ORGANIZZAZIONE DIDATTICA MICROBIOLOGIA _2010

Corso di Microbiologia (A.A. 2010-2011) Antonella Caputo
UNIVERSITA’ DEGLI STUDI DI PADOVA
Facoltà di Medicina e Chirurgia
Corso di Microbiologia (A.A. 2010-2011)
La Microbiologia è la scienza che si occupa dello studio dei microrganismi e di altre forme di vita
microscopiche e si divide in diversi settori quali: la batteriologia, che si occupa dei microrganismi
procarioti (batteri); la virologia, che si occupa dei virus in grado di parassitare sia organismi
procarioti che eucarioti, i quali, oltre ad essere agenti etiologici di varie malattie rappresentano un
importante modello per lo sviluppo di approcci sperimentali a problemi biologici di diversa natura;
la micologia, che si occupa dello studio dei miceti e la protozoologia che si occupa dello studio dei
protozoi. Altro aspetto importante della Microbiologia è lo studio e l’applicazione dei metodi
diagnostici delle malattie infettive.
Obiettivi formativi
L’obiettivo del corso è fornire allo studente informazioni teoriche e pratiche su i) i principali
microrganismi di interesse medico, inclusi i meccanismi di azione patogena e i complessi rapporti
microrganismo-ospite, ii) l’iter diagnostico e le tecniche utilizzate per la diagnosi di laboratorio delle
infezioni microbiche
Prerequisiti
Conoscenze propedeutiche: fisica e biofisica, chimica medica, biologia, chimica biologica e
istologia.
1. Frequenza
In base al Regolamento Didattico di Ateneo, la frequenza è obbligatoria per il 70% delle
ore di lezioni in aula, e per tutte le ore di attività di laboratorio, pena la non ammissione a
sostenere l’esame. Durante alcune lezioni del Corso si raccoglieranno le firme.
2. Articolazione del Corso Integrato
Il Corso comprende l’insegnamento delle seguenti discipline: Microbiologia, Virologia, Micologia e
Parassitologia.
Ore previste di lezioni frontali + esercitazioni pratiche: 76+9  85 circa previste dai crediti
Ore previste di esercitazioni pratiche: 9
Crediti Microbiologia (7); ore/CFU: 12,5
Lezioni:
inizio
fine prevista
7 Marzo
18 Giugno
2011
2011
Le lezioni avranno luogo presso:
 Aula Falloppio di Anatomia
 Aula Magna dell’ Istituto di Fisiologia di Via Marzolo
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Corso di Microbiologia (A.A. 2010-2011) Antonella Caputo
CANALE MED1/MED2
lunedì
martedì
mercoledì
giovedì
venerdì
--------8.30 – 10.00
8.30 – 9.15
8.30 – 10.00
8.30 – 9.15
7/03
Aula
------Falloppio
Fisiologia
Falloppio
Fisiologia
18/04
Batteriologia generale
Antimicrobici
Batteriologia speciale
Sierologia
36 ore circa
CANALE MED3/MED4
lunedì
martedì
mercoledì
giovedì
venerdì
Aula
8.30 – 9.15
8.30 – 10.00
--------8.30 – 10.00
8.30 – 9.15
20/04
Falloppio
Fisiologia
--------Fisiologia
Falloppio
31/05
Virologia generale
Virologia speciale
18/06
Micologia
Parassitologia
40 ore circa
Accertamento in itinere: giovedì 19/04
3. Didattica opzionale:

Corso di "Terapia genica" (G. Palù - G. Bressan)
Coordinatore: G. Palù

Corso di " Biotecnologie microbiche " (A. Loregian – G. Palù)
Coordinatore: A. Loregian

Corso su “ Chemioterapia antibatterica ed antifungina” (C. Mengoli)
Coordinatore: C. Mengoli
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4. Modalità d’esame e appelli:
Sono previsti 2 appelli d’esame per sessione, per complessive 6 appelli l’anno. Gli appelli della
medesima Sessione saranno distanziati di almeno 20 giorni e lo studente ha facoltà di iscriversi a
ciascuno degli appelli. Non sono previsti appelli straordinari di esame.
Iscrizione alle liste di esame: nel Sito UNIWEB sono aperte liste separate per Batteriologia e per
Virologia-Micologia e Parassitologia.
Accertamento in itinere: si terrà martedì 19 Aprile 2011, canale MED1/MED2 e MED3/MED4 presso
le rispettive aule, nell’orario canonico di lezione. Esso consiste in 3 domande aperte, a risposta
breve, su argomenti di batteriologia generale, batteriologia speciale, farmaci antibatterici e
sierologia e 30 quiz (15 a risposta singola e 15 a risposta combinata) prevalentemente su temi
trattati durante il Corso. Il voto in 30imi dura 1 anno solare.
Esame scritto nelle sessioni ufficiali: si compone di due parti, una relativa alla batteriologia e una
relativa alla virologia, micologia e parassitologia, entrambe di (60 minuti), che possono essere
sostenute nella stessa sessione o in sessioni ufficiali diverse. Il voto in 30mi nelle singole parti
rimarrà valido per un anno solare. Il voto finale sarà il risultato della media dei voti riportati nei
due compiti, tenendo in considerazione che l’insufficienza in una delle due parti determina il NON
superamento dell’esame. L’esame è così articolato: 20 quiz+20 quiz e due temi a risposta breve
(6-8 righe) su tutto il programma di batteriologia e 20 quiz+20 quiz e due temi a risposta breve
(6-8 righe) su tutto il programma di virologia, micologia e parassitologia.
Sono ammessi a sostenere l’esame solo gli studenti che si iscrivono mediante UNIWEB (nei casi in
cui ciò risulti impossibile gli studenti sono pregati di interpellare l’ufficio di Presidenza). La
registrazione dell’esame avrà luogo solo nelle date comunicate di volta in volta dai docenti; lo
studente impossibilitato può darne incarico ad un collega.
Esame orale facoltativo: per migliorare il voto definitivo (mediato) è possibile sostenere un esame
facoltativo orale. Esso avrà luogo una settimana circa dopo quello scritto completo o di quello
parziale integrante; è sull’intero programma.
Calendario esami A.A. 2010-2011
Accertamento in itinere: 19 Aprile 2011 (orario di lezione, solita aula)
Sessione estiva
Mart. 28
Giugno 2011
Merc. 20
Luglio 2011
ore 10.30
ore 10.30
aula B e C
aula B e C
Sessione autunnale
Giov 01
Settembre 2011
Ven
23
Settembre 2011
ore 14.30
ore 10.30
aula B e C
aula B e C
“
“
“
“
Sessione invernale
Gennaio 2012
Febbraio 2012
ore 10.30
ore 10.30
aula B e C
aula B e C
“
“
“
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Complesso Vallisneri, piano terra
“
“
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5. Esercitazioni pratiche: si terranno presso il Dipartimento di Anatomia Umana (Aula
esercitazioni) in Via Gabelli, 61
Contenuto:
Batteriologia: allestimento di preparati per colorazioni batteriologiche. Osservazioni microscopiche
dopo colorazione di Gram e Ziehl-Neelsen, semine di campioni in terreni selettivi, ed esempi di
identificazione biochimica mediante sistemi API, test di sensibilità agli antibiotici e test sierologici
rapidi.
Virologia: metodi di prelievo dei campioni ed isolamento virale, effetti citopatici e test sierologici,
nuove tecniche di diagnosi virologica e genotipizzazione (Inno-Lipa, RFLP, Real-time PCR,
sequenziamento nucleotidico) test di resistenza.
Batteriologia: 18 turni previsti da 40 studenti ciascuno: 2 giorni consecutivi per 2 ore ¼
ciascuno. Le esercitazioni di laboratorio di Batteriologia (6 ore/studente) avranno luogo dal 28
Marzo al 15 Aprile 2011 come sotto indicato.
Virologia: 9 turni previsti da massimo 45 studenti ciascuno: 2 ore ¼ (3 ore/studente). Le
esercitazioni di Virologia) avranno indicativamente luogo a partire dal 25 Maggio 2011.
ESERCITAZIONI DI BATTERIOLOGIA
DATA
ORARIO
14,00-16,15
Lunedi 28 Marzo 2011
16,15-18,30
Corso 1-2 turno 1A
Martedi 29 Marzo 2011
Corso 1-2 turno 1B
Corso 3-4 turno 1A
Venerdi 1 Aprile 2011
Corso 1-2 turno 2A
Corso 3-4 turno 1B
Lunedi 4 Aprile 2011
Corso 1-2 turno 2B
Martedi 5 aprile 2011
Corso 3-4 turno 2A
Corso 1-2 turno 3A
Venerdi 8 Aprile 2011
Corso 3-4 turno 2B
Corso 1-2 turno 3B
Lunedi 11 Aprile 2011
Corso 1-2 turno 4A
Martedi 12 Aprile 2011
Corso 1-2 turno 4B
Corso 3-4 turno 3A
Venerdi 15 Aprile 2011
Corso 3-4 turno 3B
Corso 3-4 turno 4A
Lunedi 18 Aprile 2011
Corso 3-4 turno 4B
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ESERCITAZIONI DI VIROLOGIA
DATA
ORARIO
14,00-16,15
MERCOLEDI’ 25 MAGGIO
16,15-18,30
Corso 1-2 turno 1
MERCOLEDI’ 25 MAGGIO
Corso 1-2 turno 2
GIOVEDI’ 26 MAGGIO
Corso 1-2 turno 3
GIOVEDI’ 26 MAGGIO
Corso 1-2 turno 4
VENERDI’ 27 MAGGIO
Corso 3-4 turno 5
VENERDI’ 27 MAGGIO
Corso 3-4 turno 6
MARTEDI’ 31 MAGGIO
Corso 3-4 turno 7
MARTEDI’ 31 MAGGIO
Corso 3-4 turno8
6. Assetto didattico e modalità di erogazione
MICROBIOLOGIA
Batteriologia
Virologia, Micologia e Parassitologia
Canale MED1/MED2
Busolo Franco
Calistri Arianna
Canale MED3/MED4
Manganelli Riccardo
Caputo Antonella
Esercitazioni
Marcon Luisa, Salata Cristiano e Richter Sara
Il prof. Palù, microbiologo e attuale Preside di Facoltà, terrà qualche lezione di virologia e di
parassitologia in date che saranno comunicate dai docenti.
7. Programma
Core Curriculum di Microbiologia
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MICROBIOLOGIA
Procarioti
 I caratteri distintivi dei microrganismi procarioti ed eucarioti
 Struttura e funzione dei componenti della cellula batterica: parete cellulare, membrana
citoplasmatica, ribosomi, nucleoide, ciglia, fimbrie, capsula.
 I terreni di coltura batteriologici ed il loro impiego
 La riproduzione batterica a livello cellulare e di popolazione
 Spore batteriche: sporogenesi e germinazione
 Le basi genetiche dell'adattamento dei batteri alle modificazioni dell'ambiente.
 Genetica batterica. Lisogenia e trasduzione. Trasferimento genico. Transposoni e plasmidi.
 Caratteristiche e meccanismo d’azione delle tossine
 I principi della tassonomia microbica
 Generalità sui rapporti microbo-ospite e patogenesi microbica
 Flora microbica normale
 Principi generali della diagnostica di laboratorio delle malattie ad eziologia batterica.
Sistematica: Staphylococcus, Streptococcus, Corynebacterium, Listeria, Mycobacterium,
Neisseria, Enterobacteriaceae, Pseudomonas, Vibrio, Campylobacter, Helicobacter, Brucella,
Haemophilus, Bordetella, Clostridium. Treponema, Borrelia e Leptospira. Legionella.
Mycoplasma e ureaplasma. Chlamydia.
Eucarioti
Miceti. Tassonomia, struttura e replicazione dei miceti. Meccanismi dell'azione patogena dei
miceti. Classificazione delle micosi umane. Diagnosi di laboratorio delle micosi.
Protozoi. Classificazione, struttura e replicazione dei protozoi di interesse medico. Meccanismi
dell'azione patogena dei protozoi. Diagnosi di laboratorio delle infezioni protozoarie.
Metazoi. Classificazione, struttura e replicazione dei metazoi. Meccanismi dell'azione patogena dei
metazoi. Diagnosi di laboratorio delle infezioni causate da metazoi.
Sistematica: Miceti. Micosi superficiali e cutanee: Tinea, Pietra, Dermatofitosi. Micosi
sottocutanee: Sporotricosi, Cromoblastomicosi, Feoifomicosi. Micosi sistemiche da miceti dimorfici:
Blastomyces, Paracoccidioides, Histoplasma, Coccidioides). Micosi opportunistiche: Candida
albicans e Candida Spp, Trichosporon, Malassezia, Criptococcus neoformans, Aspergillus spp,
Zygomyces, Pneumocystis carinii.
Protozoi. Protozoi intestinali e urogenitali: Amebe, Flagellati (Trichomonas, Giardia), Ciliati
(Balantidium coli), Coccidi (Cryptosporidium, Isospora belli), Microsporidi.
Protozoi del sangue e dei tessuti: Plasmodium spp, Emoflagellati (Tripanosomi, Leishmaie),
Babesia, Toxoplasma gondii.
Metazoi. Nematodi, Cestodi, Trematodi.
Aspetti pratici di immunologia applicata alla microbiologia.
Difese costitutive dell’ospite. Reazioni sierologiche applicate alla diagnosi microbiologica. Sieri e
vaccini.
Agenti antimicrobici: loro meccanismo d'azione.
Struttura, meccanismo d’azione e attività dei farmaci antimicrobici e loro impiego nei confronti di
infezioni causate da batteri, miceti, protozoi e metazoi. Farmaco-resistenza e suoi meccanismi.
Metodi per la determinazione della sensibilità agli antimicrobici: antibiogramma. Dosaggio dei
farmaci.
Sterilizzazione e disinfezione.
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Corso di Microbiologia (A.A. 2010-2011) Antonella Caputo
VIROLOGIA

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
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
I virus: morfologia, struttura, composizione chimica e metodi di studio.
Rapporti virus-cellula e fasi della riproduzione virale; aspetti molecolari della replicazione
Genetica dei virus.
Coltura dei virus e loro titolazione
Il meccanismo d’ azione e il ruolo protettivo dell’interferone e di altre citochine nelle
infezioni virali
Rapporti virus-ospite; infezioni litiche e non litiche
Trasformazione cellulare ed oncogenesi
Proprietà antigeni dei virioni: la risposta umorale e la risposta cellulo-mediata
Patogenesi delle infezioni virali:
Diagnostica virologica in medicina umana
La classificazione ed il meccanismo di azione dei farmaci antivirali.
Cenni sui vettori virali e principi di terapia cellulare e genica.
Sistematica: Virus a DNA: Papovavirus, Herpesvirus, Adenovirus, Parvovirus, Poxvirus,
Hepadnavirus. Virus a RNA: Picornavirus, Coronavirus, Orthomyxovirus, Paramyxovirus,
Rabdovirus, Filovirus, Virus delle epatiti (A, C, D, G, E), Reovirus e virus gastroenterici, Togavirus,
Flavivirus, Retrovirus (HTLV, HIV). Prioni.
8. Libri di testo consigliati
Testi consigliati:
- P.R. Murray, K.S. Rosenthal, M.A.Pfaller, “Microbiologia Medica”, ELSEVIER, 6° Ed., 2010.
- G.A. Antonelli, M. Clementi, G. Pozzi e Gian Maria Rossolini. Microbiologia Medica. Casa
editrice Ambrosiana, 2008
- M. La Placa: " Principi di Microbiologia Medica", 11° ed., Ed. Esculapio, Bologna, 2008.
Testi per consultazione:
- Fields, "Virology", Raven Press, 2007.
- Zuckerman "Principles and pratice of clinical virology" Wiley & Sons, 2009.
- Schaechter’s: Mechanisms of Microbial Disease. Lippincott Williams & Wilkins. 4° Ed., 2007.
- B.D. Davis, R. Dulbecco, H.N. Eisen,H.S. Ginsberg:"Microbiologia",Ed.Zanichelli, Milano, 1993.
9. Siti internet di interesse microbiologico e medico
http://www.who.int/en/ (OMS)
http://www.cdc.gov/az/a.html ( Centers for disease control and prevention)
http://pathmicro.med.sc.edu/book/welcome.htm
http://www.mycology.adelaide.edu.au/
http://www.microbiologybytes.com/video/
http://www3.niaid.nih.gov/healthscience/healthtopics/default.htm (NIH, NIAID)
http://www.ictvonline.org/index.asp?bhcp=1 (International Committee on Taxonomy of Viruses)
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/Images/index.htm
http://www.virology.net/ (All the virology on the web)
http://www.doctorfungus.org/index.htm
10. Siti internet per le ricerche bibliografiche
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez
http://scholar.google.com/
11. Orario di ricevimento dei docenti del Corso Integrato:
per appuntamento
Franco Busolo
[email protected]
Riccado Manganelli
[email protected]
Antonella Caputo
[email protected]
Arianna Calistri
[email protected]
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