Sistemi Vegetali Modello per lo Studio degli Stress Abiotici c o r s formazione GenHORT Stress Stress PERCEZIONE DEL SEGNALE TRASDUZIONE DEL SEGNALE ESPRESSIONE GENICA PRODOTTI GENICI Durata PROTEINE FUNZIONALI PROTEINE DI TRASPORTO BIOSINTESI DI OSMOLITI CHAPERONINE PROTEINE LEA PROTEASI ENZIMI DETOSSIFICANTI PROTEINE REGOLATRICI FATTORI DI TRASCRIZIONE (MYB, MYC7 PROTEIN CHINASI (MAPK,MAPKK,CDPK) FOSFOLIPASI PROTEINE RNA-binding Intensità Omeostasi Adattamento c o r s formazione GenHORT Danni irreversibili Specie di interesse agrario - riso, orzo, grano - patata, tabacco, pomodoro - vite, olivo SISTEMI MODELLO - Lievito - Arabidopsis thaliana - Thellungiella halofila - Oryza sativa c o r s formazione GenHORT Arabidopsis thaliana Sequenziamento completo del genoma Facile da coltivare in vivo ed in vitro ciclo biologico in 6-8 settimane 30-60 semi per siliqua, ca 5000 per pianta) c o r s formazione GenHORT Trasformazione Genetica Arabidopsis thaliana A. thaliana ha un genoma molto piccolo, ma rappresentativo delle principali funzioni geniche delle specie di interesse agrario 16000 Mb 125 Mb Arabidopsis thaliana c o r s formazione GenHORT 950 Mb pomodoro S. lycopersicum 1900 Mb patata Solanum tuberosum grano tenero Triticum aestivum Arabidopsis thaliana: tools Sequenziamento Genoma Completo (AGI, 2000) Tool bioinformatici (Genevestigator, Athena, Atpid) Librerie di cloni genomici c o r s formazione GenHORT Collezione di Mutanti (T-DNA, RNAi, Activation Tagging) Arabidopsis thaliana Svliluppo di chip microarray e analisi di espressione genica high-throughput Stadi di Sviluppo Stress Termici Agenti Biotici Stress Salini Trattamenti Ormonali Locus: At5g56010 c o r s formazione GenHORT Arabidopsis thaliana: gain of funcion Collezione di mutanti Activation tagging Vettori con enhancer L’inserimento del T-DNA determina la sovraespressione di geni a valle dell’inserzione c o r s formazione GenHORT Trasferimento del T-DNA in pianta Arabidopsis thaliana: loss of funcion Collezione mutanti knockout: repressione totale dell’espressione genica LP 5I UTR 1 GENE 182 302 LBa1 3’ UTR 1068 RP 1267 INSERZIONE T-DNA LB RB Collezione mutanti knock-down: repressione parziale dell’espressione genica c o r s formazione GenHORT Arabidopsis thaliana Ricerca di mutanti nel gene di interesse in popolazioni già indicizzate c o r s formazione GenHORT Diverse popolazioni di mutanti ready-to-screen sono già disponibili Thellungiella halophila SINONIMI: salt cress, Thellungiella salsuginea. Alta similitudine (90-95%) con Arabidopsis Tollera condizioni estreme di freddo, siccità e salinità (Bressan, 2001) Sono disponibili li brerie BAC, ESTs e librerie cDNA full-lenght Arabidopsis (4 settimane) c o r s formazione GenHORT Thellungiella (6 settimane)