Chimica-Fisica dei sistemi biologici. Crediti 6, ore C. La Rosa

Chimica-Fisica dei sistemi biologici. Crediti 6, ore
C. La Rosa
Richiami di termodinamica, cinetica e spettroscopia, struttura dell’acqua
liquida, effetto idrofobico, cristalli liquidi.
Differential Scanning Calorimetry: Principi, applicazioni alle transizioni
conformazionali.
Dicroismo Circolare: Principi, applicazioni alla determinazione delle
strutture secondarie delle proteine.
Termodinamica statistica: Fattore di Boltzman, probabilità di un sistema,
funzione di partizione.
Dinamica Molecolare: Principi, force field, AA-MD, CG-MD, SMD,
REMD, TI-MD, FEP-MD, analisi dati.
NMR stato solido: Principi, Spinning Magic Angle, 31P e 2H.
ESR: Principi, Spin-label.
Diffrazione di raggi-X: Principi, determinazione della struttura
tridimensionale di proteine.
Trasformata di Fourier: Proprietà della TF e anti TF, applicazioni alle
spettroscopie NMR e IR e alla diffrazione a raggi-X.
Membrane biologiche: fosfolipidi, monolayer e bilayer e fenomeni di
self-assembling, struttura di bilayer fosfolipidici, transizioni di fase gelcristallo liquido, caratterizzazione strutturale di bilayer, caratterizzazione
dinamica di bilayer fosfolipidici, membrane modello, caratterizzazione
spettroscopica e termodinamica di bilayer fosfolipidici.
Proteine: struttura e proprietà di amino acidi, legame peptidico, struttura
delle proteine, plot di Ramachandran, problema del folding, modello di
Lumry-Eyring, determinazione tridimensionale di strutture proteiche,
dinamica delle proteine, interazioni membrana proteina, caratterizzazione
spettroscopica e termodinamica di sistemi proteici.
Acidi Nucleici: struttura e proprietà di DNA e RNA, interazione con
piccole molecole, fasi liquido cristalline, sistemi modello,
caratterizzazione spettroscopica e termodinamica.
Esame: colloquio orale.