Progetto di ricerca: Individuazione dei geni rilevanti per

OSPEDALE MAGGIORE POLICLINICO MANGIAGALLI E REGINA ELENA
FONDAZIONE IRCCS DI NATURA PUBBLICA
UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI MILANO
UOC di Allergologia e Immunologia Clinica
&
Centro di Riferimento Regionale per le Malattie Autoimmuni Sistemiche
Direttore: Prof. Raffaella Scorza
Progetto di ricerca: Individuazione dei geni rilevanti per la patogenesi del LES mediante test
TDT (transmission disequilibrium test) nelle famiglie di pazienti affetti da LES
Premesse:
Il Lupus Eritematoso Sistemico (LES) è, tra le varie malattie autoimmuni, quella che ha una
maggiore componente genetica. Gli studi condotti nei ceppi di topo che sviluppano una malattia
molto simile a quella umana hanno dimostrato che i geni coinvolti nella suscettibilità al LES sono
molti e posti su cromosomi diversi. Un’altra informazione importante è che, perché si sviluppi la
malattia, non necessario che siano contemporaneamente presenti tutti i geni del LES: ceppi di topi
diversi possono avere geni di suscettibilità diversi, con manifestazioni differenti di malattia.
Nell’uomo gli studi effettuati per identificare i geni coinvolti nella suscettibilità/patogenesi del LES,
condotti su gruppi di pazienti non imparentati, non sono in grado di dare una risposta definitiva sul
ruolo dei diversi polimorfismi genici che di volta in volta sono stati associati alla malattia. Il limite
di tali ricerche dipende proprio dalla molteplicità dei geni coinvolti nel LES e dalla grande
variabilità clinica della malattia. E’ pertanto frequente che le associazioni dimostrate in un gruppo
di pazienti non siano poi confermate negli studi condotti su gruppi di pazienti diversi. La sola
soluzione possibile è quello di studiare, nelle famiglie dei pazienti con LES, la trasmissione dei geni
individuati negli studi di popolazione, anche se in questi ultimi i risultati sono stati discordanti.
Scopo del lavoro
Lo scopo di questo lavoro è quello di raccogliere il DNA dei membri di famiglie “nucleari” (cioè
genitori e figli) di pazienti affetti da LES; qualora dovessero esserci più membri affetti nella
famiglia allargata 8ad es. zia, cugino ecc) verrà raccolto il DNA anche degli altri soggetti. In queste
famiglie (non meno di 200) verrà studiata la trasmissione dei geni di interesse (cioè di quelli che si
suppone siano associati al LES) mediante il Test del TDT
Che cosa è il test del TDT?
Il test TDT (trasmission disequilibrium test) è un test statistico che viene eseguito su un campione
numeroso di famiglie con un singolo membro affetto dalla malattia (famiglie simplex) per le quali si
sia reso disponibile anche il DNA dei genitori. Permette di valutare l’eventuale associazione con la
malattia di un marcatore (un polimorfismo del DNA). Le famiglie informative ai fini del test sono
quelle in cui almeno uno dei due genitori del paziente è eterozigote per il marcatore che si vuole
analizzare. Per ogni genitore si registra quale dei due alleli è stato trasmesso al figlio malato e quale
non è stato trasmesso. Il test confronta tra loro le frequenze (calcolate sul campione totale di
famiglie) degli alleli del locus marcatore trasmessi e non trasmessi ai pazienti. Ogni allele ha, in
base al caso, il 50% di probabilità di essere trasmesso, ed il 50% di non essere trasmesso, per cui,
per marcatori NON associati con la malattia ci si attende un rapporto trasmesso/non trasmesso di
50/50. Ogni deviazione significativa da questo rapporto indica associazione sicura tra il marcatore
UOC di Alleregologia e Immunologia Clinica & Centro di Riferimento per le Malattie Autoimmuni
Sistemiche
Via Pace, 9 – 20122 Milano, Italy - Tel/Fax: +39-02 5503 5289; e-mail : [email protected]
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&
Centro di Riferimento Regionale per le Malattie Autoimmuni Sistemiche
Direttore: Prof. Raffaella Scorza
analizzato e la malattia. La significatività del confronto viene valutata con un test statistico (test del
chi-quadro).
Dove viene svolto il lavoro?
La raccolta dei dati clinici (v. scheda) e i prelievi verranno coordinati dalla dott. Maria Francesca
Spina, specialista in Allergologia e Immunologia Clinica del gruppo della prof.ssa Scorza. La
separazione e lo stoccaggio del DNA verranno effettuati dal dott. Maurizio Marchini, dalla dott.
Stefania Lenna, biologi dello stesso gruppo.
La tipizzazione dei geni di interesse verrà effettuata in parte presso l’Immunologia Clinica diretta
dalla Prof. Raffaella Scorza, in parte presso la Genetica medica dell’Università di Novara dal
gruppo della Prof. Sandra D’Alfonso, che ha già collaborato e ha coordinato studi multicentrici sui
fattori genetici del LES, in pazienti non imparentati.
Per la raccolta di un numero così rilevante di famiglie (circa 200) verranno contattati altri gruppi
che in Italia si occupano di LES
Come viene finanziato il lavoro?
Il progetto avrà un costo di spese di materiale e di elaborazione che supera i 300.000,00 euro.
Condizione indispensabile per far partire il progetto è la raccolta dei dati e del materiale delle
famiglie dei pazienti con LES:
La raccolta dei dati clinici e la separazione e lo stoccaggio del DNA verrà effettuato tutto a carico
del gruppo della Prof.ssa Scorza. Verranno poi presentati dei progetti in sede Nazionale, Regionale
e Europea per lo studio dei singoli geni.
L’analisi del TDT verrà effettuata a carico del gruppo della Prof.ssa D’Alfonso
Il Gruppo Italiano LES ha deciso di partecipare ad un progetto offrendo due premi di studio
dell’importo di 4000 euro l’uno - già erogati alla Dott. Maria Francesca Spina e alla Dott. Stefania
Lenna - e di offrire un contributo per le spese di spostamento (a fronte dei documenti giustificativi)
che si rendessero necessarie per prelevare famiglie molto grosse per un importo totale non superiore
ai 2000 euro per il 2007.
Come partecipare al progetto?
I pazienti interessati, che abbiano almeno 1 genitore disponibile, sono invitati a compilare la scheda
allegata e inviarla per posta o per FAX a:
Dott. Maria Francesca Spina
UO di Immunologia Clinica e Allergologia
Via Pace 9 – 20122 Milano
Tel: 02 5503 5282
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Sistemiche
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