - Edizioni SEU
Gibson G - A primer of Genome Science - II ed. SinauerAmaldi F. Biologia Molecolare – seconda edizione
Illustrazione di
eventuali attività di
Non previste.
laboratorio e/o
esercitazioni
Modalità di
svolgimento delle
prove d’esame
Esame orale
Propedeuticità
laurea triennale in Biologia
Conoscenze richieste
Basi di Biologia Molecolare-Genetica-Biochimica
