Genetica e Citogenetica Umana e Laboratorio di Genetica e Citogenetica Umana 4 CFU lezioni + 1 CFU Laboratorio Frequenza non obbligatoria Obiettivi formativi del corso Il corso si propone di fornire le conoscenze fondamentali per l'analisi genetica nell'uomo, attraverso lo studio della trasmissione dei caratteri e la caratterizzazione delle mutazioni geniche e cromosomiche e delle patologie ad esse associate, ed illustrare i principali metodi citogenetici e molecolari per la diagnosi pre e post natale. Syllabus Malattie genetiche monogeniche, modelli di trasmissione, eredità nucleare e citoplasmatica, alterazioni del cariotipo, analisi di segregazione e di linkage, malattie multifattoriali, suscettibilità genetica alle malattie, diagnosi molecolari e citogenetiche. Programma dettagliato del corso Lezioni: Malattie genetiche. Relazione tra stato di salute e costituzione genetica. Difetti genetici monogenici, oligo- e poligenici, difetti del corredo cromosomico e del genoma mitocondriale. Le condizioni multifattoriali. L’eterogeneità genetica e le fenocopie. Interpretazione degli alberi genealogici. Complicazioni dei principali modelli di eredità. L’eredità autosomica recessiva. La fibrosi cistica. L’espressività variabile. Struttura e funzione del gene CFTR. L’eterogeneità allelica. Effetto delle mutazioni del gene CFTR. Distribuzione geografica delle mutazioni del gene CFTR. L’analisi di segregazione per valutare un modello di eredità autosomica recessiva. Vizi di accertamento. L’eredità autosomica dominante. La corea di Huntington. Penetranza incompleta. L’esordio tardivo. L’anticipazione. Origine e conseguenze delle mutazioni per espansione di triplette ripetute. L’eredità dominante legata all’X. L’eredità recessiva legata all’X. L’emofilia. La distrofia muscolare di Duchenne e di Becker. Le mutazioni per delezione parziale del gene della distrofina. Inattivazione del cromosoma X nella donna e mosaicismo. Sindrome di Martin-Bell (o dell’X-fragile). Evidenza citologica e interpretazione molecolare. L’eredità mitocondriale. Origine e conseguenze delle mutazioni del genoma mitocondriale. Eteroplasmia. Le malattie mitocondriali. Componente genetica nucleare e mitocondriale. Alterazioni del numero di cromosomi. Aneuploidie autosomiche e dei cromosomi sessuali. Meccanismi di formazione e conseguenze delle aneuploidie. Mosaicismo. Origine parentale delle aneuploidie. Incidenza negli aborti e nei nati vivi. Sindrome di Down. Incidenza, prevalenza e attesa di vita.Correlazione con l’età della madre. Sindrome di Turner. Sindrome di Klinefelter. Eteroploidie. Origini e conseguenze. Alterazioni della struttura dei cromosomi. Meccanismi di insorgenza e conseguenze. Fattori predisponenti. Delezioni. Sindrome del Cri du chat. Sindromi da geni contigui. Duplicazioni. Inversioni. Traslocazioni. Traslocazioni reciproche. Traslocazioni Robertsoniane. La sindrome di Down per traslocazione. Cromosomi ad anello, dicentrici, isocromosomi. Effetti sulla fertilità e sulla perdita dei prodotti del concepimento. Analisi di linkage e mappatura del genoma umano. Marcatori molecolari e clonaggio posizionale. Il metodo del “lod score”. Le famiglie CEPH e le mappe di riferimento. Le patologie complesse. Gli studi di correlazione tra parenti, tra gemelli e sugli adottivi. L’analisi di segregazione complessa. La mappatura del locus principale. Il cancro della mammella come esempio di predisposizione ereditaria al cancro. L’identificazione del gene BRCA1. Le malattie poligeniche. I modelli di interpretazione dei caratteri poligenici. Il modello di Fisher. Il modello di Falconer. La suscettibilità genetica alle malattie e i metodi di analisi di linkage non parametrici. I loci coinvolti nella sucettibilità al diabete e alla malattia di Alzeheimer. Laboratorio sperimentale - Metodi di studio della citogenetica. Tipi di mutazioni e tipi di cellule. Colture cellulari. Amniocentesi. Villocentesi. Tecniche di colorazione. Colorazioni differenzia li e bandeggio. Bandeggio ad alta risoluzione. Ibridazione in situ (FISH). Tipi di sonde. Sonde cromosomiche (chromosome painting). Ibridi cellulari, citofluorimetria e dissezione dei cromosomi metafasici. Analisi del cariotipo. Scelta della strategia di analisi. Indicazioni per l’analisi citogenetica in diagnosi prenatale e postnatale. L’analisi citogenetica nel monitoraggio biologico degli effetti mutageni ambientali. Le aberrazioni cromosomiche. Gli scambi tra cromatidi fratelli. Il micronucleo. Diagnosi genetiche molecolari. Scelta della strategia di analisi. Indicazioni per la diagnosi molecolare. Specificità e sensibilità dei test. Problemi tecnici, medici e etici connessi con i test genetici predittivi. La reazione a catena della DNA polimerasi (PCR). La tecnica PCR-ASO (oligonuclotidi allele -specifici)o ARMS (sistema di mutazioni refrattarie all’amplificazione) per l’analisi delle mutazioni puntiformi. La PCR per l’analisi di delezioni e di espansioni di triplette ripetute. I polimorfismi dei frammenti di restrizione (RFLP). La diagnosi indiretta di loci associati a RFLP. Diagnosi diretta di mutazioni con RFLP. I saggi basati sulla chemioluminescenza e sulla fluorescenza. La tecnica PCR-OLA (saggio di ligazione degli oligonucleotidi). La tecnica del faro molecolare. I sistemi multiplex. La tecnica PTT (proteina troncata). Analisi completa delle mutazioni sconosciute: SSCP (polimorfismo della conformazione dei filamenti singoli), DGGE (elettroforesi su gel in gradiente denaturante), CMC (taglio chimico degli eteroduplex).e EMC (taglio enzimatico degli eteroduplex), Microarray o chip a DNA, il sequenziamento del DNA. Argomenti da conoscere per poter frequentare efficacemente il corso E’ consigliabile che lo studente abbia acquisito le conoscenze di base di Genetica, di Biochimica e di Biologia Molecolare e che frequenti anche gli altri corsi del primo semestre del terzo anno, i cui contenuti sono integrativi rispetto al corso. Bibliografia Sudbery - Genetica Molecolare Umana - Zanichelli 2000 Altri testi Strachan e Read - Genetica Umana Molecolare - UTET McConkey - Genetica Umana. Una prospettiva Molecolare - Zanichelli Prove di verifica dell’apprendimento L’acquisizione dei CFU è tramite prova orale. Dati del docente Nome: Rossi Anna Maria Dipartimento: Dipartimento Scienze dell'Uomo e dell'Ambiente- Genetica Telefono: 050-836236/836219 E- mail: [email protected] Pagina web: Orario di ricevimento: su appuntamento telefonico Luogo di ricevimento:Via S.Giuseppe 22 Pisa